biophysics 篇论文 | Gist.Science

生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。

Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。

以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。

本研究对新发现的早期分化 KCNE 亚基 kcne0 在无颌类七鳃鳗中的功能进行了表征，证明了其能够组成型激活七鳃鳗 KCNQ1 通道，并揭示了跨脊椎动物间物种特异性的兼容性以及通道调控的结构决定因素。

本研究确定了 MTCL1 是一种许可因子，它通过在组装过程中利用分子模拟将微管稳定化与微管蛋白乙酰化相耦合，这一机制对于正常的神经元功能至关重要，MTCL1 缺失的斑马鱼表现出的运动缺陷和癫痫易感性增加证明了这一点。

本文介绍了 ACCEST，这是一种利用手风琴光谱技术（accordion spectroscopy）从单个二维实验中获取完整化学交换饱和转移（CEST）剖面的加速核磁共振（NMR）方法，从而与传统的多谱图方法相比，提供了显著的时间节省并能够研究非平衡系统。

本文提出了一种新型高通量表面等离子体共振（SPR）阵列，能够定量分析 16 种不同糖胺聚糖制剂与蛋白质之间的相互作用，成功验证了已知的结合特异性，并发现了此前未报道的相互作用，例如 Slit2 与软骨素硫酸盐及皮肤素硫酸盐的结合。

本文表明，在基于化学图谱数据训练的 RNet 基础模型的指导下，深度学习工具能够成功地从头设计出具有准确二级结构和有序三维折叠的 RNA 假结，在无需预先解决通用 RNA 三维结构预测问题的情况下，达到了 Eterna 竞赛中的人类水平。

本文提出了一种使用开源自监督深度学习工具 spIsoNet 来减轻冷冻电镜重建中择优取向伪影的实用方案，该方案通过两种互补的工作流实现：图各向异性校正和颗粒错位校正。

该论文介绍了 cryoGO，这是一种简单且可扩展的机械方法，用于直接在电子显微镜（EM）载网上开启细胞，从而能够以极少的样品量，在原生细胞环境中对多种内源性大分子进行高分辨率、时间分辨的结构分析。

通过利用共进化和机器学习来推导出一个序列无关的集体变量，本研究建立了一种统一的、进化保守的 A 类 GPCR 激活机制，从而能够实现对包括孤儿受体在内的多种家族成员构象转变及配体效应的预测。

本研究表明，MM-GBSA 结合自由能计算中的分解能量项具有高度共线性而非相互独立，揭示了传统的独立性假设是无效的，并敦促将相关的项合并为有效的极性、非极性和熵贡献，以实现更稳健的预测建模。

本研究展示了非同源 GluK2/GluK5 谷氨酸盐酸受体在无配体结合、激动剂结合及拮抗剂结合状态下的冷冻电镜结构，揭示了异源四聚体相比同源四聚体表现出更低的构象动力学，并证明了通过 UBP310 靶向 GluK5 亚基以将受体锁定在孔道阻塞构象，比靶向 GluK2 亚基更为有效。