A bioluminescence resonance energy transfer (BRET) assay to detect telomere length in S. cerevisiae
该研究开发了一种基于生物发光共振能量转移（BRET）的技术，通过检测端粒处 Rap1 与 Rif2 复合物的相互作用，实现了在酿酒酵母活细胞中准确、线性地测定端粒长度。
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genomics
269 篇论文
基因组学探索着生命最底层的密码，致力于解读决定生物性状的遗传蓝图。这一领域不再局限于实验室，而是正深刻影响着我们对疾病、进化乃至人类自身起源的理解。在 Gist.Science 的基因组学版块中，我们专注于呈现来自 bioRxiv 的最新预印本，确保您能第一时间接触到科学界最前沿的未经同行评审的原始发现。
我们的团队会即时处理 bioRxiv 发布的每一篇相关预印本，将其转化为通俗易懂的科普摘要与详尽的技术解读，帮助不同背景的读者跨越专业壁垒。无论您是寻求灵感的科研工作者，还是对生命奥秘充满好奇的探索者，这里都能为您提供清晰、及时的资讯。
以下是该领域最新发布的论文列表，邀请您一同开启这场解读生命密码的探索之旅。
The curious case of a Chilean copepod (Tigriopus aff. angulatus) genome assembly
本研究利用 PacBio HiFi、Illumina HiC 及 RNA-seq 数据组装并注释了智利中部海岸一种疑似新种（*Tigriopus aff. angulatus*）的基因组，其染色体水平的组装质量为后续探究*Tigriopus*物种多样性及环境适应机制提供了关键资源。
Biotic-response networks are an important organizer of the transcriptome in wild Arabidopsis thaliana populations
该研究通过分析欧洲和北美 60 个自然地点的野生拟南芥转录组，发现尽管核心生物响应网络在自然环境中得以保守，但野生种群的整体转录组结构呈连续分布且与实验室环境下的调控关系存在显著差异，表明自然情境下的基因调控网络发生了重组。
Identification and Masking of Artefactual and Misleading Within-Host Variants in Deep-Sequencing SARS-CoV-2 Data
该研究利用英国国家统计局的 SARS-CoV-2 测序数据，揭示了不同测序中心普遍存在且易被忽视的重复性人工变异，并开发了一套基于数据感知的框架来识别和掩蔽这些变异，从而显著提高了宿主内变异分析的准确性并改变了相关的进化推断结果。
Intron architecture predicts chromatin features in Arabidopsis thaliana
该研究揭示了拟南芥中内含子架构（特别是首内含子位置和内含子总数）能够预测染色质特征及基因表达模式，表明内含子位置影响转录起始位点附近的激活标记建立，而内含子总数则通过增加基因长度和内含子基序促进基因体相关染色质特征的积累。
The complete genome of the KOLF2.1J reference iPSC line
本研究构建了 KOLF2.1J 诱导多能干细胞系的完整定制基因组组装及注释资源，通过提供比传统线性参考更全面的映射和表观遗传分析，旨在解决 iPSC 研究中的异质性难题并确立高价值细胞系定制参考基因组的新范式。
Persistent SARS-CoV-2 Spike is Associated with Localized Immune Dysregulation in Long COVID Gut Biopsies
该研究通过多模态空间组学分析发现，长新冠患者肠道（尤其是结肠）中持续存在的 SARS-CoV-2 Spike 蛋白并非免疫惰性，而是驱动了局部的免疫细胞重编程、促炎性转录特征及免疫稳态失调，从而证实残留病毒抗原是长新冠肠道慢性免疫紊乱的关键驱动因素。
Chromosome-level Genome Assembly of the South African Lion (Panthera leo melanochaita)
本研究利用 PacBio HiFi 和 Omni-C 测序技术，构建了南非狮（Panthera leo melanochaita）的高质量染色体水平基因组组装，为未来针对克鲁格国家公园狮种群的群体基因组学研究与保护工作奠定了坚实基础。
Ensembles of Graph Attention Networks Supervised by Genotype-to-Phenotype Structures Improved Genomic Prediction Performance
该研究通过集成不同基因型 - 表型结构（从无穷小到全连接）的图注意力网络（GAT）模型，成功构建了基因组预测集成模型，在玉米开花性状预测中实现了比单一数据驱动先验知识 GAT 模型更稳定且优异的性能。
The Zelda Interactome Reveals Diverse Co-factors Essential for Pioneer Factor-Mediated Zygotic Genome Activation
该研究通过构建 Zelda 转录因子的互作组图谱，揭示了其通过招募包括共激活因子、染色质重塑复合物及激酶在内的多样化调控复合物，在果蝇合子基因组激活过程中发挥先锋因子的核心作用。