ISPpu10 is a structure-gated bridge RNA recombinase that drives safe, large-scale genomic plasticity
该研究鉴定出一种名为 ISPpu10 的新型桥接 RNA 重组酶，其通过独特的“结构门控”机制（即桥接 RNA 互补性与靶标 DNA 5'茎环结构的协同识别）驱动细菌基因组发生大规模且安全的重排，为合成生物学中实现高严谨性的大片段 DNA 整合与重编程提供了新范式。
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microbiology
816 篇论文
A comprehensive computational analysis investigating the relationships between phage codon usage, infection style, and number of tRNA genes
该研究通过对涵盖革兰氏阴性和阳性细菌的 154 种噬菌体进行广泛计算分析，揭示了噬菌体 tRNA 基因数量、感染周期与宿主密码子使用偏好之间的复杂关系，并指出既往基于结核分枝杆菌噬菌体的研究结论无法推广至全球或其他宿主属的噬菌体。
Leishmania exploits the macrophage endoplasmic reticulum-shaping protein CLIMP-63 to modulate mitochondrial biogenesis and bioenergetics
该研究揭示了利什曼原虫通过其毒力糖脂诱导宿主巨噬细胞内质网重塑蛋白 CLIMP-63 重分布并脱离线粒体网络，进而利用该蛋白促进线粒体 DNA 复制、嵴形成及呼吸增强，最终优化线粒体生物能量学以利于自身在巨噬细胞内的定殖。
The insect- and plant-associated lifestyles of Pseudomonas protegens CHA0 are preserved following serial passage through insect larvae
研究表明，Pseudomonas protegens CHA0 菌株在经历多次昆虫幼虫连续传代后，其兼具植物促生与昆虫致病的多宿主生活方式及生物防治性能得以保持稳定，证实了该菌株在田间复杂环境中作为广谱生物防治剂的可靠性。
Characterization of the bacterial microbiome associated with centrohelid heliozoans from aquatic environments using full-length 16S rRNA PacBio sequencing
本研究利用 PacBio 全长 16S rRNA 测序技术，首次揭示了淡水中心放射虫（centrohelid heliozoans）的细菌核心微生物组特征，并发现其可能作为多种机会性致病菌及立克次体科细菌的环境宿主。
A CRISPR-Cas9 screen Reveals STEEP1 as a Key Host Dependency Factor for Epstein-Barr Virus Latent Membrane Protein 1 Trafficking and Signaling
该研究通过全基因组 CRISPR-Cas9 筛选发现，内质网驻留蛋白 STEEP1 是 EBV 致癌蛋白 LMP1 从内质网转运至信号位点并激活下游通路的关键宿主依赖因子，且该相互作用具有特异性，为治疗 EBV 相关癌症提供了新的潜在靶点。
Chlorophyll a degradation in Prokaryotes
该研究利用基于 AI 预测蛋白结构的新型生物信息学框架，首次发现并验证了原核生物（如模式菌株 Shewanella acanthi）具备降解叶绿素 a 的完整或部分代谢途径，揭示了这一能力在全球生态系统中的广泛分布及其在进化上的重要意义。
Controlled human infection with Plasmodium falciparum-infected mosquito bites elicits antibodies against mosquito salivary protein SG1L3
该研究通过受控的人类疟疾感染实验，首次鉴定出针对携带疟原虫的蚊子唾液蛋白 SG1L3 的人源单克隆抗体，发现其虽结合疟原虫子孢子但不具备阻断感染功能，且可作为评估人群蚊虫暴露程度的血清学标志物。
Multifaceted roles of extracellular vesicles in Agrobacterium fabrum C58 lifestyles
该研究揭示了植物病原菌*Agrobacterium fabrum* C58 在致病条件下通过分泌富含 IV 型和 VI 型分泌系统效应子的细胞外囊泡，不仅直接将其递送至植物细胞以增强肿瘤形成，还能调节环境细菌发育并诱导独特的植物代谢反应，从而确立了细胞外囊泡在细菌致病及跨界通讯中的关键动态作用。
Thermal adaptation crosstalk with azole response through lncRNA in Aspergillus fumigatus
该研究发现，烟曲霉通过长链非编码 RNA（afu-182）介导的热适应机制，在温度升高时降低其表达水平，进而影响小热休克蛋白等基因调控并导致唑类药物耐药性增强及疾病预后恶化，揭示了温度变化在评估烟曲霉唑类耐药性中的关键作用。
Comparative genomics reveals modular virulence repertoires and extensive horizontal gene transfer in Vibrio species associated with white syndrome of Porites cylindrica
该研究通过对关岛鹿角珊瑚白化病相关弧菌的比较基因组分析，揭示了其致病性由保守的核心酶系与通过水平基因转移获得的模块化毒力因子共同构成，阐明了基因组可塑性在珊瑚机会性致病动态中的关键作用。
Potential for metal-coupled methane oxidation by Candidatus Methanocomedenaceae in coastal sediments
该研究通过基因组分析和长期富集实验，揭示了在波罗的海等咸水金属富集沉积物中，新发现的 Candidatus Methanoborealis（ANME-2a 亚群）具备利用细胞外电子转移进行金属耦合甲烷氧化的代谢潜力，从而阐明了该类群在厌氧甲烷氧化中的生态位与代谢多样性。
Conformational changes of baseplate regulatingtail contraction of Staphylococcus phage 812
该研究利用冷冻电镜技术揭示了金黄色葡萄球菌噬菌体 812 的基底板在识别宿主后发生构象变化，通过触发中心刺和焊接蛋白释放、暴露酶解结构域，并将信号经楔形模块传递至尾鞘起始蛋白，最终诱导尾鞘收缩并将尾管注入宿主细胞内的分子机制。
Antifungal biosynthesis by root-associated Streptomyces and Pseudomonas is elicited upon plant colonization
该研究揭示了植物定植通过释放特定信号分子（如 L-缬氨酸和油菜素内酯）诱导根际共生菌（如链霉菌和假单胞菌）合成抗真菌化合物 DHP，从而增强植物对病原真菌的防御能力，并阐明了共生菌与病原菌在响应植物信号时的显著差异。
Type 2 diabetes mellitus exacerbates vaginal group B Streptococcus colonization via impaired mucosal cytokine response
该研究利用饮食诱导的 2 型糖尿病小鼠模型发现，糖尿病通过抑制阴道黏膜（特别是 IL-1）的促炎细胞因子反应，导致 B 群链球菌定植增强和生殖道扩散，而补充重组 IL-1 可有效逆转这一现象。
Soil microbial traits shift on contrasting timescales following revegetation of former grazing lands
该研究通过宏基因组测序揭示，退耕还草后土壤微生物群落的功能与生存策略恢复具有明显的时间阶段性：早期（约 3 年）迅速重建养分保持与碳固定等核心健康功能，随后随着植被成熟逐步发展出促进植物生长的特性，且微生物生存策略从耐胁迫和养分掠夺型转向以生物合成和生长收益为主导的模式。
Female-enriched Eggerthella lenta drives neuroinflammation and IFN-γ via host receptor TLR2
该研究通过多队列荟萃分析和动物模型证实，女性富集的肠道细菌Eggerthella lenta通过宿主TLR2受体驱动IFN-γ产生及神经炎症，从而解释了自身免疫性疾病中性别差异的潜在机制。
Ancestral Hydrocarbon Metabolism Enables PET Degradation by a Natural Bacterial Consortium
该研究揭示了一个源自德克萨斯州加尔维斯顿湾的自然细菌 consortium 通过水平基因转移获得辅助基因组，利用祖先烃类代谢途径的“外显”作用及代谢分工（芽孢杆菌负责生物膜形成与次级水解，假单胞菌负责芳香单体降解与氧化应激缓冲），协同将 PET 塑料高效降解为对苯二甲酸等产物。
Exploring Biosurfactant-Producing Bacteria from Waste-Contaminated Sites near Dhaka City
本研究从达卡附近的工业废弃物中分离并鉴定了多种具有高效降解疏水性污染物能力的产生物表面活性剂细菌（如芽孢杆菌属、假单胞菌属等），证实了其在环境修复及农业、医疗等领域的绿色应用潜力。
Selective effects of cyclin dependent kinase inhibitors in gammaherpesvirus reactivation from latency
该研究利用小鼠γ疱疹病毒模型发现，广谱 CDK 抑制剂能抑制病毒从潜伏期再激活及裂解性复制，而 CDK 4/6 抑制剂的效果则取决于给药时机（同步给药抑制、预先给药促进），表明这些抑制剂具有治疗相关癌症的潜力，但需根据细胞状态和用药顺序进行优化。