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生物化学是探索生命分子语言的桥梁，它深入细胞内部，解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作，驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制，更为开发新药和定制疗法提供了关键线索，让抽象的微观世界变得具体可感。

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以下是该领域从 bioRxiv 精选的最新研究成果，欢迎查阅。

本研究利用高通量 SNAP DNA 结合阵列，在 6 碱基对分辨率下解析了上皮转录因子 GRHL2 的 DNA 结合特异性，明确了其核心基序、错配耐受性及侧翼序列的影响，并成功区分了基因组中 GRHL2 的直接结合与间接招募位点。

本研究通过整合生物信息学与单细胞测序分析，鉴定出与血管衰老相关的动脉粥样硬化核心基因（如 TNF、MMP9 等）及其在单核细胞和 T 细胞中的免疫驱动作用，并验证了其诊断价值及姜黄素等天然化合物的潜在治疗机制。

该研究通过整合有限蛋白水解质谱数据与分子模拟，揭示了酿酒酵母中天然纠缠导致的错误折叠蛋白在老化过程中积累，是驱动其蛋白质组发生年龄相关结构变化的重要机制。

本研究结合实验与分子动力学模拟，揭示了 SIRT1 蛋白 N 端无序区 Motif A 中 Ser27 的磷酸化（或模拟磷酸化）能诱导其折叠成有序结构，从而显著增强 SIRT1 的酶活性。

本文通过整合来自十种头足类动物的 141 个 Reflectin 序列，提出了一个扩展 Reflectin 结构域分类的理论框架，从而能够更准确地识别其序列多样性并促进未来的结构与功能研究。

该研究通过非靶向自下而上方法发现，结核分枝杆菌在缺氧、一氧化氮及巨噬细胞激活等应激条件下，利用未表征的 ATP 抓取酶 Rv1722 将积累的γ-氨基丁酸（GABA）与海藻糖偶联生成 GABA-海藻糖，从而揭示了一条该病原体应对宿主免疫压力、实现碳氮守恒的新型代谢适应途径。

该研究通过 X 射线晶体学和分子动力学模拟揭示了酰基 - 酶中间体的互变异构、动态变化及水合作用共同调控 OXA-48 酶对碳青霉烯类抗生素的降解效率，并阐明了活性位点细微结构改变（如 OXA-519 变体）如何进一步增强这些效应。

该研究表明，选择性激活雌激素受体β（ERβ）可通过重塑肝脏脂质代谢和调节酮体生成，有效改善去卵巢大鼠的代谢紊乱并防止脂毒性，为绝经后代谢管理提供了潜在的新策略。

该研究通过异源表达、结构鉴定及晶体学分析，发现并表征了由伯克霍尔德菌产生的新型磷霉素 Flavophos（2,4-二氧戊基膦酸），揭示了其独特的生物合成机制及其对核黄素合成关键酶（LS）的抑制作用，并证实了 LS 的表达可赋予细菌对该化合物的抗性。

本研究通过解析厌氧条件下类 C 型自由基 S-腺苷甲硫氨酸甲基化酶 NocN 的三组高分辨率 X 射线晶体结构并结合电子顺磁共振波谱分析，首次揭示了该类酶催化诺西肽生物合成中 MIA 桥接侧环形成的结构基础与催化机制，阐明了其利用双 SAM 分子进行氢原子提取及底物甲基化的关键步骤。