Opposing regulation by Rev1 of DNA polymerase zeta activity on damaged versus undamaged DNA
本研究揭示,Rev1 支架蛋白通过其进化保守的 N 端 M1 基序对 DNA 聚合酶ζ施加相反的调控作用,即在损伤 DNA 上刺激其活性,而在未损伤 DNA 上抑制其活性,该机制依赖于由 PCNA 协调形成的稳定 Rev1-聚合酶ζ复合物,对于在不改变总体自发突变率的情况下防止复杂突变至关重要。
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生物化学是探索生命分子语言的桥梁,它深入细胞内部,解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作,驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制,更为开发新药和定制疗法提供了关键线索,让抽象的微观世界变得具体可感。
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本研究揭示,Rev1 支架蛋白通过其进化保守的 N 端 M1 基序对 DNA 聚合酶ζ施加相反的调控作用,即在损伤 DNA 上刺激其活性,而在未损伤 DNA 上抑制其活性,该机制依赖于由 PCNA 协调形成的稳定 Rev1-聚合酶ζ复合物,对于在不改变总体自发突变率的情况下防止复杂突变至关重要。
本研究利用冷冻电镜揭示了预起始复合物组装过程中 CMGE 生物发生的结构机制,阐明了 Sld2 如何促进 GINS 招募、CMGE 二聚体分离以及滞后链的排出,从而建立双向复制叉。
本研究通过整合对称性分析与祖先序列重建,阐明了ZIP金属转运蛋白折叠的进化起源,揭示了具有明确门控机制的对称转运通路,并鉴定出调控金属转运及亚家族功能特异性的关键残基。
本研究揭示,在铜绿假单胞菌中,脂质载体MlaC的C端α螺旋充当构象开关,调控其与MlaD六聚体的相互作用并控制磷脂空腔的可及性,从而促进脂质转运。
本研究揭示,关键DNA修复酶APE1通过一种新颖的“移动金属离子”机制实现高催化效率,其中协调的Mg2+重定位与远端氢键网络使协同催化得以在不形成五价中间体的情况下进行,为设计癌症抑制剂提供了新见解。
本研究通过呈现粪肠球菌细胞溶素毒素的首个高分辨率冷冻电镜结构,阐明了其作用机制,揭示了其两个亚基如何形成有序管状组装体以破坏真核细胞和细菌细胞膜。
本文介绍了 FragDockRL,这是一个强化学习框架,它将模块组装与系留对接相结合,以高效探索受合成约束的化学空间,并为特定蛋白质靶点优先筛选出高分且结构多样的配体候选物。
这项研究揭示,金黄色葡萄球菌中经过新功能化且对金属具有灵活性的超氧化物歧化酶(camSOD)相较于其祖先的锰依赖性对应物,进化出了更高的结构稳定性以及更大、更难发生交换的核心,表明在该酶分化过程中,不同的生化特性经历了快速且同步的进化改变。
本研究建立了一种灵敏且无需标记的工作流程,能够从仅 25 µL 的人乳中定量硫酸软骨素二糖,克服了以往对样本体积的限制,从而使得从微克级样本(如新生儿抢救性采集样本)中进行糖胺聚糖谱分析成为可能。
本研究阐明了富含半胱氨酸的结构域(CRD)如何在 CRAF 和 ARAF 中通过不同的、亚型特异性的机制介导 RAS 招募及 RAF 自抑制的解除,从而为理解调控 MAPK 通路激活的生物物理原理以及 KRAS 靶向治疗的影响提供了新的见解。