🧬 基因组学
RNA Structure Coordinates Translation Across the Meiotic Program
这项研究表明，RNA 结构与振荡的解旋酶水平协同作用，在全球范围内协调了酵母减数分裂过程中数百种 mRNA 的阶段特异性翻译动力学，从而在转录受限的情况下确保程序的正常进行。
🧬 Category
genomics
415 篇论文
基因组学探索着生命最底层的密码，致力于解读决定生物性状的遗传蓝图。这一领域不再局限于实验室，而是正深刻影响着我们对疾病、进化乃至人类自身起源的理解。在 Gist.Science 的基因组学版块中，我们专注于呈现来自 bioRxiv 的最新预印本，确保您能第一时间接触到科学界最前沿的未经同行评审的原始发现。
我们的团队会即时处理 bioRxiv 发布的每一篇相关预印本，将其转化为通俗易懂的科普摘要与详尽的技术解读，帮助不同背景的读者跨越专业壁垒。无论您是寻求灵感的科研工作者，还是对生命奥秘充满好奇的探索者，这里都能为您提供清晰、及时的资讯。
以下是该领域最新发布的论文列表，邀请您一同开启这场解读生命密码的探索之旅。
🧬 基因组学
Genomic hallmarks of parasexual reproduction in three hybrid groups of the human pathogen Cryptococcus neoformans
这项研究表明，以减数分裂无关过程（如全染色体杂合性丢失、非整倍体和倍性降低）为特征的副性生殖，驱动了人类病原体——新型隐球菌中三个不同杂交群体的基因组多样性和表型变异。
🧬 基因组学
Covariate-aware genomic prediction of blood metabolite profiles using multi-task neural networks
本研究引入了一种多任务神经网络框架，通过分离遗传、协变量及共同贡献，有效地预测血液代谢物谱，并揭示了对协变量（尤其是年龄）进行非线性建模是其相比传统线性方法提升预测性能的主要驱动因素。
🧬 基因组学
Predicted Effector Gene Aggregation, Standards and Unified Schema (PEGASUS): A Community Framework for Effector Gene Reporting
PEGASUS 框架通过为元数据、证据矩阵和优先基因列表定义统一的架构，建立了首个用于报告全基因组关联研究（GWAS）中预测效应基因的社区开发标准，旨在增强变异功能研究的互操作性、可重复性和可重用性。
🧬 基因组学
Multigenerational machine learning-based genomic prediction for dermo resistance in eastern oyster Crassostrea virginica
本研究表明，通过机器学习（特别是梯度提升模型）利用罕见遗传变异，可以显著增强对东部牡蛎皮肤病抗性的多代基因组预测，从而实现 0.410 的峰值相关准确度，大幅超越传统方法。
🧬 基因组学
Apollo 3: Multi-Species Genome Curation
本文介绍了 Apollo 3，这是一款基于 JBrowse 2 构建的可扩展、协作式人工基因组注释工具，能够实现同步的多基因组编辑与共线性可视化。
🧬 基因组学
RNAPII and XPC remodel the 3D genome for UV repair
这项研究揭示了在紫外线照射下，RNA聚合酶II和XPC通过限制环挤压以缩短染色质环并强化结构域，从而主动重塑三维基因组，进而创造出一种有利于高效核苷酸切除修复的修复允许状态。
🧬 基因组学
Genome Assembly of the Endangered Patagonian Deer Hippocamelus bisulcus (huemul): The First Nuclear Genome for the Genus Hippocamelus
本研究展示了首个高度连续、染色体级规模的濒危巴塔哥尼亚南美鹿（*Hippocamelus bisulcus*）核基因组与线粒体基因组组装结果，为推进这一具有代表性的南美鹿科动物的保护管理与进化研究提供了至关重要的基因组资源。
🧬 基因组学
Gonadal remodelling in socially driven sex change is associated with novel and known sex genes, epigenetic reprogramming, and inflammation-mediated apoptosis.
本研究利用对新西兰斑鱼的基因组学、转录组学和组织学分析，揭示了由社会驱动的性别转换涉及已知与新发现性相关基因的协同调控、表观遗传重编程以及炎症介导的细胞凋亡，从而促进生殖腺重塑。
🧬 基因组学
A chromosome-scale genome assembly of the Swiss Lolium multiflorum ecotype Tremona reveals a scalable method to purge spurious duplications
本研究展示了瑞士黑麦草（*Lolium multiflorum*）Tremona生态型的高质量、染色体级基因组组装，并引入了一种名为ParaLies的可扩展工具，以有效清除由杂合性引起的伪重复序列，从而显著提高了这一复杂牧草物种的组装准确性。