299 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
本文提出了一种基于重要动力学优化的弹性网络模型（edENM），通过整合分子动力学模拟参数，成功实现了对 DNA、RNA 及其与蛋白质复合物（如染色质亚基和核糖体）构象动力学的精确描述，并扩展了 eBDIMS 框架以模拟其大规模功能运动。
本文提出了 SAP（Segment Any Plant）框架，该框架利用预训练的 Segment Anything Model 2 (SAM2) 实现了无需特定任务重训练、仅需少量样本提示即可对多种植物在不同生长阶段和成像条件下进行高精度时间序列分割与表型分析。
该研究通过活体成像与计算建模发现，转录因子 Dorsal 在果蝇胚胎中形成的动态簇（hub）是由增强子序列决定的结合动力学所驱动的涌现特征，其丰度和持久性虽随结合位点数量增加而提升，但并不直接预测转录爆发行为。
该研究开发了一种基于工程化 TPR 重复模体与自标记酶的模块化蛋白标尺，通过在不同表达系统和标记策略下提供一致的 FRET 效率及可预测的校准曲线，成功实现了从体外到细胞内多种 FRET 检测模态（如单分子 FRET、流式细胞术及 FLIM-FRET）的数据标准化与相互转换。
本文提出了一种结合机械相互作用的离散数学模型来模拟生物组织生长，并推导出了描述细胞密度演化的反应 - 扩散连续极限方程，该模型成功复现了实验观察到的界面平滑行为，并揭示了机械性质与集体扩散系数及曲率依赖性之间的内在联系。
该研究表明，在α1β2γ2 GABA_A 受体的α1 亚基 M2-M3 连接区引入脯氨酸可解除通道激活的分子制动，从而增强其对 GABA 的敏感性并诱导自发开放，而β2 和γ2 亚基在该位点的类似突变则表现出不同的功能效应。
该研究开发了一种将衣藻封装于巨型脂质体中的生物混合微泳体"Chlamylipo"，揭示了其通过周期性膜变形将内部鞭毛产生的流体动力有效传递至外部，从而实现自主游动及光控定向的物理机制。
该研究通过大规模分子动力学模拟揭示，Nanog、Oct4 和 Sox2 在 DNA 存在下通过非加性的协同作用形成具有特定空间组织的转录凝聚体，其中 Nanog 和 Sox2 作为“递送者”促进 DNA 富集，而 Oct4 作为“接收者”在 DNA 富集的间质区域发挥功能，从而提出了一种超越经典转录因子-DNA 结合的新型基因表达调控机制。
该研究通过整合晶体结构分析与分子动力学模拟，揭示了大肠杆菌核糖体出口通道狭窄处具有动态构象变化特性，能根据新生肽链的存在发生适应性扩张，从而取代了以往将其视为静态结构的观点。
该研究通过冷冻电镜技术解析了假单胞菌碳氮代谢关键调控因子 CbrA 的复合物结构，揭示了其作为“转运受体”识别组氨酸的分子机制、CbrX 肽段的稳定结合作用以及质子梯度驱动的构象变化，从而阐明了膜运输与下游信号传导偶联的结构基础。