Shapes of condensate droplets containing filaments
该研究结合实验、粗粒化分子动力学模拟与解析模型，揭示了表面张力、弯曲能及润湿效应如何共同决定嵌入纤维的液滴形状，阐明了生物分子凝聚体与细胞骨架相互作用的物理机制。
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biophysics
609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
A homogenization approach for spatial cytokine distributions in immune-cell communication
本文提出了一种基于均质化技术的宏观描述方法，通过建立微观反应扩散模型与有效连续介质模型之间的严格联系，在保留细胞摄取和体积排斥效应的前提下，实现了复杂免疫细胞环境中细胞因子信号传导的高效多尺度建模。
Transferability of ion force fields to OPC water: Maintaining single-ion and ion-pairing properties
该研究评估了现有离子力场参数直接迁移至 OPC 水模型的适用性，发现单一参数集无法同时准确描述所有离子，进而提出了结合 Mamatkulov-Schwierz-Grotz 阳离子与 Loche-Bonthuis 阴离子参数的 MS/G-LB(OPC) 力场，成功复现了水合自由能、第一水合层结构及低盐浓度下的活度导数等关键实验性质。
Correcting Preprocessing Bias in Sparse Chromatin Contact Data Enables Physically Interpretable Reconstruction of Genome Architecture
该研究揭示了全矩阵百分位截断预处理会系统性扭曲稀疏染色质接触数据，进而提出了一种基于非零百分位截断和归一化的统计一致框架及 CCUT 深度学习模型，从而实现了符合聚合物物理规律的基因组结构重建，并建立了实验数据与物理模型间的定量可比性。
Endocytosis shapes extracellular chemical gradients in autonomous cell-cell attraction
该研究提出，受体介导的内吞作用并非单纯的信号衰减机制，而是通过重塑自生成的细胞外化学梯度，在降低绝对浓度差异的同时增强相对表面各向异性，从而优化自主细胞间吸引中的方向性信息编码。
YY1-concentration-dependent formation of mechanically distinct DNA condensates through different interaction mechanisms
该研究利用单分子 DNA 幕荧光成像技术揭示，转录因子 YY1 通过其有序结构域与内在无序区域的协同作用，以浓度依赖的方式分别通过弱相互作用和锌指介导的桥接机制，形成具有不同力学特性的 DNA 凝聚体，从而阐明了转录因子调控染色质物质状态及基因组调控的分子机制。
Structural Basis of M1 Muscarinic and H3 Histamine Receptor Inhibition in OPC Differentiation
该研究通过计算模拟与实验验证，揭示了先导化合物 CN045 通过特异性结合并抑制 M1 毒蕈碱受体（而非 H3 组胺受体）来促进少突胶质细胞前体细胞分化，从而为多发性硬化症的髓鞘再生治疗提供了结构基础。
Coupling between sterol and sphingolipid structure in ordered membrane domains
该研究表明，鞘脂链长能够调节固醇与鞘脂的相互作用，从而决定膜有序结构域的形成，解释了为何胆固醇与短链鞘脂或麦角固醇与长链鞘脂在维持膜相分离中的特异性配对机制。
Structural insights into interdomain interactions in Entamoeba histolytica APS kinase
本研究通过解析溶组织内阿米巴 APS 激酶（EhAPSK）的全长及截短体晶体结构，揭示了其独特的类 ATP 硫酸化酶结构域（SLD）通过动态相互作用调控催化结构域活性的新机制，阐明了该酶在 PAPS 生物合成途径中的进化适应特征。
Structure and dynamics of a multidomain ligand-gated ion channel revealed under acidic conditions
该研究利用酸性条件下的冷冻电镜技术，首次解析了细菌离子通道 DeCLIC 的扩张孔道开放态结构，并揭示了其钙离子结合位点及 N 端结构域的动态重排在通道关闭过程中的关键调控机制。