biophysics 篇论文 | Gist.Science

生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。

Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。

以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。

该研究通过分子动力学模拟揭示了植物 ELF3 蛋白中多聚谷氨酰胺（polyQ）序列及其侧翼残基的序列背景如何通过调控温度敏感螺旋的形成及芳香族疏水残基的暴露，进而调节相分离凝聚体的形成，阐明了植物适应温度变化的分子机制。

该研究通过引入整合热力学与转录组数据的代谢自旋玻璃模型并利用量子退火求解，揭示了癌症代谢状态对应于热力学基态，将瓦伯格效应阐释为相变现象，并据此建立了可独立于传统分类的癌症预后新分层体系。

该研究利用分子动力学模拟揭示，LQT2 相关 hERG 通道突变通过变构机制破坏选择性滤器的结构完整性从而阻碍通道转运，且特定第二部位突变（如 Y652C）可纠正此类结构缺陷。

该研究开发了一种结合深度自适应分割的无标记 4D 全息断层成像技术，实现了对活体肝类器官中脂滴动力学的定量分析，揭示了油酸和亚油酸分别通过增大脂滴体积和增加脂滴数量这两种截然不同的机制诱导脂质积累，而棕榈酸则会导致类器官结构迅速崩溃。

该研究在 IBM 量子硬件上成功构建并重复执行了一个用于模拟热致肌节振荡的局部拓扑量子代理模型，验证了其在真实设备上对反相富集占有率等关键生物学可观测量的精确复现能力。

本文提出了一种结合波长扫描与偏振光栅的共路数字全息显微技术，通过多剪切去重算法有效分离重叠物像，从而将视场扩大一倍，实现了对致密生物样本（如神经元和酵母）的高质量定量相位成像。

该研究利用冷冻电镜技术揭示了大肠杆菌 RNA 聚合酶在遭遇 DNA 结合蛋白（如 EcoRI*）或另一聚合酶碰撞时，均会回溯至非活性的旋转（swiveled）状态，并阐明了这种旋转与 DNA 变形耦合的机制及其对转录冲突解决和终止的调控作用。

该研究提出了一种结合加权系综模拟与 RiteWeight 重加权算法的物理计算路径，成功将不同人工智能工具生成的腺苷酸激酶结构系综校正为基于特定力场的统一平衡态描述。

该研究评估了多种多序列比对扰动策略在 AlphaFold3 中的应用，发现这些方法不仅能显著提升其采样多种蛋白质构象状态的能力（表现优于 AlphaFold2 且与 BioEmu 相当），还能通过特定的掩码选择进一步优化特定目标的采样效果。

该研究通过整合计算框架揭示了 SARS-CoV-2 广谱中和抗体通过靶向由“最小化挫败”核心与“中性挫败”外围构成的超保守表位，利用能量分布策略实现了对病毒免疫逃逸机制的突破，并为设计下一代抗病毒疗法提供了理论蓝图。