Mechanism of phospholipid transport to the bacterial outer membrane by TAM.
该研究通过冷冻电镜、体内功能实验及脂质组学分析，揭示了 TAM 复合物通过 TamB 的 DUF490 结构域形成含脂质密度的β-桶状通道，将特定磷脂（如心磷脂）从内膜定向转运至革兰氏阴性菌外膜，从而维持外膜完整性并确立了 TamB 作为真核生物脂质转移蛋白进化原型的地位。
⚗️ Category
biochemistry
376 篇论文
Structures and molecular mechanisms of RAD54B in modulating homologous recombination
该研究通过冷冻电镜、生化及细胞实验揭示了 RAD54B 通过其 N 端结构域稳定 RAD51 核蛋白丝并促进链入侵，同时依赖 C 端 ATP 酶结构域介导 D 环形成，从而在分子和细胞水平上阐明其调控同源重组修复 DNA 双链断裂的关键机制。
Tracing Siderophore Precursors to Primary Metabolism for Ecological Applications
该研究通过建立“铁载体 - 单体 - 前体 - 代谢途径”分析框架，将铁载体生物合成与初级代谢相连接，并发现通过补充特定前体可增强有益菌*枯草芽孢杆菌*的铁载体产量及其对植物病原菌*青枯雷尔氏菌*的抑制作用，从而为靶向代谢干预以抑制病原菌提供了新策略。
Mapping Protein Occupancy on DNA with an Unnatural Cytosine Modification in Bio-orthogonal Contexts
该研究通过理性工程改造非 CpG 特异性 DNA 甲基转移酶，使其能够催化引入生物正交的 5-羧甲基胞嘧啶修饰，从而建立了一种兼容主流检测技术的新方法，实现了对 DNA 上蛋白质占据状态与表观遗传修饰的单分子并发映射。
Cryo-EM structures and structure-guided design of Atlas virus capsids
该研究鉴定了线虫中一种新型内源性病毒——Atlas 病毒，通过冷冻电镜解析了其衣壳结构并指导工程化改造，揭示了其独特的组装与释放机制，使其成为优于现有系统的 RNA 疗法递送载体。
FIKK1, a member of the FIKK kinase family, phosphorylates VAR2CSA and regulates adhesion of Plasmodium falciparum-infected erythrocytes to the placental receptor CSA
该研究证实疟原虫激酶 FIKK1 通过磷酸化 VAR2CSA 蛋白增强其与胎盘受体的结合，从而调控感染红细胞在胎盘的滞留，表明 FIKK1 是治疗胎盘疟疾的潜在药物靶点。
Cell-specific isotope labeling identifies myo-inositol transfer between neurons and oligodendroglia to support myelin repair
该研究通过开发一种利用工程化神经元特异性标记同位素示踪剂的技术，首次直接证实了神经元合成的肌醇通过SLC5A3转运体转移至少突胶质细胞前体细胞，从而促进其增殖分化并加速脱髓鞘后的髓鞘修复，为神经退行性疾病的治疗提供了新的代谢靶点。
N-terminal Chirality and Sequence Variations Modulate the Conformational Landscape of Amyloid-beta 42
该研究利用温度副本交换分子动力学模拟，揭示了 N 端手性翻转及序列突变（如 A2T、A2V 和 A2TCβ）不仅改变淀粉样蛋白β42 的构象景观，还通过影响中央疏水核心区域及热容特性，阐明其保护或致病效应与野生型集合的相似性密切相关，从而为阿尔茨海默病的治疗策略提供了新见解。
In silico evaluation of the effects of temperature on the affinity of the SV2C ligand UCB-1A to SV2 isoforms
本研究结合实验结合数据与分子动力学模拟，揭示了配体 UCB1A 对 SV2C 亚型具有温度不依赖性的结合特性，而对 SV2A 亚型则表现出显著的温度敏感性，其机制在于 SV2C 中独特的 Tyr298 与天冬酰胺形成的氢键增强了结合口袋的稳定性。
Enriched-GF: A Reproducible High-Yield Autologous Blood-Derived Growth Factor Method for Regenerative Medicine
该研究提出并验证了一种名为"Enriched-GF"的新型可重复方法，通过结合玻璃珠搅拌、冻融循环和钙离子刺激，实现了从自体血小板中高效、稳定地获取高浓度生长因子，显著优于现有的血小板裂解液和生长因子浓缩物制备工艺。
Rational design of a protein-protein interaction inhibitor that activates Protein Tyrosine Phosphatase 1B.
该研究通过理性设计一种源自 PTP1B 磷酸酪氨酸结合环的细胞渗透性多肽抑制剂，成功阻断了氧化态 PTP1B 与 14-3-3ζ复合物的相互作用，从而防止 PTP1B 被氧化失活并增强其活性，最终抑制了 EGFR 驱动型癌症细胞的增殖与存活。
Affinity purification contaminants identified by cryo-EM and mass spectrometry
该研究结合冷冻电镜与质谱分析，鉴定出在 HEK293 细胞亲和纯化过程中混入的两种人类蛋白污染物（hPCC 和 PRMT5:MEP50 复合物），以此强调了亲和层析树脂特异性对蛋白纯化的关键重要性。
A conserved isoleucine gates the diffusion of small ligands to the active site of NiFe CO-dehydrogenase
该研究通过定点突变证实，NiFe 一氧化碳脱氢酶中高度保守的异亮氨酸 563 位于气体通道内，其侧链的柔韧性而非大小决定了底物扩散与氧气抑制之间的权衡，且目前无法在不影响一氧化碳扩散的前提下单纯通过突变提高酶对氧气的耐受性。
Library docking for Cannabinoid-2 Receptor ligands
该研究利用 CB2 受体作为模板，通过针对极性残基的相互作用设计实现了亚型选择性配体的发现，并证实了从 26 亿分子全枚举库中筛选出的高亲和力激动剂在结构上与冷冻电镜数据高度吻合，且通过基于结构的优化显著提升了多个系列的活性。
A bifunctional H/ACA snoRNP mediates both pseudouridylation and rRNA scaffolding during ribosome assembly
该研究揭示了 H/ACA snoRNP snR37 兼具修饰与支架双重功能，其核心结构负责催化肽基转移酶中心关键尿苷的假尿苷化，而招募的 Upa1-Upa2 异二聚体与 Rbp95 蛋白则协同 Npa1 复合物稳定结合前体 60S 亚基并整合四个 rRNA 结构域，从而在核糖体组装早期阶段同时实现 rRNA 修饰与结构组织。
Cooperativity in E. coli Aspartate Transcarbamoylase is Tuned by Allosteric Breathing
该研究利用多种结构生物学技术揭示，大肠杆菌天冬氨酸转氨甲酰酶并非在两种构象间简单切换，而是通过类似“呼吸”的连续构象变化动态调节协同性，其中 CTP 和 UTP 通过压缩酶体增强抑制，而 ATP 和 GTP 通过扩张酶体解除抑制，从而实现了长程变构通讯。
The role of CYP3A-CYP2E1 interactions in activation of CYP3A enzymes by chronic alcohol exposure
该研究通过全球蛋白质组学和化学交联质谱分析发现，慢性酒精暴露虽未改变 CYP3A 酶的表达水平，但通过诱导 CYP2E1 与其形成物理复合物，显著增强了 CYP3A 酶的催化活性，从而加速了相关药物的代谢。
Inhomogeneous Tau polymerization, core-shell organization, and seed formation during Tau condensate aging
该研究揭示了 Tau 蛋白液滴在老化过程中通过内部质量的不均匀重组及分子构象转变，从弹性网络演变为具有核心 - 壳层结构的病理性淀粉样种子，且其多孔内部仍允许小分子进入，为靶向干预 Tau 聚集提供了新机制。
Decomap-seq enables efficient and reliable retrieval of spatial transcripts
该研究提出了名为 Decomap-seq 的新型空间转录组平台，通过采用独特的双链保护三片段（dsZ-X-Y）探针设计策略，有效克服了传统单链偶联方法导致的空间位阻与灵敏度瓶颈，实现了在组织原位高效、可靠地捕获高复杂度转录本。
Cell cycle-coupled CK1δ turnover, autoinhibition, and activity
该研究揭示了 CK1δ 的活性与丰度在细胞周期中受到协调调控：G1 期游离活性激酶被降解，S 期未组装激酶得以稳定以支持 DNA 损伤信号，而进入有丝分裂期后磷酸酶下调则通过促进自磷酸化和自抑制来保留激酶库，从而确保有丝分裂后稳态的快速重建。