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A druggable redox switch on SHP1 controls macrophage inflammation
该研究利用深度氧化还原蛋白质组学鉴定了免疫蛋白上的氧化还原调控半胱氨酸位点，并发现并开发了靶向SHP1蛋白Cys102的高选择性共价激动剂SCA，通过解除其自抑制状态来抑制巨噬细胞炎症反应，从而揭示了控制巨噬细胞细胞因子反应的可成药氧化还原开关。
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338 篇论文
生物化学是探索生命分子语言的桥梁，它深入细胞内部，解析蛋白质、DNA 等微小分子如何协同运作，驱动我们从呼吸到思考的每一个生命过程。这一领域不仅揭示了疾病发生的根本机制，更为开发新药和定制疗法提供了关键线索，让抽象的微观世界变得具体可感。
在 Gist.Science，我们直接从 bioRxiv 获取该领域最新的预印本论文。我们的团队会处理每一篇新发布的稿件，将其转化为通俗易懂的科普解读，同时保留供专业人士参考的深度技术摘要，确保科学发现能跨越专业门槛，被更广泛的人群所理解。
以下是该领域从 bioRxiv 精选的最新研究成果，欢迎查阅。
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Breaking Barriers: Transitioning from X-ray Crystallography to Cryo-EM for Structural Studies
本文阐述了实验室从 X 射线晶体学转向冷冻电镜技术解析染色质调节因子 ATAD2B 结构的完整工作流程，详细总结了克服蛋白表达纯化及样品制备挑战的策略、数据处理方法以及模型构建验证的最佳实践，为结构生物学家采用冷冻电镜研究大型柔性蛋白复合物提供了实用指导。
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Flux organizations and control modes in antagonistically combined negative feedback loops
该论文通过研究由两个拮抗积分控制器组成的负反馈系统，揭示了根据设定值关系产生的委托控制、隔离控制及亚稳态控制等调节模式，并解释了西伯利亚仓鼠体重光周期调节及血糖稳态等生物现象。
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Distinct mechanisms of inhibition of Kv2 potassium channels by tetraethylammonium and RY785
该研究通过全原子分子动力学模拟揭示了 RY785 与四乙铵（TEA）抑制 Kv2 钾通道的不同分子机制：TEA 结合于孔道轴心直接阻断离子流，而 RY785 则通过非轴心结合稳定并封闭半开放门控状态，从而在允许离子流动的同时抑制通道功能。
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Targeting von Willebrand factor selectively under inflammatory conditions
该研究开发了一种高通量 ELISA 检测方法，证实了药物 lumacaftor 能够选择性地抑制在炎症氧化条件下被激活的血管性血友病因子（VWF），从而为开发仅在炎症状态下起效且降低出血风险的抗血栓药物提供了新策略。
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Change in topological linking number during Xer recombination at the plasmid pSC101 psi site
该研究通过实验测定证实，Xer 重组酶在质粒 pSC101 psi 位点介导的重组反应会导致拓扑链接数增加 4（ΔLk = +4），这一结果支持了该反应通过反平行位点排列和 Holliday 连接体中间体进行的机制模型，即四个负超螺旋被转化为连接体节点从而为反应提供能量驱动力。
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Structural insight into sodium-dependent bile acid transport by members of the SLC10 family
该研究通过解析 SLC10 家族钠依赖性胆酸转运蛋白（ASBT）的多种构象晶体结构并结合分子动力学模拟，揭示了其通过 TM6 柔性螺旋封闭出口从而避免形成贯穿孔道的转运机制，并阐明了膜脂与疏水甾醇基团的相互作用在底物结合与转运中的关键作用。
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Rapid Histone Post-Translational Modification Analysis Using Alternative Proteases and Tandem Mass Tags
该研究开发了名为 RIPUP 的快速组蛋白翻译后修饰分析平台，通过结合 Arg-C Ultra 和 r-胰蛋白酶等替代蛋白酶与 TMT 标记技术，将样本制备时间从数天缩短至数小时，显著提升了 PTM 的覆盖范围（特别是揭示了以往难以检测的琥珀酰化和戊二酰化位点）及定量准确性，并成功应用于大鼠海马组织样本以加速表观遗传机制的发现和药物靶点验证。
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Regulation of mitochondrial DNA homeostasis by a mitochondrial microprotein
该研究鉴定出一种由替代开放阅读框编码的保守微蛋白 AltSLC35A4，它通过与肌动蛋白 - 肌球蛋白系统相互作用，在独立于 mtDNA 复制和线粒体膜电位的情况下调控线粒体 DNA 的拷贝数及核小体的空间分布。
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Linking biochemical and cellular efficacy of MERS coronavirus main protease inhibitors
该研究通过比较三种数据分析方法，发现采用包含二聚化和配体结合机制的酶动力学模型能最准确地预测 MERS 冠状病毒主蛋白酶抑制剂在细胞内的效力，从而为抗病毒药物研发提供了更可靠的数据分析策略。