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HiFi-ST: High-Fidelity Reconstruction of Continuous Spatial Transcriptomic Expression Fields via Conditional Neural Fields

O HiFi-ST introduz um framework de campo neural condicional que reconstrói campos contínuos de expressão transcriptômica espacial ao modelar spots como observações regionais e integrar características teciduais multiescala, superando significativamente os métodos existentes em precisão e permitindo análises downstream avançadas, como a caracterização do microambiente tumoral.

Lei Tang, Wenshuai Han, Xiao Yang, Xiaozhou Chen, Huamei Li2026-07-16

🧬 biology

MaEIN2 links ethylene signaling to chlorogenic acid accumulation in mulberry leaves in response to silkworm-feeding

Este estudo demonstra que o componente de sinalização de etileno MaEIN2 medeia o acúmulo de ácido clorogênico induzido pela herbivoria em folhas de amoreira, ligando, assim, os sinais de alimentação do bicho-da-seda ao aumento da defesa da planta e potencialmente apoiando o desenvolvimento do bicho-da-seda.

Peihong Liu, Qingxin Yao, Guang Yang, Nan Chao, Mengqi Li, Hongyan Lin, Rongjun Fang, Li Liu2026-07-16

🧬 biology

Optimized Gradient Boosting Decision Tree Ensembles for Honeybee Toxicity Prediction Using the ApisTox Dataset

Este estudo demonstra que um conjunto de Árvores de Decisão de Gradient Boosting otimizado, enriquecido com meta-características específicas do domínio e representações moleculares, melhora significativamente a precisão da previsão de toxicidade em abelhas no dataset ApisTox em comparação com os benchmarks existentes.

Sedat GOLGİYAZ2026-07-16

🧬 biology

Global evolutionary pattern and distinct metabolic strategies of sulfur-cycling microorganisms across ecosystems

Este estudo introduz o DiSuCy, uma base de conhecimento curada de genes de metabolismo de enxofre, para revelar a dinâmica evolutiva e as estratégias metabólicas distintas de microrganismos que realizam o ciclo do enxofre em diversos ecossistemas, incluindo a identificação de novos táxons e vias não canônicas no oceano e no intestino humano.

Song-Can Chen, Tomohisa Tanabe, Chengliang Sun, Jing-Ling Yan, Xin-Yue Ren, Alexander Loy2026-07-16

🧬 biology

Seasonal Dynamics of Microbial Communities, Co-occurrence Networks, and Grazing-Mediated Carbon Flow Characteristics

Este estudo revela que as flutuações ambientais sazonais na Baía de Dinghai impulsionam mudanças paralelas na composição da comunidade microbiana, nos processos de montagem e na estrutura de rede, alterando simultaneamente a eficiência do fluxo de carbono mediado pelo pastoreio proveniente do fitoplâncton e do bacterioplâncton, com o fitoplâncton servindo consistentemente como a fonte dominante de carbono.

Guoqiang Shen, Qianqian Liu, Peng Xiao, Lianming Zheng, Chengxu Zhou, Zhongzhou Lin, Zhuoyi Zhu, Wenjing Zhang2026-07-16

🧬 biology

WATER: A Framework for Reconstructing Temporal Gene Expression Trajectories and Detecting Molecular Heterochrony Across Development and Disease

O artigo apresenta o WATER, um arcabouço computacional que reconstrói trajetórias independentes de expressão gênica temporal para detectar heterocronia molecular (atraso ou antecipação na expressão gênica) em contextos de desenvolvimento e de doenças, revelando uma reorganização transcricional generalizada que as comparações tradicionais baseadas em correspondência de estágios negligenciam.

Rahul Kanadia, Saren Springer, Kevon Afriyie, Abigail Boria, Isabella Stevens, Katarina Micin, Vanessa Aguiar-Pulido2026-07-16

🧬 biology

The organizing unit of GPCR activation-switch architecture: a phylogenetic-scale census

Este estudo revela que a arquitetura de comutação de ativação de GPCR não é organizada pela identidade do ligante, mas por uma rede estrutural coevolutiva envolvendo o bloqueio iônico, a Tyr5.58 e os resíduos do bolso de sódio, que utiliza mecanismos diversos e específicos de linhagem para estabilizar a arginina DRY conservada.

Huazhang Shen2026-07-16

🧬 biology

Integrated carrying capacity: A holistic approach towards population target setting for conflict-prone threatened wildlife

Este estudo propõe uma estrutura integrada de capacidade de carga que combina dimensões ecológicas, biológicas e sociais para estabelecer metas populacionais baseadas em evidências e específicas ao contexto para espécies ameaçadas propensas a conflitos, utilizando os elefantes asiáticos selvagens da China em Yunnan como um estudo de caso para defender a priorização da tolerância humana e o alinhamento das políticas de uso da terra com os objetivos de conservação.

Hao Gu2026-07-16

🧬 biology

A multi-tissue transcriptome and expression atlas of Astacus leptodactylus: assembly and annotation

Este estudo apresenta um atlas de expressão e transcriptoma multitecido de alta qualidade para o lagostim de garra estreita *Astacus leptodactylus*, montado a partir de 37 amostras de RNA-seq e validado quanto à completude funcional, estabelecendo assim um recurso fundamental para a pesquisa de canais iônicos e genômica funcional em crustáceos não modelos.

Berk Sağlam, Mehmet Akgun, Bora Ergin, Nuhan Purali2026-07-16

🧬 biology

A mechanistic framework for interspecific variation in vertebrate developmental radiosensitivity under chronic ionizing radiation

Este estudo propõe um quadro mecanístico unificado que explica a variação interespecífica na radiossensibilidade do desenvolvimento de vertebrados sob radiação ionizante crônica, integrando fatores como bioacumulação de radionuclídeos, taxa metabólica, blindagem anatômica e dinâmica proliferativa, com base em uma síntese estruturada de 20 estudos experimentais e 9 artigos.

Bogdan Dmirtievitch2026-07-16

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