🧬 genomics
RNAPII and XPC remodel the 3D genome for UV repair
这项研究揭示了在紫外线照射下，RNA聚合酶II和XPC通过限制环挤压以缩短染色质环并强化结构域，从而主动重塑三维基因组，进而创造出一种有利于高效核苷酸切除修复的修复允许状态。
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genomics
368 篇论文
基因组学探索着生命最底层的密码，致力于解读决定生物性状的遗传蓝图。这一领域不再局限于实验室，而是正深刻影响着我们对疾病、进化乃至人类自身起源的理解。在 Gist.Science 的基因组学版块中，我们专注于呈现来自 bioRxiv 的最新预印本，确保您能第一时间接触到科学界最前沿的未经同行评审的原始发现。
我们的团队会即时处理 bioRxiv 发布的每一篇相关预印本，将其转化为通俗易懂的科普摘要与详尽的技术解读，帮助不同背景的读者跨越专业壁垒。无论您是寻求灵感的科研工作者，还是对生命奥秘充满好奇的探索者，这里都能为您提供清晰、及时的资讯。
以下是该领域最新发布的论文列表，邀请您一同开启这场解读生命密码的探索之旅。
🧬 genomics
Genome Assembly of the Endangered Patagonian Deer Hippocamelus bisulcus (huemul): The First Nuclear Genome for the Genus Hippocamelus
本研究展示了首个高度连续、染色体级规模的濒危巴塔哥尼亚南美鹿（*Hippocamelus bisulcus*）核基因组与线粒体基因组组装结果，为推进这一具有代表性的南美鹿科动物的保护管理与进化研究提供了至关重要的基因组资源。
🧬 genomics
Gonadal remodelling in socially driven sex change is associated with novel and known sex genes, epigenetic reprogramming, and inflammation-mediated apoptosis.
本研究利用对新西兰斑鱼的基因组学、转录组学和组织学分析，揭示了由社会驱动的性别转换涉及已知与新发现性相关基因的协同调控、表观遗传重编程以及炎症介导的细胞凋亡，从而促进生殖腺重塑。
🧬 genomics
A chromosome-scale genome assembly of the Swiss Lolium multiflorum ecotype Tremona reveals a scalable method to purge spurious duplications
本研究展示了瑞士黑麦草（*Lolium multiflorum*）Tremona生态型的高质量、染色体级基因组组装，并引入了一种名为ParaLies的可扩展工具，以有效清除由杂合性引起的伪重复序列，从而显著提高了这一复杂牧草物种的组装准确性。
🧬 genomics
Global tree encoding of atlas-scale single-cell genomics
本文介绍了 MILK，这是一个可扩展的计算框架，它将海量的单细胞基因组数据集组织成统一的分层树状表示，以实现高效的子采样、保留多分辨率的细胞关系，并促进跨组织、发育阶段和物种的整合分析。
🧬 genomics
Visualizing and integrating linear and graph pangenomes at the Maize Genetics and Genomics Database
玉米遗传学与基因组学数据库（MaizeGDB）通过集成带有全新泛基因组查看器的 JBrowse2，增强了其分析能力，从而实现对线性及图状泛基因组的交互式可视化，以促进对玉米结构变异和农艺性状的精确表征。
🧬 genomics
Histone H3K9 methylation and Heterochromatin Protein 1 do not limit DNA accessibility in living S. pombe cells
通过在活体裂殖酵母（*S. pombe*）细胞中使用铜诱导的 DNA 甲基转移酶系统，本研究证明了真核染色质和异染色质在体内都是全局可及的，揭示了 H3K9 甲基化和 HP1/Swi6 系统并不会限制 DNA 的可及性，并且所观察到的在分离核中的不可及性是由于紧密的核小体间距而非生物性抑制机制所导致的伪现象。
🧬 genomics
Within-colony color variation in a chalice coral is associated with region-specific pigment expression and higher photoconvertible pigment transcripts
这项初步研究表明，单个克隆杯状珊瑚群体内显著的颜色变化是由特定区域内不同荧光蛋白转录本和光可转换 EosFP 家族蛋白的区域特异性上调所驱动的，而非由遗传差异所致。
🧬 genomics
Two evolutionary histories in one nucleus: genome remodeling and allelic regulation underlying heterosis in hybrid oil palm
本研究将高度杂合的 F1 代油棕基因组解析为完整的单倍型，以揭示互补的基因组重构、古老的渗入以及平衡的等位基因表达是如何协同作用于不同的亲本性状，从而驱动杂种优势的。
🧬 genomics
The first chromosome-scale genome assembly of Blumeria graminis f. sp. avenae provides insights into genome evolution and host specialization
本研究展示了第一个禾谷氏白粉菌燕麦专化型（*Blumeria graminis* f. sp. *avenae*）的染色体级基因组组装，揭示了其宿主特异性是由致病基因在富含转座子且结构动态变化的基因组区域内的局部多样化，而非大规模基因组重构所驱动的。