The cytoplasmic lattice in mammalian eggs sequesters ubiquitination machinery and tubulin in reserve
该研究利用冷冻电镜技术解析了哺乳动物卵细胞中细胞质晶格（CPL）的高分辨率原生结构，揭示了其作为母体效应蛋白、非活性泛素化酶系及 GTP 结合态微管蛋白的有序储备库，在调控泛素介导的蛋白降解和细胞骨架重塑以支持胚胎早期发育中的关键作用。
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biophysics
299 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Discovering Plastic-Binding Peptides with Favorable Affinity, Water Solubility, and Binding Specificity Through Deep Learning and Biophysical Modeling
本研究通过结合深度学习与生物物理建模的计算机筛选流程，成功设计出具有高亲和力、高水溶性及特定塑料结合选择性的短线性多肽，为微塑料污染治理提供了有效的分子工具。
Object Detection Techniques for Live Monitoring of Amoeba in Phase-Contrast Microscopic Images
本研究利用包含 88 张图像和 4,131 个标注的相衬显微数据集，开发并评估了基于 Detectron2 和 YOLO v10 的多种深度学习模型，旨在实现活体阿米巴原虫的实时、高效且准确的自动检测，从而减少人工标注需求并降低光毒性影响。
Protein-peptide binding pathways revealed by two-dimensional replica-exchange molecular dynamics
本研究利用二维副本交换分子动力学模拟，揭示了 Abl 激酶与其底物肽 Abltide 从初始接触到结合构象的详细结合路径，识别出多个关键相遇区域和中间态，并阐明了特定疏水及负电荷斑块在引导底物识别中的核心作用，为理性设计肽类抑制剂提供了机制基础。
Comparing Random and Natural RNA Boltzmann Ensembles
该研究通过比较随机与自然非编码 RNA 的玻尔兹曼分布发现，除极短序列外，自然 RNA 仅表现出略高的能量稳定性且整体占据与随机 RNA 相似的形态空间，表明非编码 RNA 的系综特性主要由基因型 - 表型映射的生物物理规律所决定。
Revisiting claims of extracranial biophoton detection from the human brain
该研究指出，先前关于通过颅外检测超弱光子发射作为脑活动生物标志物的主张存在严重缺陷，因为实测信号主要受背景光干扰，且由于组织衰减和探测器灵敏度限制，所测得的光子极可能源自头皮而非大脑。
Sodium Ions Regulate GPCR Activation by Remodeling Allosteric Coupling Networks and Hydration Patterns
该研究通过分子动力学模拟和自由能计算，揭示了钠离子通过重塑变构耦合网络和破坏激活所需的水柱来调节多巴胺 D2 受体失活的分子机制，并发现了新的钠离子结合位点，为靶向离子敏感状态的药物设计提供了新见解。
Residue burial encodes a protein's fold
该研究指出，通过二元编码表示氨基酸是否埋藏于蛋白质核心（即“核心身份”），能够比接触图或机器学习嵌入等现有方法更高效地预测蛋白质骨架构象，从而将确定蛋白质天然折叠的问题重新定义为预测各残基的埋藏状态。
Programmable Edge-to-Edge Assembly of RNA Nanostructures
该研究提出了一种名为 alphaKL 的紧凑型可编程 RNA 连接器，它通过结合四核苷酸接吻环与三链螺旋相互作用，实现了 RNA 纳米结构沿螺旋边缘的精准组装，从而突破了传统接吻环仅能进行端对端连接的局限，极大地拓展了可编程 RNA 纳米结构的几何设计空间。
Mutation-induced reshaping of protein conformational dynamics revealed by a coarse-grained modeling framework
该研究提出了一种基于内坐标和本质动力学优化的粗粒化弹性网络模型（ICed-ENM），通过量化突变引起的振动熵变来系统揭示疾病相关错义突变如何重塑蛋白质构象能量景观及功能动态。