Uncovering Functional Distant Mutations by Ultra-High-Throughput Screening of Dehalogenases
该研究利用超高通量荧光液滴分选技术，通过引入大体积荧光底物对卤代烷脱卤酶 LinB 进行筛选，成功发现了位于催化中心远端的突变体，揭示了这些突变通过增强结构域柔性或重塑底物通道来优化酶动力学特性及底物选择性的动态适应机制。
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376 篇论文
Chiral methionine oxidation reagents reveal stereospecific proteome modifications
该研究开发了一对映体氧杂氮杂环丁烷试剂，系统鉴定了蛋白质中可被特异性还原酶逆转的 (S)-和 (R)-甲硫氨酸氧化位点，并揭示了 (R)-甲硫氨酸氧化通过变构抑制双苯基水解酶样蛋白功能进而放大蛋白质 N-同型半胱氨酸化修饰的机制。
Integrative Structural Modeling of Intrinsically Disordered Regions in a Human HDAC2 Chromatin Remodeling Complex
该研究通过整合实验交联数据与多种计算建模技术，成功构建了包含固有无序区域的 HDAC2:MIER1:MHAP1 复合物结构模型，揭示了 MHAP1 的 C 端无序结构域在介导复合物组装中的关键作用，并证明了单一依赖 AlphaFold 等方法在解析此类动态复合物时的局限性。
Structural, biophysical, and virological mechanistic characterization of HIV-1 capsid-targeting antivirals
本研究通过修饰 PF74 的 R1 和 R3 位点，成功开发出比原化合物具有更强抗病毒效力、更高稳定性及更紧密结合能力的 HIV-1 衣壳靶向药物，为未来临床用药的设计提供了关键见解。
A comparative investigation of the mannose binding interface in DC-SIGN and MRC1 carbohydrate recognition domains with all-atom molecular dynamics simulations
该研究利用全原子分子动力学模拟，对比分析了 DC-SIGN 与 MRC1 受体中甘露糖结合界面的相互作用，揭示了 MRC1 因存在 DC-SIGN 无法达到的特定结合态而具有更高亲和力，从而为设计针对视网膜母细胞瘤的选择性甘露糖配体药物提供了关键见解。
Multi-Objective Engineering of Fibrin-Selective Thrombolytic Proteases with Enhanced Biocatalytic Efficiency and Inhibition Resistance
该研究提出了一种结合计算机辅助设计、进化重建与文献指导突变的多目标酶工程策略，成功开发出兼具高纤维蛋白选择性、强抑制抵抗性及优异溶栓疗效的新型血栓溶解酶 Brnoteplase，显著提升了治疗效果并降低了出血风险。
Discovery of a FANCD2-interacting protein motif (DIP-box) linking DNA Damage Response processes
该研究揭示 FANCD2 通过其保守的酸性区域识别并结合含有 DIP-box 基序的多种 DNA 修复相关蛋白，从而确立了 FANCD2 作为协调 DNA 交联修复、组蛋白修饰及 RNA 加工等过程的关键蛋白互作枢纽。
Strand-independent degradation of uncoupled forks by EXO1 activates ATR and restrains synthesis
该研究利用非洲爪蟾卵提取物揭示，EXO1 酶独立降解解偶联复制叉的滞后链（5'端）而非前导链（3'端），这一过程对于激活 ATR 检查点信号和限制复制叉推进至关重要。
Structural and cellular insights into the inhibition of the drug efflux activity of the HEDGEHOG receptor PATCHED1
该研究通过解析 PTCH1 受体与抑制剂 PAH 的冷冻电镜复合物结构，揭示了 PAH 通过占据胆固醇结合位点并形成关键氢键来阻断 PTCH1 介导的药物外排功能，从而阐明其增强化疗药物疗效的分子机制并为下一代抑制剂设计提供了结构基础。
Structural dynamics between Argonaute-2 and CK1α promote target RNA release in microRNA-mediated silencing
该研究揭示了人源 Ago2 蛋白在 miRNA 介导的基因沉默中，通过 CK1α 诱导的 EI 结构域磷酸化与 PAZ 结构域构象变化（从闭合到开放）的协同动态机制，促使双链 RNA 解旋并释放靶标，从而实现 RISC 复合物的高效循环与持续沉默作用。
c-di-AMP inactivates a K+/H+ antiporter in Bacillus subtilis
该研究通过解析晶体结构和功能表征，发现第二信使 c-di-AMP 能以约 1 μM 的亲和力直接结合并抑制枯草芽孢杆菌中的 K+/H+ 逆向转运蛋白 CpaA，从而揭示了细菌渗透压调节机制比此前认知的更为复杂。
Highly Stable Mn(V)-Nitrido and Nitrogen-Atom Transfer Reactivity within a De Novo Protein
该研究通过从头设计的蛋白质支架成功稳定了高活性的高价锰 (V)-氮化物中间体，并利用其实现了具有对映选择性的催化氮原子转移反应（如氮丙啶化），从而突破了天然金属酶和小分子催化剂在稳定此类物种及拓展其反应性方面的局限。
Enhanced RNA Formation Under Amine-Rich Local Atmospheres from 2',3'- Cyclic Nucleotides
该研究通过实验与模拟发现，铵及烷基铵反离子能通过氢键作用、广义碱催化及维持无水环境，显著促进 2',3'-环核苷酸在模拟地质条件下聚合形成 RNA 寡聚体，暗示地下岩石中热解有机焦油产生的富氨气体可能推动了早期 RNA 的演化。
Hydration and hydrolysis define antibiotic resistance conferred by macrolide esterases
该研究通过结构、动力学及突变分析揭示了 Est 型大环内酯酯酶利用水笼介导的松散结合与不精确定位机制来决定底物特异性，从而阐明其赋予细菌大环内酯类抗生素耐药性的结构基础。
Plasmin-mediated cleavage of GPIbα contributes to breakdown of platelet-von Willebrand factor complexes
该研究证实纤溶酶通过切割 GPIbα而非 VWF 来破坏血小板-VWF 复合物，尽管这一机制在体外能解聚血小板凝集，但在体内对血栓性微血管病中复合物解离的贡献可能有限。
Structure of human aldehyde oxidase under tris(2-carboxyethyl)phosphine-reducing conditions
该研究通过用不含硫的还原剂 TCEP 替代会导致酶失活的 DTT，成功获得了人醛氧化酶（hAOX1）及其变体的高质量晶体，从而解决了结晶过程中的酶失活问题并为时间分辨晶体学等未来应用奠定了基础。
Quaternary structure and activity of glutamate dehydrogenase are regulated by reversible S-palmitoylation and mitochondrial acyl-protein thioesterases.
该研究揭示了谷氨酸脱氢酶（GDH）通过可逆的 S-棕榈酰化修饰（主要发生在 Cys55、Cys115 和 Cys197 位点）破坏其六聚体结构并抑制酶活性，而线粒体酰基蛋白硫酯酶（APT1 和 ABHD10）可逆转这一过程，从而确立了 S-棕榈酰化作为连接线粒体脂质代谢与 GDH 功能调控的新机制。
A human cell-free translation screen identifies the NT-2 mycotoxin as a ribosomal inhibitor that binds the peptidyl transferase center
该研究建立了一种基于人源裂解液的高通量无细胞翻译筛选平台，从中鉴定出真菌毒素 NT-2 是一种特异性结合人核糖体肽基转移酶中心并诱导其进入休眠状态的新型翻译抑制剂。
A crucial role for PIH1D1 in modulating p53 stability via the R2TP complex
该研究揭示了 PIH1D1 作为 R2TP 复合物的关键组分，通过不改变 p53 C 末端结构的方式识别并稳定 p53 蛋白，从而调控细胞周期并为癌症治疗提供了新的潜在靶点。
FoTO1 orchestrates Taxol biosynthesis through catalytic and non-catalytic mechanisms
该研究揭示了 FoTO1 蛋白通过催化 Taxadiene-(4),5-epoxide 转化为 Taxadien-5-ol 以及非催化性地组织 P450 酶复合物，在紫杉醇生物合成早期阶段发挥关键作用，从而显著提升其在植物和酵母中的产量。