Rapid aging and disassembly of actin filaments from two evolutionary distant yeasts
该研究通过系统比较两种进化距离遥远的酵母与哺乳动物肌动蛋白的组装动力学,发现酵母肌动蛋白在老化过程中释放无机磷酸及解聚速度显著快于哺乳动物,且其组氨酸 73 位点缺乏甲基化是造成这一快速老化的主要原因,同时揭示了两种酵母肌动蛋白在解聚速率和机械柔性上的差异,表明肌动蛋白具有比预期更丰富的物种特异性生化特征。
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该研究通过系统比较两种进化距离遥远的酵母与哺乳动物肌动蛋白的组装动力学,发现酵母肌动蛋白在老化过程中释放无机磷酸及解聚速度显著快于哺乳动物,且其组氨酸 73 位点缺乏甲基化是造成这一快速老化的主要原因,同时揭示了两种酵母肌动蛋白在解聚速率和机械柔性上的差异,表明肌动蛋白具有比预期更丰富的物种特异性生化特征。
本研究利用小角 X 射线和中子散射技术,揭示了结核分枝杆菌 Mce 相关膜蛋白 Mam1A 的四级结构特征及其二硫键稳定性,并证实了 Mam1A-1D 与 LucA 能形成稳定的复合物,从而为阐明 Mce 复合物的组装机制及开发抗结核药物提供了重要基础。
本研究通过整合系统发育、结构生物学及生物物理手段,首次揭示了结核分枝杆菌氟喹诺酮耐药蛋白 MfpD 的 Roadblock/LC7 样二聚体结构及其通过非经典 Switch I 机制调控 MfpB GTP 水解的分子基础,从而阐明了该蛋白在巨噬细胞致病过程中的非催化作用机制。
MetaReact 是一种基于 Transformer 的端到端通用模型,通过整合结构感知编码与化学反应预训练,实现了对药物代谢酶、代谢产物及代谢位点的统一预测,显著提升了代谢产物识别与酶亚型预测的准确性,从而推动了药物设计与安全性评估的发展。
本研究利用高分辨率 PRISMA 技术结合定量质谱,成功绘制了 ARID1A 的相互作用图谱,不仅验证了已知结合,还鉴定了 SIN3A、TOX4、CDK2 和 CCNA2 等新互作蛋白,并揭示了 CDK2 磷酸化对 ARID1A 调控基因表达及细胞增殖的新机制。
该研究通过酵母双杂交筛选、生化分析、晶体结构解析及分子动力学模拟,阐明了胶原蛋白 VII 的 VWF A2 结构域通过识别 Met-Gly-芳香族氨基酸基序与三螺旋胶原蛋白结合的独特分子机制,揭示了其通过瞬时相互作用招募胶原纤维形成锚定原纤维的模型,并为理解相关皮肤脆性疾病提供了结构基础。
该研究开发了一种名为 MT-DS 的新型荧光探针,能够直接可视化微管晶格损伤,从而揭示了损伤在退火位点的富集现象,并证实了 kinesin-1{Delta}6 马达蛋白在运动过程中会主动产生新的晶格损伤。
该研究通过单核 RNA 测序揭示了肺动脉高压(PAH)通过诱导肝细胞和血管内皮细胞的 Warburg 样代谢重编程、肝星状细胞活化及特定炎症信号通路失调,从而引发独特的代谢性和炎症性肝病的分子机制。
该研究通过构建模拟 SLAP2 结合的 CBL 激活突变体并筛选出能诱导 CBL 激活的小分子化合物,证实了靶向激活 CBL 泛素连接酶可有效增强其底物泛素化及内吞作用,从而下调酪氨酸激酶信号通路。
该研究通过 AlphaFold2 预测与实验验证,发现 RfaH 亚家族中存在一类主要处于活性状态的单态同源蛋白,它们富集于毒力操纵子中,从而进一步支持了 RfaH 通过结构转变逐步演化以实现基因特异性调控的模型。
该研究通过开发 M2F 分析流程,对六种植物愈伤组织的代谢组进行了系统表征与功能注释,揭示了其富含抗氧化、抗衰老等生物活性代谢物的独特性,为植物干细胞在健康与化妆品领域的应用提供了科学依据。
该研究介绍了一种名为 Peptergent 的新型两亲性肽类方法,通过无去污剂提取和纯化技术克服传统去污剂的局限性,实现了从各类生物样本中稳定分离膜蛋白并直接用于结构解析和质谱分析。
本研究通过多维度的机制、结构与生化分析,揭示了 B12 依赖型自由基 SAM 酶 QCMT 在甲基转移过程中非协同的催化机制及其立体选择性控制原理,并发现其能催化包括非天然 C-甲基化修饰、肽链差向异构化及甘氨酸直接转化为 D-丙氨酸在内的多种新颖反应,从而确立了其作为安装非天然翻译后修饰的通用且多功能生物催化剂的地位。
该研究报道了一种基于人成纤维细胞生长因子 1(FGF1)改造的紧凑型融合标签 FLEX,它通过结构导向设计兼具增强蛋白稳定性与高亲和力肝素结合的特性,显著提升了难表达蛋白在大肠杆菌及哺乳动物细胞系统中的表达量、溶解度及纯化纯度。
该研究通过优化液液萃取与固相萃取纯化方法、改进针对 50 种不同植物激素的 HPLC 分离条件,并系统比较了三重四极杆 MRM 与 Q-TOF HRMS 两种质谱检测策略,建立了一套适用于微量样本及未知物种的综合性植物激素定量分析方案。
该研究利用 DNA 编码的液相糖芯片(LiGA)技术,成功量化了多种肠道细菌与天然及镜像糖类的结合谱,揭示了细菌对镜像糖的交叉手性识别能力,从而为理解肠道微生物定植机制及手性相互作用提供了新见解。
本文介绍了 HERCULES,这是一个基于深度学习的统一框架,通过整合蛋白质语言模型与理化特征模块,实现了在单残基分辨率下对 RNA 结合结构域的精准定位、全局结合倾向预测以及突变效应评估。
该研究开发了一种靶向 p300/CBP 的表观遗传双功能小分子 aTAG-2,其能在不同细胞背景下通过多种机制在超高效基因激活与快速转录程序崩溃(抑制)之间切换,证明了诱导邻近效应并不必然导致固定的功能结果。
该研究揭示了 UFMylation 修饰通过直接修饰丙酮酸脱氢酶复合物亚基 DLAT(K118 位点)并受去修饰酶 UFSP2 调控,从而激活丙酮酸氧化及线粒体代谢的新机制。
该研究评估了七种韩国重要森林树种种子的提取物,发现其具有物种特异性的抗氧化、抗炎、美白及抗癌等多重生物活性,表明这些在造林过程中产生的种子资源可作为可持续开发的多功能天然生物材料。