Flux organizations and control modes in antagonistically combined negative feedback loops
该论文通过研究由两个拮抗积分控制器组成的负反馈系统,揭示了根据设定值关系产生的委托控制、隔离控制及亚稳态控制等调节模式,并解释了西伯利亚仓鼠体重光周期调节及血糖稳态等生物现象。
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生物化学是探索生命分子语言的桥梁,它深入细胞内部,解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作,驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制,更为开发新药和定制疗法提供了关键线索,让抽象的微观世界变得具体可感。
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该论文通过研究由两个拮抗积分控制器组成的负反馈系统,揭示了根据设定值关系产生的委托控制、隔离控制及亚稳态控制等调节模式,并解释了西伯利亚仓鼠体重光周期调节及血糖稳态等生物现象。
该研究通过全原子分子动力学模拟揭示了 RY785 与四乙铵(TEA)抑制 Kv2 钾通道的不同分子机制:TEA 结合于孔道轴心直接阻断离子流,而 RY785 则通过非轴心结合稳定并封闭半开放门控状态,从而在允许离子流动的同时抑制通道功能。
该研究开发了一种高通量 ELISA 检测方法,证实了药物 lumacaftor 能够选择性地抑制在炎症氧化条件下被激活的血管性血友病因子(VWF),从而为开发仅在炎症状态下起效且降低出血风险的抗血栓药物提供了新策略。
该研究通过实验测定证实,Xer 重组酶在质粒 pSC101 psi 位点介导的重组反应会导致拓扑链接数增加 4(ΔLk = +4),这一结果支持了该反应通过反平行位点排列和 Holliday 连接体中间体进行的机制模型,即四个负超螺旋被转化为连接体节点从而为反应提供能量驱动力。
该研究通过解析 SLC10 家族钠依赖性胆酸转运蛋白(ASBT)的多种构象晶体结构并结合分子动力学模拟,揭示了其通过 TM6 柔性螺旋封闭出口从而避免形成贯穿孔道的转运机制,并阐明了膜脂与疏水甾醇基团的相互作用在底物结合与转运中的关键作用。
该研究开发了名为 RIPUP 的快速组蛋白翻译后修饰分析平台,通过结合 Arg-C Ultra 和 r-胰蛋白酶等替代蛋白酶与 TMT 标记技术,将样本制备时间从数天缩短至数小时,显著提升了 PTM 的覆盖范围(特别是揭示了以往难以检测的琥珀酰化和戊二酰化位点)及定量准确性,并成功应用于大鼠海马组织样本以加速表观遗传机制的发现和药物靶点验证。
该研究鉴定出一种由替代开放阅读框编码的保守微蛋白 AltSLC35A4,它通过与肌动蛋白 - 肌球蛋白系统相互作用,在独立于 mtDNA 复制和线粒体膜电位的情况下调控线粒体 DNA 的拷贝数及核小体的空间分布。
该研究通过比较三种数据分析方法,发现采用包含二聚化和配体结合机制的酶动力学模型能最准确地预测 MERS 冠状病毒主蛋白酶抑制剂在细胞内的效力,从而为抗病毒药物研发提供了更可靠的数据分析策略。
该研究揭示了酿酒酵母中 Rpd3 组蛋白去乙酰化酶复合物(尤其是 Rpd3L)作为代谢守门人,通过营养信号动态调控启动子处的组蛋白去乙酰化与转录重编程,从而确保细胞在代谢转换过程中维持转录保真度并解决 HDAC 富集于活跃启动子的长期悖论。
本研究鉴定出 4,5,6,7-四溴 -1H-苯并三唑(TBB)是一种特异性抑制 MESH1 的小分子化合物,其通过阻断 MESH1 活性有效抑制铁死亡,并在体外细胞模型及阿尔茨海默病脑切片模型中展现出神经保护作用。