🧬 基因组学
Interspecies variation of 45S ribosomal DNA in vertebrates
本研究利用来自脊椎动物基因组计划（Vertebrate Genomes Project）的染色体级组装序列揭示了，跨越脊椎动物的 45S 核糖体 DNA 位点是一个多层级的进化系统，其特征在于基因组架构和拷贝数存在谱系特异性的变异，同时保持着一种从高度稳定的 rRNA 编码区向快速分化的间隔序列过渡的序列保守性梯度。
🧬 Category
genomics
415 篇论文
基因组学探索着生命最底层的密码，致力于解读决定生物性状的遗传蓝图。这一领域不再局限于实验室，而是正深刻影响着我们对疾病、进化乃至人类自身起源的理解。在 Gist.Science 的基因组学版块中，我们专注于呈现来自 bioRxiv 的最新预印本，确保您能第一时间接触到科学界最前沿的未经同行评审的原始发现。
我们的团队会即时处理 bioRxiv 发布的每一篇相关预印本，将其转化为通俗易懂的科普摘要与详尽的技术解读，帮助不同背景的读者跨越专业壁垒。无论您是寻求灵感的科研工作者，还是对生命奥秘充满好奇的探索者，这里都能为您提供清晰、及时的资讯。
以下是该领域最新发布的论文列表，邀请您一同开启这场解读生命密码的探索之旅。
🧬 基因组学
Metagenomic prediction of methane emissions in sheep using single- and multi-matrix BLUP models with taxonomic and functional microbial features
本研究表明，在单矩阵和多矩阵 BLUP 模型中使用结合了基于 COG 的功能特征的长读长宏基因组数据，能够准确预测绵羊的肠道甲烷排放量，其表现优于分类学特征，并表明仅凭功能注释对于有效的甲烷减排策略而言已足够。
🧬 基因组学
Whole genome sequencing and variant discovery in 344 global grasspea (Lathyrus sativus L.) lines
本研究通过为344份全球品系生成全基因组测序数据，并开发一个包含超过150万个变异位点的高密度SNP标记集，以促进未来的育种和性状发现，从而解决了被忽视的作物草豌豆在基因组资源方面的空白。
🧬 基因组学
Scalable in vivo cardiac functional genomics with compressed AAV-Perturb-seq reveals a common mitochondrial response to perturbation
本研究介绍了一种可扩展的体内压缩型 AAV-Perturb-seq 平台，该平台成功地将心脏中的基因型与表型联系起来，揭示了线粒体转录组改变是应对多种遗传扰动的共同反应。
🧬 基因组学
Persistent circulation of Rift Valley fever virus lineage C in Rwanda, 2022-2025
本研究利用 2022 年至 2025 年间家畜样本的纳米孔测序技术，旨在证明卢旺达反复发生的里夫特谷热疫情是由 C 系谱的持续本地循环而非重复的病毒引入所驱动的。
🧬 基因组学
CLASH (Chromatin Loop Across-sample Score Harmonizer) quantifies the relative contributions of genetic variation, methylation, and CTCF occupancy on chromatin loop strength across individuals
本研究引入了 CLASH，这是一个通过利用多模态基因组数据来协调不同个体间染色质环调用的计算框架，旨在量化遗传变异、甲基化和 CTCF 占位如何共同塑造人类群体中差异性的环形成与强度。
🧬 基因组学
Architectural fragility of gene regulatory networks underlies hematopoietic stem cell aging
通过分析迄今为止规模最大的单细胞人类造血干祖细胞多组学图谱，本研究揭示了衰老驱动了由熵介导的复杂远端增强子网络的选择性塌缩，同时保留了富含GC含量的启动子结构，这种全局性的重构导致了应激过度激活、髓系偏向以及自我更新能力的丧失。
🧬 基因组学
Integrative genomics reveals shared and stress-specific adaptive pathways underlying acidic soil-associated metal toxicity in rice
本研究整合了元QTL分析与功能基因组学，旨在识别介导水稻适应酸性土壤中铝、镉及锰毒性的共有及胁迫特异性基因组通路，包括关键候选基因及其生理机制。
🧬 基因组学
A multi-tissue atlas of genetic regulatory effects in sheep
本研究展示了 SheepGTEx 资源，这是一个源自 51 种组织和多种绵羊品种的 6,761 个 RNA 测序样本的全面多组织图谱，该资源识别了数百万个调控变异，旨在阐明绵羊复杂性状、群体分化及适应性进化的遗传机制。
🧬 基因组学
Atg8 orchestrates stress-responsive chromatin programs across immunity and metabolism
本研究揭示，自噬蛋白 Atg8/LC3 通过保守基序直接与 NF-κB 转录因子 Dif 相互作用，调控其核内积累和染色质占据，从而在免疫和代谢中协调应激反应性转录程序，使细胞能够在感染和营养过剩期间协调防御与代谢适应。