Conformational Diversity and Interaction Signatures of NADH across protein families
本研究基于 345 个 NADH-蛋白复合物晶体结构,通过描述符驱动策略系统揭示了 NADH 在不同蛋白家族中的构象多样性与相互作用特征,确立了连接其形状、结合模式及蛋白环境的统一生物物理框架,为辅酶工程及靶向抑制剂设计提供了理性依据。
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本研究基于 345 个 NADH-蛋白复合物晶体结构,通过描述符驱动策略系统揭示了 NADH 在不同蛋白家族中的构象多样性与相互作用特征,确立了连接其形状、结合模式及蛋白环境的统一生物物理框架,为辅酶工程及靶向抑制剂设计提供了理性依据。
该研究通过建立基于液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)的 IGF1 参考物质及年龄相关参考区间,验证了参考物质的互换性并成功实现了不同免疫分析方法间的标准化,从而显著降低了检测结果的变异。
该研究利用活性导向蛋白谱技术绘制了小麦病原真菌*Zymoseptoria tritici*的共价配体可及性图谱,发现了一种能特异性靶向该菌 SAR1 GTPase 中保守且受限的半胱氨酸的立体选择性探针,通过干扰 COPII 组分积累抑制真菌生长,从而为开发新型抗真菌药物提供了关键靶点。
该研究通过解析 1.69 Å 分辨率的晶体结构,揭示了 Pyranose 氧化酶 H158Y 突变体中酪氨酸残基因特定构象及与 Lys79 的氢键作用而无法形成共价 FAD 连接,从而导致其催化活性显著降低的分子机制。
该研究通过经典与 QM/MM 分子动力学模拟,揭示了剪接体抑制剂 Spliceostatin 如何通过诱导 PHF5A 锌指结构局部变形、生成高反应性硫醇盐以及利用 Asp34-Lys29 质子中继机制,实现其环氧环开环并与 Cys26 发生共价结合的完整分子机理。
该研究提出了集成 23 种开源工具并包含两项创新方法(Func-e 和 Oligopoolio)的 Enzyme-tk 统一流程,成功用于发现针对 DEHP 和 TPP 等污染物降解的具有高热稳定性等新特性的未知酶活性。
该研究揭示了凝聚蛋白 II 通过其 NCAPD3 亚基的自抑制尾部维持非活性状态,而 M18BP1 蛋白通过竞争性结合解除该抑制并直接增强 DNA 锚定,从而以双重机制激活凝聚蛋白 II 以启动有丝分裂染色体的组织。