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生物化学是探索生命分子语言的桥梁，它深入细胞内部，解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作，驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制，更为开发新药和定制疗法提供了关键线索，让抽象的微观世界变得具体可感。

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以下是该领域从 bioRxiv 精选的最新研究成果，欢迎查阅。

本文提出了一种利用 mTurquoise2 和 SYFP2 荧光蛋白优化的基于 FRET 的连接酶检测方法，用于直接监测和筛选细菌 sortase 介导的连接反应，为开发改进的 sortase 酶及其底物提供了一种通用的高通量工具。

通过利用祖先序列重建技术，研究人员工程化改造了芳基丙二酸脱羧酶祖先，使其表现出显著优于现存酶的热稳定性、催化活性和立体选择性，从而克服了手性羧酸生产中的关键局限性。

本研究通过证明糖脂 MPIase 是预折叠蛋白依赖质子动力进行转运所必需的组分，报告了首次成功重建细菌 TAT 转运系统。

通过确定 tC19Z RNA 聚合酶核酶的 3.1 Å 冷冻电镜结构，研究人员发现了一种抑制活性的特定异位碱基配对相互作用，从而能够设计出成功的补偿突变，以加速核酶的延伸速率并推进以核苷酸为基础的自我复制这一目标。

本研究表征了三种 *Dysgonomonas gadei* GH172 阿拉伯呋喃糖苷酶截然不同的连接特异性和分歧的四级结构，同时开发了共价抑制剂和基于活性的探针，用以揭示其催化机制并实现在复杂生物样本中的选择性分析。

研究人员通过利用立体选择性化学酶促合成法来克服外消旋化问题，鉴定出了能够通过非依赖于mTORC1抑制的机制有效诱导Caco-2细胞发生自噬的特定2,5-二酮哌嗪立体异构体，凸显了立体化学和氨基酸侧链性质对其活性的关键作用。

本文介绍了 Peptergents，这是一种基于多肽的表面活性剂技术，它实现了用于天然膜蛋白质组学的完全无去污剂工作流，在成功保持膜蛋白的结构完整性、功能构象和脆弱组装体的同时，增强了肽信号强度并富集了特定代谢网络，以用于下游的 LC-MS/MS 分析。

本研究表明，由 Vps34 合成的酵母液泡 PI(3,4,5)P3 对于液泡融合至关重要，它通过协调顶点组装并保留 SNARE 蛋白 Vam7 以促进反式 SNARE 配对。

本研究通过结合生物信息学、动力学和结构分析，鉴定并表征了巴氏梭菌（*Clostridium pasteurianum*）中一种此前未被注释的孢子形成相关蛋白为功能性铁氧还蛋白-NADP+还原酶，揭示了其独特的结构特征、较低的催化效率以及在芽孢形成过程中通过氧化还原调节发挥的潜在作用。

这项研究揭示了 Rubicon 通过由 UVRAG 诱导的 BECN1 BARA 结构域构象变化，从而选择性抑制 PI3KC3-C2 复合物的结构机制，并证明破坏这一特定相互作用足以使自噬和溶酶体功能恢复到与 Rubicon 基因缺失相当的水平。