Distinct virus-specific regulation of RNA synthesis across genome segments by thogotovirus polymerases: insights from Oz virus and Dhori virus

该研究利用最小基因组系统揭示,奥兹病毒和得霍里病毒虽同属节肢动物传播的六节段负链 RNA 病毒,但其聚合酶对基因组末端远端双链区(特别是 5'12/3'11 位碱基对)序列差异的响应机制存在显著差异,表明同一属内的病毒在通过该序列调节不同节段启动子活性方面具有不同的调控策略。

Rakib, T. M., Mashimo, R., Akter, L. + 4 more2026-04-01🦠 microbiology

Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome

该研究利用长读长测序与 myloasm 组装器,从南旧金山湾宏基因组中恢复了 488 个高质量单 contig 基因组,首次在同一复杂微生物群落中揭示了不同类群(如高度多样化的 Pelagibacter 与单型化的 HIMB114)截然不同的种群结构与进化策略,标志着 Torben 团队十年间从宏基因组获取完整 Pelagibacter 基因组研究的重大突破。

Lui, L. M., Nielsen, T.2026-03-31🦠 microbiology

A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles

该研究利用机器学习框架,基于 721 个致病性钩端螺旋体样本的 rfb 基因座特征,成功构建了从基因组数据直接预测血清群分类的高精度模型,并提出了“血清类”(seroclass)这一新概念,为传统血清学检测提供了一种可扩展且可重复的替代方案。

de Carvalo Ferreira Filho, E., Melo Arruda, P., Cabral Afonso Ferreira, L. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage

该研究评估了 ONETest PathoGenome 这一优化的自动化杂交捕获宏基因组测序 assay,结果显示其在支气管肺泡灌洗液检测中相比全基因组测序显著提高了目标微生物丰度,并在多队列验证中展现出高灵敏度与特异性,能有效补充传统培养方法以提升下呼吸道病原体的检出率。

Massoumi Alamouti, S., Nguyen, H. D., Daneshpajouh, H. + 9 more2026-03-30🦠 microbiology