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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
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本研究通过来自波罗的海和地下水的宏基因组中的 208 个新完整基因组，将古菌门 Nanobdellota 的基因组代表性扩大了 52 倍，为一个优势目建立了新的 SeqCode 命名法，并为 Form III 型 RuBisCO 从古菌向 Patescibacteriota 的反复转移提供了证据。
本研究鉴定出人巨细胞病毒病毒体递送蛋白 UL14 为一种糖基化且具上皮细胞嗜性的因子，该因子在感染过程中促进病毒进入后的内体逃逸，从而凸显其作为疫苗和抗病毒疗法新靶点的潜力。
本研究证明，重新利用抗病毒药物为清除抗生素耐药性肺炎克雷伯菌的胃肠道定植提供了一条充满希望的新途径，因为已鉴定的六种化合物在模拟人体肠道环境中表现出具有菌株特异性和情境依赖性的抗菌活性。
本研究揭示，铜绿假单胞菌表观上的生态广适性实际上是由趋同的隐性特化所驱动，即针对特定环境的独特基因组适应在系统发育中反复出现，而非局限于深层谱系。
本研究揭示，结核分枝杆菌在酸性 pH 条件下利用乳酸时的生长停滞是由磷酸盐依赖的胞质酸化和质子动力势耗散所驱动，而磷酸盐转运蛋白的突变可通过上调 SenX3/RegX3 调节子来抑制该过程并恢复生长。
通过将基因组解析的稳定同位素标记病毒组学方法应用于复湿草地土壤，本研究揭示：尽管第一周内仅有少量胞外病毒颗粒被主动产生，但大多数病毒以稳定的“病毒种子库”形式持续存在，靶向快速复苏的细菌宿主，从而在环境扰动后作为微生物周转和生物地球化学循环的关键遗传库发挥作用。
本文介绍了扩增子共识分类学（ACT）流程及其配套的 ACT-DB 参考数据库，这是一个稳健的工作流程，通过整合多种分类工具，在有效识别新物种和低丰度类群的同时最大限度地减少过度分类，从而为牛津纳米孔长读长扩增子实现更优越的分类学分辨率。
本研究利用美国中西部上部的公民科学项目绘制蜱虫分布范围，发现尽管美洲钝眼蜱尚未在该地区定殖，但肩突硬蜱成虫却表现出对包括伯氏疏螺旋体在内的多种病原体的高感染率，从而为评估当地蜱传疾病风险提供了关键数据。
本研究揭示，*Streptococcus pyogenes* 通过 NETosis 过程中释放的蛋白酶感知中性粒细胞炎症，这些蛋白酶降解细菌阻遏蛋白 Vfr 从而诱导毒力因子 SpeB，进而形成一个加剧疾病病理的反馈回路。
本研究鉴定出宿主AAA+ ATP酶RUVBL1/2是鼻病毒复制的关键且特异性因子，并证明对其实施药理学抑制可在人类鼻上皮模型中有效阻断该病毒且不诱导耐药性，从而凸显其作为有前景的抗病毒靶点的潜力。