771 篇论文
微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
Gist.Science 实时追踪并处理来自 bioRxiv 的每一个最新预印本，确保您不会错过任何前沿突破。我们不仅提供详尽的技术解读，更将晦涩的专业术语转化为通俗易懂的中文摘要，帮助不同背景的读者轻松理解研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文精选，带您即刻开启微观世界的探索之旅。
这项研究揭示了在革兰氏阴性菌——格拉迪奥利伯克霍尔德氏菌（*Burkholderia gladioli*）中，通过改变氧化应激反应并上调 sigma 因子 RpoN1，破坏硫酯酶基因能够增强抗细菌 VI 型分泌系统的活性，从而将细胞内活性氧（ROS）稳态与细菌间竞争联系起来。
该论文介绍了 MetagenomicsBench，这是一个包含跨不同宏基因组领域 100 项评估的可验证基准，旨在评估 AI 智能体在分析真实世界微生物组数据方面的能力，并揭示了尽管最强的配置达到了 60% 的通过率，但智能体在问题理解、统计推理和生物学解释方面仍经常面临困难，尽管其具备技术熟练度。
这项针对冈比亚农村地区健康高龄儿童的纵向研究，将上呼吸道微生物组特征描述为由链球菌属（*Streptococcus*）和普雷沃氏菌属（*Prevotella*）主导且具有高度的时间不稳定性，揭示了肺炎链球菌（*S. pneumoniae*）定植与较低的多样性、特定的细菌共存以及年龄和季节等环境因素相关，同时确定了颗粒卡拉特拉菌属（*Granulicatella*）和丝状因子菌属（*Filifactor*）是定植抗性的潜在贡献者。
本研究表明，一种源自萝卜种子的合成多界微生物群落，特别是结合了细菌、丝状真菌和酵母菌的群落，通过降低发病率、恢复生长并抑制病原体定殖等互补的生态功能，能有效保护幼苗免受真菌病原体黑芥硫素菌（*Alternaria brassicicola*）的侵害。
本研究通过使用 AlphaFold2 对 87 个新建模家族进行分析，验证了 Galleni-Garau 标准编号方案（BBL）在 B 类 -内酰胺酶中的稳健性，在确认其普适性的同时，也识别出了一小部分具有结构差异、值得进行实验后续研究的变体。
本研究利用 RB-TnSeq 技术表征了六种菜豆菌在马铃薯块茎感染过程中的条件必需基因，揭示了对软腐病致病性有贡献的保守代谢需求和物种特异性适应性决定因素。
这项研究通过识别并组装来自公共数据库的新型宏基因组组装基因组（MAGs），揭示了此前仅已知晓单一模式株系的罕见蜡样芽孢杆菌属（*Bacillus cereus* group）物种在地理分布上比预想的更为广泛，从而实现了对其功能潜力与演化的首次株系水平评估。
本研究表明，尽管噬菌体的活跃复制驱动了蔬菜发酵过程中的细菌演替，但整体发酵过程和代谢产物的生成在这些病毒-细菌相互作用中仍保持着韧性与稳定性。
这项研究表明，波罗的海中高度精简的*Nitrosopumilus*种群在强烈的纯化选择下仍维持着显著的维生素生物合成能力，这表明这些保留下来的途径具有进化上的保守性，并且对于生产者及更广泛的微生物群落都具有生态学意义。
本研究鉴定并表征了一个独特的 Cache 结构域蛋白家族，该家族通过获得共价结合的 c 型血红素而进化而来，揭示了一种全新的细菌感应系统进化机制，即这些结构域可作为一氧化氮传感器或氧化还原调节器发挥功能。