Comprehensive characterization of Plasmodium vivax antigens using a high-density peptide array
该研究利用包含 420 万条肽段的高密度肽阵列，全面鉴定了 283 种在症状性疟疾患者中普遍具有免疫原性的间日疟原虫蛋白，并揭示了无症状个体针对 PIR 蛋白的独特抗体反应模式，为开发新的疟疾检测工具和疫苗候选物提供了重要资源。
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microbiology
826 篇论文
Structural diversification of phage tail fibres enables recognition of diverse type IV pili
该研究通过结合比较基因组学与结构功能分析，揭示了噬菌体尾丝受体结合结构域的模块化多样化是其克服宿主铜绿假单胞菌IV型菌毛受体快速进化、维持感染能力的关键结构机制。
Large-scale recovery of integron cassettes for gene discovery screens
该研究通过重工程化 I 类整合子开发了“集子收集器”和“猎手”两种工具，能够高效、特异性地从细菌基因组或环境 DNA 中大规模回收未表征的整合子基因盒，并成功利用这些文库筛选出包括五种新发现的噬菌体防御系统在内的多种功能基因。
Activation-independent capture of free fatty acids at the bacterial cell envelope by BrtB
该研究揭示了蓝细菌 Synechocystis salina 中的 BrtB 酶无需预先激活即可在细胞包膜处直接捕获外源游离脂肪酸并将其转化为巴托洛西德脂肪酸酯，从而阐明了一条独特的外源脂肪酸摄取与代谢途径。
Gain and Loss of Acquired Doxycycline Resistance in Lactiplantibacillus plantarum: An Adaptive Laboratory Evolution Study
本研究通过 1000 代适应性实验室进化实验发现，植物乳杆菌在亚致死剂量多西环素胁迫下可快速获得约 4 倍的耐药性且该性状在撤除压力后迅速丢失，全基因组测序进一步揭示这种可逆耐药性主要与核糖体蛋白 S10 编码基因 rpsJ 中出现的特定单核苷酸变异有关。
Microscale spatial fragmentation promotes bacterial survival under antibiotics
该研究通过理论模型与微滴实验证实，微尺度空间碎片化能通过减缓细菌生长和限制抗生素进入细胞等物理机制，在不依赖基因突变或群体保护的情况下，显著促进细菌在抗生素环境中的存活。
Precise loading of scarce reagents on droplet microarrays
本文提出了一种名为 SVL 的新型加载装置，通过压力补偿的喇叭形储液池几何设计，解决了液滴微阵列中稀缺试剂加载不一致和死体积大的问题，实现了仅需微量材料即可进行高精度、高通量的筛选实验。
Fmr1 mutation reshapes gut microbiome structure, diversity, intestinal barrier integrity, and function in a sex and genotype-dependent manner
该研究利用 Fmr1 敲除小鼠模型发现，Fmr1 基因突变以性别和基因型依赖的方式重塑肠道微生物群结构，导致雌性小鼠肠道屏障完整性受损及上皮屏障功能改变。
Trifluoperazine exhibits broad-spectrum antiviral activity against arboviruses
本研究证实，已获 FDA 批准的精神病药物三氟拉嗪（TFP）通过诱导 eIF2α磷酸化和适应性内质网应激反应，在体外及体内模型中展现出针对日本脑炎病毒、登革热病毒和基孔肯雅病毒等多种虫媒病毒的广谱抗病毒活性，表明其具有作为广谱抗病毒候选药物的巨大潜力。
Loss of Mycobacterium marinum ESX-1 genes increase transcription of ESX-6 genes
该研究通过基因组和转录组分析发现，Mycobacterium marinum 1218S 菌株因缺失 ESX-1 基因导致 ESX-6 基因转录上调，且 lsr2 基因扩增及 Ms1 RNA 对 LOS 基因的调控影响了 LOS 基因表达与生物膜形成，进而决定了其光滑菌落表型。
Cooperative siderophore use stabilizes a protective leaf microbiome
该研究揭示，植物叶片微生物群中酵母与细菌通过协作交换铁载体（如红锈素），不仅维持了群落稳定性，还通过激活植物防御反应来共同抵御病原菌感染。
The osteoclast intracellular environment fosters bacterial growth during Staphylococcus aureus infection
该研究通过双物种转录组分析发现，破骨细胞通过上调谷氨酰胺摄取等营养供给并延缓抗菌反应，为金黄色葡萄球菌提供了利于其利用糖酵解等代谢途径进行胞内增殖的微环境。
Cultivation-based identification of microorganisms in metalworking fluids and their role in hydrocarbon degradation
该研究通过对两台机器中金属加工液的培养分析，鉴定出 27 种细菌和 1 种真菌（其中 20 种为首次发现），并深入探讨了这些微生物的生长、健康风险、污染途径及其在烃类降解中的代谢作用。
Component A2 is a redox-sensitive archaeal ATPase activated by methyl-coenzyme M reductase
该研究通过生化证据证实，组分 A2 是一种受甲基辅酶 M 还原酶（MCR）激活的氧化还原敏感型古菌 ATP 酶，其独特的 N 端锌结合结构域对 ATP 水解至关重要，从而揭示了其通过驱动构象变化来促进 MCR 还原激活的新机制。
Biophysical Constraints Dictate the Stability of Social Traits in Pseudomonas aeruginosa Aggregates
该研究揭示铜绿假单胞菌细胞表面的疏水性差异通过驱动微米尺度的相分离和空间隔离，物理性地限制“欺骗者”获取公共物品，从而在慢性感染环境中维持了合作行为的稳定性。
Protection of algae grown for biofuel using a consortium of environmentally harvested bacteria
该研究证明，利用环境采集的细菌与绿藻共培养可显著降低藻类生物燃料作物因真菌感染导致的损失，从而在不增加成本的情况下提高其经济可行性。
Odoribacter splanchnicus mitigates pathogen-induced gut inflammation and its associated pathogenesis via its secreted bacteriocin
该研究揭示了肠道共生菌 *Odoribacter splanchnicus* 通过分泌一种具有广谱抗菌活性的细菌素，能够有效抑制沙门氏菌和单核细胞增生李斯特菌等食源性病原体的生物膜形成、细胞内增殖及毒力基因表达，从而减轻肠道炎症并保护肠道屏障功能，展现出显著的预防和治疗潜力。
FabF-FadM Cooperate to Recycle Fatty Acids and Rescue ΔplsX Lethality in Staphylococcus aureus
该研究发现，金黄色葡萄球菌中 FabF 与 FadM 蛋白通过协作促进脂肪酸从合成中间体中提前释放，从而利用内源性脂肪酸来源绕过 PlsX 依赖性，挽救ΔplsX 突变体的致死性并维持膜磷脂合成稳态。
Developing and Benchmarking One Health Genomic Surveillance Tools for Influenza A Virus in Wastewater
该研究通过基准测试比较了四种针对废水中流感病毒 A 的全基因组测序富集方法，发现定制的 HA 瓦片扩增子面板在检测已知季节性变异株方面具有灵敏、快速且经济的优势，而探针捕获法虽对 RNA 降解更具韧性但成本较高，同时证实超滤浓缩法优于大体积直接提取，从而为将流感病毒基因组监测纳入常规废水监测体系提供了关键依据。
Cotton fabrics functionalized with hydroxyl-rich graphene derivatives and silver nanowires: washing resistance and preliminary antibacterial activity against Escherichia coli
本研究通过浸涂法将富含羟基的石墨烯衍生物与银纳米线负载于棉织物表面，证实了该复合涂层在多次洗涤后仍具有部分保留能力，并展现出对大肠杆菌的初步抗菌活性。