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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
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本研究引入了肠道微生物生命之树（GMToL），这是一个包含来自 1,553 个物种的超过 17,000 个样本的综合数据集，旨在重建祖先肠道微生物组，并揭示从早期动物中假单胞菌门占主导地位到四足动物和鸟类中拟杆菌门和芽孢杆菌门占主导地位的主要进化组成转变。
本研究建立了一种基于Transwell共培养的新型系统，该系统利用人结肠类器官单层支持*艰难梭菌*的厌氧生长，并证明该细菌的葡萄糖基化毒素是诱导上皮细胞表达CCL20所必需的。
本研究证明细菌肽聚糖的伸长模式具有可塑性，可通过重新定位 MreB 或将合成酶 PBP2 直接靶向至细胞极，将其从分散式生长重编程为极向生长，这表明极向伸长可能是通过 MreB 的丢失而进化而来的。
本研究证明，微生物群衍生的吲哚通过抑制关键的呼吸和代谢途径，在发炎的肠道中抑制空肠弯曲杆菌的定植，从而揭示了共生菌自然限制该病原体生长的关键机制。
本研究鉴定并表征了一种源自 SARS-CoV-2 的新型环状 RNA 分子 circ7b8N，该分子在变异株间具有保守性，可在不依赖病毒感染的情况下调节宿主基因表达，并作为检测急性及感染后急性期感染的有前景的生物标志物。
本研究证明，虽然 SARS-CoV-2 Omicron 变异株（BA.1、BA.5、XBB）相较于原始毒株表现出对鼻纤毛细胞更强的嗜性并诱导细胞凋亡，但 BA.5 和 XBB 等后续变异株通过下调组装基因并导致运动蛋白缺失，在并未引起纤毛明显丢失的情况下，独特地驱动了严重的纤毛功能障碍。
本研究揭示，新型可变剪接的腺病毒 19K/IX 蛋白通过与衣壳蛋白 pIX 结合并使其稳定，从而阻止其经非经典酪氨酸泛素化介导的蛋白酶体降解，进而促进感染。
本研究通过整合来自不同转录组的基因组，首次对绣球环斑病毒进行了全面的全球性分析，揭示了具有特定宿主和组织嗜性的两个不同系统发育谱系，以及驱动其进化的关键分子适应机制。
这项针对埃塞俄比亚的系统综述与荟萃分析表明，入侵蚊种斯氏按蚊（*Anopheles stephensi*）已迅速成为该国主要的疟疾媒介，其在部分地区的占比已升至51%-73%，亟需根据不同地理区域的生态差异实施针对性的城市疟疾防控策略。
该研究通过对多种陆生蟹类的宏基因组分析发现，其肠道微生物群落结构主要由宿主属决定，且不同蟹属通过独立招募具有相似功能的微生物，实现了木质纤维素降解能力的趋同进化。