🦠 microbiology
A Field-Based Study of Phyllosphere Mycobiomes in Apple Orchards Under Varying Agricultural Management Strategies
这项基于田间研究的研究表明，农业管理策略（常规与有机）显著塑造了苹果叶面真菌群落的时空动态与组成，揭示了独特的病原菌关联和截然不同的多样性趋势，从而凸显了果园管理对植物健康的生态影响。
🦠 Category
microbiology
566 篇论文
微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
Gist.Science 实时追踪并处理来自 bioRxiv 的每一个最新预印本，确保您不会错过任何前沿突破。我们不仅提供详尽的技术解读，更将晦涩的专业术语转化为通俗易懂的中文摘要，帮助不同背景的读者轻松理解研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文精选，带您即刻开启微观世界的探索之旅。
🦠 microbiology
CUPID-seq enables highly multiplexed amplicon sequencing via combinatorial in-line dual indexing
CUPID-seq 是一种高度多重化的扩增子测序策略，它通过在两轮 PCR 中采用组合式、分相且内置的双索引技术，在保持样本唯一性识别的同时，显著降低测序成本并提高在高通量测序平台上的样本通量。
🦠 microbiology
Rapid and Specific Identification of Emerging Trichophyton mentagrophytes Genotype VII Using an In-House Developed and Validated Real-Time PCR Assay
本研究提出了一种快速、高灵敏度且高特异性的内部开发 TaqMan 实时 PCR 检测方法，该方法能够成功区分新出现的性传播*须癣毛癣菌*VII 型与其他相关真菌病原体，为改善患者护理和感染控制提供了一种显著快于传统测序方法的替代方案。
🦠 microbiology
Widespread circulation of West Nile and Usutu viruses in sedentary and migratory avifauna: A Two-Year Study (2024-2025) of active surveillance in South of France
这项在法国南部开展的两年期研究（2024–2025 年）显示，西尼罗病毒和乌苏图病毒在超过 2500 只留鸟和候鸟中广泛传播，其中乌苏图病毒的流行率高于西尼罗病毒，且 2024 年的总体感染率更高，这凸显了混合鸟类群落在维持地方性动物疫病循环中的关键作用，以及实施全年综合监测以减轻人畜共患病风险的必要性。
🦠 microbiology
Prophage Abundance Differentiates Clinical and Environmental Isolates of Pseudomonas aeruginosa
本研究揭示，与来自环境的分离株相比，来自临床的铜绿假单胞菌分离株具有更小的基因组、更高的 GC 含量以及完整前噬菌体丰度的降低，表明这些基因组特征是适应人类宿主的特异性标志。
🦠 microbiology
Microbial Diversity and Function Linked to Carbon Cycling in Mangrove Sediments
本研究揭示，尽管热带红树林沉积物中的微生物分类组成存在差异，但与碳循环相关的功能多样性保持保守却随深度变化，其中脱硫杆菌门和绿弯菌门被鉴定为驱动碳固定与代谢以维持长期碳储存的关键类群。
🦠 microbiology
Multi-omics reveals mechanisms behind pathogen inhibition by a microalgal microbiome
本研究采用整合多组学方法，证明*Isochrysis galbana*的微藻微生物组主要通过铁载体产生介导的组成型铁螯合作用抑制鱼类病原菌*Vibrio anguillarum*，为水产养殖疾病管理提供了一种替代抗生素的可持续方案。
🦠 microbiology
Direct Virus-Bacteria Binding Enhances Streptococcus equi subsp. zooepidemicus Colonisation and Bacterial-Driven Immune Activation During H3N8 Equine Influenza A Virus Co-Infection
本研究证实，H3N8 马流感 A 病毒与马链球菌马亚种（*Streptococcus equi* subsp. *zooepidemicus*）之间的直接物理结合增强了细胞类型特异性的细菌定植，并驱动细菌介导的免疫激活，其特征为在共感染期间促炎细胞因子增加但干扰素-β表达降低。
🦠 microbiology
Rate of osmotic pressure change in drying saliva microdroplets drives inactivation of surrogate respiratory bacteria
本研究证明，干燥唾液微滴在结晶过程中渗透压变化的速率可作为细菌灭活的定量且与介质无关的预测指标，其中湿度下降越快，引起的渗透冲击越剧烈，呼吸道病原体的存活率损失也越大。
🦠 microbiology
Evaluation of Oxford Nanopore Sequencing for Antimicrobial Resistance Surveillance in Salmonella: Comparison with Phenotypic Antimicrobial Susceptibility in a Large-Scale Study
这项针对来自台湾的1,490株沙门氏菌分离株评估牛津纳米孔测序技术的大规模研究表明，尽管基因型耐药性通常与表型结果相关，但由折点定义、基因表达及未知决定因素驱动的特异性差异凸显了谨慎解读的必要性，以充分发挥全基因组测序作为常规抗菌药物敏感性测试的更优替代方案，用于监测和治疗指导。