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生物化学是探索生命分子语言的桥梁，它深入细胞内部，解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作，驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制，更为开发新药和定制疗法提供了关键线索，让抽象的微观世界变得具体可感。

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以下是该领域从 bioRxiv 精选的最新研究成果，欢迎查阅。

本研究利用遗传密码扩增技术在酵母 26S 蛋白酶体中引入了一种光交联非天然氨基酸，从而实现了对多种 ATP 依赖性蛋白质底物的体内捕获与质谱鉴定，并揭示了这些底物的图谱在内质网应激下是如何发生变化的。

本文提出了一种新颖的方案，通过阻断甘油三酯脂肪酶来扩大神经元脂滴的体积，从而克服了分离稀有神经元脂滴的挑战，以便进行蔗糖梯度纯化，进而实现详细的脂质组学分析，以推进对这些脂滴在神经退行性疾病中作用的理解。

本研究报告了对钴胺素依赖型自由基SAM酶BchE的成功分离与体外重组，从而实现了对其在细菌绿胶质厌氧生物合成过程中催化机制的首次详细表征。

UniFlow 是一个可扩展的正规化流（normalizing flow）框架，它统一了蛋白质构象系综生成与机器学习粗粒度力场，使单一的可微模型能够同时实现平衡分布的快速采样以及稳定的长时标分子动力学模拟。

本研究利用基于活性的蛋白图谱技术结合氟磷酸酯探针，构建了克氏锥虫（*Trypanosoma cruzi*）丝氨酸组的全面化学蛋白质组图谱，识别出37种参与脂质代谢和宿主-病原体相互作用的活性丝氨酸水解酶，旨在为未来的抗寄生虫药物研发提供便利。

这项研究表明，红藻黄杆菌（*Rhodobacter capsulatus*）基因转移载体中可脱落的尾刺蛋白 TspA 是一种强效的生物膜降解酶，它通过实现对复杂微生物胞外基质的穿行，从而促进水平基因转移。

这项研究揭示了 TnpB 有限的基因组编辑活性源于其无法高效地将 DNA 解旋为稳定的开放状态，并证明了一种优化变体（Ymu1-WFR）通过稳定特定的解旋中间体，增强了体外切割和植物基因组编辑的能力。

本研究表明，分子胶降解剂 EM12-FS 通过在 His353 位点共价重塑 cereblon (CRBN)，从而创造出一个能够实现新底物 NTAQ1 选择性招募与降解的新型非规范界面，进而通过位点特异性的合成修饰扩展了诱导邻近药理学的范畴。

这项研究揭示了利福霉素 B 抑制耐利福平 RNA 聚合酶的结构基础，证明了其独特的 C-4 O-羧甲基与酶形成了稳定的盐桥，从而绕过了常见的耐药突变，进而为理性抗生素设计确定了一个新靶点。

本文采用 murburn 框架和定量建模，旨在论证从生物膜到生命诞生的水合细胞外聚合物相，作为一种在进化上保守的、发生相分离的基质，通过调节随机扩散的反应性物种，在实现氧气利用的同时，维持生物相干性并促进复杂的生命过程。