Cryo-EM image processing of amyloid filaments in RELION-5.1
本文介绍了 RELION-5.1 中针对淀粉样蛋白纤维冷冻电镜图像处理的新工具，包括基于特征信号的自动拾取算法、在线预处理流程、基于聚类的纤维类型选择工具以及专用去噪神经网络，并通过实验数据验证了其在解析新型纤维结构方面的有效性。
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biophysics
299 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Constrained neighboring-sarcomere phase topology shapes mean HSO amplitude in living cardiomyocytes
该研究通过重新分析活体心肌细胞中相邻肌节的相位关系，揭示了热诱导肌节振荡（HSO）并非无序，而是受限于相邻肌节相位的特定拓扑结构，且其平均振幅可由局部振幅与加权同步性的乘积模型精确描述。
Dynamic Regulation of the Immune Repertoire of Bacteria
该研究结合稳态免疫模型与动态抗原旅行波理论，揭示了细菌 CRISPR 免疫记忆的最优规模并非固定不变，而是由“引发式获取”与“基因座扩展”两种机制在种群免疫压力下的相互作用所决定。
Experimental Data Driven AI Framework for Flexible Protein Conformational Reconstruction
本文提出了名为 AlphaSAXS 的端到端框架，通过将小角 X 射线散射（SAXS）实验数据直接整合到 AlphaFold 架构中，实现了对蛋白质动态构象集合的实验引导式重建，有效解决了仅依赖序列的模型在捕捉特定构象状态和异质性方面的局限性。
A light-weight, data-driven segmentation method for multi-state Brownian trajectories
本文提出了一种基于优化高斯滤波与高斯混合模型自动拟合的轻量级数据驱动方法，用于准确分割多态布朗轨迹并估算扩散系数，该方法在合成与实验数据中均表现出高精度，且相比深度学习或隐马尔可夫模型具有显著更低的计算负载，适用于单粒子轨迹的实时处理。
Protein Diffusion Models as Statistical Potentials
该论文提出了名为 ProteinEBM 的能量基模型，旨在解决蛋白质结构预测中缺乏进化信息、构象景观建模及突变热力学等挑战，并在结构评估、突变效应预测、构象采样及折叠模拟等任务中展现出媲美或超越现有方法的性能。
Impact of music on running fatigue: Distraction effect from lyrics could further delay running fatigue compared to synchronous effect from tempo
该研究表明，在匹配跑步节奏的视觉节拍基础上，加入具有激励性的歌词内容能进一步降低躯干加速度波动，从而比单纯依靠节奏同步更有效地延缓跑步疲劳。
Contributions of error correction and the spindle assembly checkpoint to mitotic timing and fidelity
该研究通过构建并验证粗粒度模型，揭示了染色体正确分离的概率取决于纺锤体组装检查点失效率与错误校正速率之比，并提出了通过有丝分裂时长变化来区分检查点缺陷与错误校正缺陷的简单判据，从而为理解有丝分裂时序与保真度提供了定量框架。
Spatially correlated fluctuations govern relative chromatin motion
该研究通过活细胞成像与聚合物模拟发现，核质中非平衡的空间相关涨落导致染色质位点间的相对运动显著慢于独立扩散预测，这种机制通过降低短距离相遇频率并延长相遇持续时间，对基因调控产生了关键影响。
Theory of Cell Body Lensing and Phototaxis Sign Reversal in "Eyeless" Mutants of Chlamydomonas
本文通过结合细胞体透镜效应与适应性光趋性模型，定量解释了衣藻“无眼”突变体中因内部焦散线导致透镜聚焦光信号（其时间导数更高）压倒直接光照信号，从而引发光趋性方向反转的机制。