On the effect of lateral stretch on the deformation energetics of biological membranes and the lipid dynamics within
该研究利用多映射分子动力学模拟揭示,侧向拉伸通过改变膜重塑的构象能垒而非单分子动力学来调控膜蛋白的力学传感,且膜脂成分改变导致的膜变薄可产生与拉伸等效的效应。
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生物物理学是一门迷人的交叉学科,它像一座桥梁,将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里,研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠,甚至探索意识背后的物质基础,让抽象的生命现象变得清晰可测。
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该研究利用多映射分子动力学模拟揭示,侧向拉伸通过改变膜重塑的构象能垒而非单分子动力学来调控膜蛋白的力学传感,且膜脂成分改变导致的膜变薄可产生与拉伸等效的效应。
该研究利用冷冻电镜解析了多种 MAPT 突变(D252V、G272V、S320F 和ΔG389-I392)导致的人类 tau 蛋白纤维结构,揭示了这些突变如何改变 Pick 折叠的构象,并成功通过重组蛋白体外重构了这些结构变体,为开发基于结构的诊断和治疗方法奠定了基础。
该研究利用遗传密码扩展技术将荧光非天然氨基酸 Acd 定点引入全长人电压门控质子通道(hHv1),通过构建 FRET 探针成功监测了该通道在去垢剂胶束中的正确折叠及其在 Zn²⁺调控下胞内结构域发生的可逆构象变化。
该研究利用冷冻电镜结合力学加载技术,揭示了α-actinin-4 通过力诱导的弱结合态向强结合态转变实现与肌动蛋白的“捕获键”结合,并阐明了导致局灶节段性肾小球硬化症的 K255E 突变因无法进行此构象转换而破坏该机制的分子机理。
该研究综合运用冷冻电镜、表面等离子体共振、自由能计算及分子动力学模拟,揭示了单克隆抗体 IV.3 通过识别包含 L135 残基的更广泛表位并利用疏水稳定作用,从而选择性结合 FcγRIIa 而非 FcγRIIb 的分子机制。
该研究利用单分子 FRET 技术证实,DNA 损伤(如核糖核苷酸、8-氧鸟嘌呤、无碱基位点等)会引发双螺旋结构发生长距离的构象与动力学改变,表明 DNA 柔韧性的变化可能是修复蛋白识别损伤的早期信号。
该研究通过结合分子动力学模拟、网络理论及机器学习方法,揭示了光激活腺苷酸环化酶(bPAC)中光诱导变构信号并非源于电子参数变化,而是由构象效应驱动,并成功识别出连接 BLUF 与 AC 结构域的关键变构残基。
该研究通过多种实验手段证实,微管蛋白富含谷氨酸的 C 末端尾部作为 pH 传感器,其异常升高的 pKa 值及构象变化受 pH 调控,进而调节马达蛋白(如 Cin8)与微管的结合,揭示了 pH 在细胞内通过酸性簇调控微管表面相互作用的新机制。
该研究揭示 Grb2 的磷酸化修饰通过打破其二聚体自抑制状态,驱动其发生液 - 液相分离形成凝胶状凝聚体,并作为多价支架高效招募野生型二聚体,从而将 Grb2 重新定义为 Ras/MAPK 信号通路中的动态空间组织者。
该研究通过结合傅里叶空间动态形变分析、数学建模及分子生物学手段,揭示了携带 BRAF 突变的结直肠癌类器官因 DNA 甲基化导致 E-钙粘蛋白(CDH1)下调,进而引起细胞间粘附减弱及力学性质改变(弹性降低、黏度升高),从而促进肿瘤侵袭和转移的机制。