High Resolution Multi-Pass Astral Analyzer Quantification Enables Highly Multiplexed 35-Plex Tandem Mass Tag Proteomics

该研究开发了一种基于 Thermo Scientific Orbitrap Astral 质谱仪的多次通过(Multi-Pass)高分辨率模式,通过结合宽质量范围扫描与针对 TMT 报告离子的超高分辨率扫描,成功实现了 35 重标记的蛋白质组学深度定量分析,其分析深度和定量精度均优于现有主流方法。

Stewart, H., Shuken, S. R., Rathje, C. + 24 more2026-02-26⚗️ biochemistry

Correspondence on "Fortification of FeS Clusters Reshapes Anaerobic CO Dehydrogenase into an Air-Viable Enzyme ThroughMultilayered Sealing of O2 Tunnels"

该论文通过蛋白膜电化学技术复现并深入表征了相关突变体,反驳了 Kim 等人关于 A559W 和 A559W/V610H 突变能显著增强一氧化碳脱氢酶抗氧能力的结论,指出这些突变体实际上并未表现出比野生型更强的耐氧性。

Opdam, L. V., Gebhardt, P., Leger, C. + 2 more2026-02-26⚗️ biochemistry

Dimerization of MilM is essential for catalyzing the pyridoxal-5'-phosphate (PLP)-dependent Cγ-hydroxylation of L-arginine during mildiomycin biosynthesis

该研究通过生物化学、结构建模及分子动力学模拟,揭示了温和霉素生物合成途径中的 PLP 依赖性酶 MilM 以同源二聚体形式发挥 L-精氨酸 Cγ-羟基化作用,其活性依赖于跨单体残基对辅因子及底物的稳定,并受一种独特的二聚体介导的“跷跷板”式交替盖机制调控,从而阐明了该酶催化反应中底物结合、催化机理及产物生成的分子基础。

Das, S., Naik, Y., Mishra, U. + 4 more2026-02-26⚗️ biochemistry

Chemical Maturation Controls Bioavailability of Fetuin-A-Mineral Complexes in Biomineralization

该研究通过多种技术手段揭示, Fetuin-A 矿化复合物存在由不可逆化学成熟过程决定的功能分化状态:化学不稳定的小分子单体可直接矿化胶原纤维,而化学成熟的初级颗粒则需经细胞摄取和溶酶体处理才能释放矿物质,从而确立了纳米级化学成熟作为区分矿物质运输与矿化过程的关键控制点。

Schaart, J. M., Rutten, L., To, S. V. + 6 more2026-02-25⚗️ biochemistry

Discovery of cephalotaxinone enzymes reveals a whole plant model for homoharringtonine biosynthesis

该研究利用非靶向代谢组学与转录组学技术,在无需预先知晓中间体和基因的情况下,成功解析了从根尖合成的 cephalotaxinone 到三尖杉酯碱(HHT)核心骨架的近乎完整的生物合成途径,并揭示了涉及七种中间体和六种新酶(包括非典型 P450 等)的“全植物协同”生物合成模型。

Dho, Y., Smith, K., Sattely, E. S.2026-02-25⚗️ biochemistry

Breaking Barriers: Transitioning from X-ray Crystallography to Cryo-EM for Structural Studies

本文阐述了实验室从 X 射线晶体学转向冷冻电镜技术解析染色质调节因子 ATAD2B 结构的完整工作流程,详细总结了克服蛋白表达纯化及样品制备挑战的策略、数据处理方法以及模型构建验证的最佳实践,为结构生物学家采用冷冻电镜研究大型柔性蛋白复合物提供了实用指导。

Zafar, H., Malone, K. L., Singh, A. K. + 2 more2026-02-25⚗️ biochemistry

Resurrecting Full-length Ancestral Schizorhodopsins and Heliorhodopsins with Structure-guided, Indel-aware Sequence Reconstruction

该研究通过结合结构一致性比对与显式插入缺失(indel)感知优化,成功重建并复活了具有完整长度且能在大肠杆菌中稳定表达的全长祖先裂解视紫红质和螺旋视紫红质,证明了该方法能有效解决跨膜蛋白祖先序列重建中的移码与结构不确定性难题。

Ishikawa, H., Mizutani, Y.2026-02-24⚗️ biochemistry

Change in topological linking number during Xer recombination at the plasmid pSC101 psi site

该研究通过实验测定证实,Xer 重组酶在质粒 pSC101 psi 位点介导的重组反应会导致拓扑链接数增加 4(ΔLk = +4),这一结果支持了该反应通过反平行位点排列和 Holliday 连接体中间体进行的机制模型,即四个负超螺旋被转化为连接体节点从而为反应提供能量驱动力。

Provan, J. I., Tomatcheva, A. O., Sherratt, D. J. + 1 more2026-02-24⚗️ biochemistry

Purified Zymogens Reveal Mechanisms of Snake Venom Metalloproteinase Auto-Activation

该研究通过引入阻断活性位点的原肽结构域,成功利用杆状病毒/昆虫细胞表达系统制备了所有三类蛇毒金属蛋白酶(SVMP)的重组酶原,解决了其细胞毒性难题,并阐明了其在锌离子诱导下的自动激活机制及功能特性,为蛇毒治疗药物的开发提供了通用平台。

Hall, S., Cardoso, I. A., Wilkinson, M. C. + 15 more2026-02-23⚗️ biochemistry