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生物化学是探索生命分子语言的桥梁，它深入细胞内部，解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作，驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制，更为开发新药和定制疗法提供了关键线索，让抽象的微观世界变得具体可感。

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以下是该领域从 bioRxiv 精选的最新研究成果，欢迎查阅。

该研究通过全原子分子动力学模拟揭示，阴离子表面活性剂 SDS 通过疏水相互作用显著破坏带正电 Trp-cage 蛋白的折叠稳定性，而阳离子表面活性剂 CTAB 则因静电排斥及高浓度下形成的有序疏水环境，在一定程度上保护了蛋白免受热变性。

该研究通过高通量筛选鉴定出八种能够显著激活金黄色葡萄球菌 ClpC/ClpP 蛋白酶 ATP 酶及蛋白水解活性的小分子化合物，并揭示了其作用于 ClpC N 端结构域两个关键调控位点的分子机制，从而证实了该 AAA+ 蛋白酶作为药物靶点的可行性。

本文介绍了 NPannotator，一种结合基因组上下文与化学约束的自动化流程，能够通过智能匹配候选底物与目标天然产物结构，推断 I 型聚酮合酶（PKS）的催化顺序及酰基转移酶（AT）的底物特异性，从而有效连接基因簇架构与最终化学产物。

该研究通过结合定量结合测量、生物信息学分析及结构建模，揭示了胞质铁硫簇组装靶向复合物（CTC）识别 C 端靶向基序（TCR）的分子机制，阐明了芳香族残基侧链与 C 端羧基起主导作用、上游残基依序列背景调节亲和力的层级解码规则，并定位了 Cia1-Cia2 界面上容纳该基序的关键结合位点。

该研究揭示牛磺酸、亚精胺和乙醇胺等内源性亲核代谢物可直接与反应性酰基物种结合，从而中和碳应激、抑制异常蛋白酰化并延长寿命，为对抗衰老和代谢疾病提供了新机制。

本文开发了一种基于高亲和力荧光偏振探针 KP-SC-1 的稳健高通量筛选方法，能够以极低的酶用量有效检测 SIRT1-3 抑制剂（包括 NAD+ 依赖与非依赖型），从而加速相关抗癌药物的发现与开发。

该研究利用多种互补方法证实心脏肌浆网钙结合蛋白（CASQ2）在生理条件下本质为二聚体，并通过钙离子触发的协同开关机制发生聚合，这一新机制为理解导致儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速的 CASQ2 突变致病机理提供了框架。

该研究利用裂殖酵母和线粒体特异性 SQR 缺陷小鼠模型，证实线粒体硫化物：醌氧化还原酶（SQR）通过驱动超硫化代谢维持线粒体呼吸功能，从而在真核生物中调控能量代谢与寿命。

该研究通过引入 SpyTag 将细菌微区室三聚体改造为可自发组装成宏观层状蛋白材料的构建模块，成功实现了兼具化学稳定性、功能可及性及表面可再生性的新型蛋白材料，拓展了细菌微区室在生物界面、催化及可持续材料工程中的应用潜力。

本研究建立了一种利用细胞滤网温和破碎心肌细胞以快速分离大鼠和豚鼠心肌细胞线粒体的新方案，该方法显著提高了线粒体得率并保持了其结构与功能的完整性，适用于多种下游应用。