Allelic and genotypic frequencies of polymorphisms associated with productive traits in cattle of the Sardo Negro breed of Mexico

Resumo Técnico: Frequências Alélicas e Genotípicas de Polimorfismos Associados a Características Produtivas em Gado Sardo Negro

Problema
A raça Sardo Negro é uma população de gado Zebu mexicano desenvolvida através de cruzamentos das raças Gyr e Indu-Brasil, reconhecida por sua adaptabilidade a ecossistemas tropicais e utilidade dupla (carne e leite). Apesar de seu estabelecimento como uma raça distinta com aproximadamente 50.000 animais registrados, há uma necessidade de caracterizar a arquitetção genética desta população em relação aos alelos associados a características economicamente importantes. Especificamente, compreender a distribuição de Polimorfismos de Nucleotídeo Único (SNPs) em genes que regulam o crescimento, a maciez da carne e a composição do leite é essencial para o delineamento de estratégias eficazes de seleção genética. Este estudo aborda a lacuna de conhecimento referente às frequências alélicas e genotípicas de polimorfismos funcionais específicos na população Sardo Negro no México.

Metodologia
O estudo analisou um rebanho de 80 bovinos Sardo Negro registrados na Associação Mexicana de Criadores de Cebus (AMCC), localizados em Comala, Colima, México. Amostras de sangue periférico foram coletadas e o DNA genômico foi extraído utilizando um kit comercial.

Os pesquisadores empregaram a Reação em Cadeia da Polimerase–Polimorfismo de Comprimento de Fragmento de Restrição (PCR–RFLP) para genotipar seis genes específicos conhecidos por influenciar características produtivas:

1. Hormônio do Crescimento (GH): Analisou o SNP g.2141C > G (associado ao ganho de peso diário).
2. Calpastatina (CAST): Analisou o SNP g.2959A > G (associado à maciez da carne).
3. µ-Calpaína (CAPN1): Analisou o SNP g.6545C > T (CAPN4751, associado à maciez da carne).
4. Kappa-Caseína (CSN3): Analisou o SNP g.88532332A > C (associado à proteína/gordura do leite e rendimento de queijo).
5. Beta-Lactoglobulina (β-LG): Analisou o SNP g.5305C > T (associado à concentração de caseína e gordura do leite).
6. Beta-Caseína (CSN2): Analisou o SNP c.245C > A (distinguindo as variantes A1 e A2, associadas à digestibilidade do leite).

A amplificação foi realizada utilizando primers específicos e perfis térmicos, seguida de digestão com enzimas de restrição (AluI, DdeI, HinfI ou HaeIII, dependendo do alvo). Os genótipos foram determinados via eletroforese em gel de agarose. As frequências alélicas e genotípicas foram calculadas pelo método de contagem direta.

Principais Resultados
O estudo identificou padrões distintos de variação genética nos seis loci:

• Hormônio do Crescimento (GH): A população foi monomórfica para o alelo L (frequência 1,00). O alelo favorável V, associado a maior ganho de peso diário em Bos taurus, estava ausente (frequência 0,00).
• Genes de Maciez da Carne:
  • CAST: O alelo favorável A (associado a maior maciez) foi detectado com uma alta frequência de 0,76. As frequências genotípicas foram 0,68 (AA), 0,18 (AG) e 0,15 (GG).
  • CAPN1: O alelo favorável C (associado a maior maciez) foi detectado com uma baixa frequência de 0,17. O alelo T foi predominante (0,83).
• Genes de Qualidade do Leite:
  • CSN3 (Kappa-Caseína): O alelo A foi altamente frequente (0,93), enquanto o alelo B (associado ao melhor rendimento de queijo em B. taurus) foi raro (0,07). Não foram encontrados homozigotos BB.
  • β-LG: O alelo B (associado a maior concentração de caseína e gordura do leite) foi predominante com uma frequência de 0,86.
  • CSN2 (Beta-Caseína): O alelo A2 estava quase fixado na população com uma frequência de 0,99. O alelo A1 era raro (0,01), e nenhum homozigoto A1A1 foi observado.

Significância e Alegações
Os autores concluem que a raça Sardo Negro possui um reservatório genético único moldado pela seleção local e suas origens Zebu. O estudo destaca uma dicotomia no potencial genético da raça:

1. Alta Frequência de Alelos Favoráveis: A raça exibe altas frequências de alelos favoráveis para a qualidade e segurança do leite (CSN2 A2, β-LG B) e maciez da carne (CAST A).
2. Limitações em Outras Características: As baixas ou ausentes frequências de alelos favoráveis em CAPN1 (maciez da carne), CSN3 (rendimento de queijo) e GH (crescimento) sugerem que a seleção atual para essas características específicas pode estar limitada pelo pool genético existente.

O artigo afirma que métodos de genotipagem rápidos e de baixo custo, como o PCR–RFLP, são ferramentas viáveis para monitorar essas populações. A principal significância do trabalho reside no fornecimento dos dados de base necessários para o delineamento de estratégias de acasalamento. Ao identificar as frequências atuais, os criadores podem implementar cruzamentos seletivos para aumentar a prevalência de haplótipos favoráveis (por exemplo, aumentando o alelo C em CAPN1 ou o alelo B em CSN3) para melhorar o desempenho de produção de carne e leite no gado Sardo Negro mexicano. Os autores não alegam que a melhoria genética imediata é garantida, mas enfatizam que a genotipagem é um pré-requisito para tais programas de seleção direcionada.