Female-enriched Eggerthella lenta drives neuroinflammation and IFN-γ via host receptor TLR2
该研究通过多队列荟萃分析和动物模型证实，女性富集的肠道细菌Eggerthella lenta通过宿主TLR2受体驱动IFN-γ产生及神经炎症，从而解释了自身免疫性疾病中性别差异的潜在机制。
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microbiology
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微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
Gist.Science 实时追踪并处理来自 bioRxiv 的每一个最新预印本，确保您不会错过任何前沿突破。我们不仅提供详尽的技术解读，更将晦涩的专业术语转化为通俗易懂的中文摘要，帮助不同背景的读者轻松理解研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文精选，带您即刻开启微观世界的探索之旅。
Selective effects of cyclin dependent kinase inhibitors in gammaherpesvirus reactivation from latency
该研究利用小鼠γ疱疹病毒模型发现，广谱 CDK 抑制剂能抑制病毒从潜伏期再激活及裂解性复制，而 CDK 4/6 抑制剂的效果则取决于给药时机（同步给药抑制、预先给药促进），表明这些抑制剂具有治疗相关癌症的潜力，但需根据细胞状态和用药顺序进行优化。
BertMS-enabled molecular networking for unknown compounds dereplication
本文提出了一种基于 BERT 架构的 BertMS 框架，通过从大规模 MS/MS 数据中学习碎片离子的上下文表示，显著提升了谱图相似度评估的准确性，从而优化了分子网络和未知化合物去重复鉴定。
HAC1 contributes to stress adaptation and virulence in the emerging fungal pathogen Candida auris
该研究通过体内转录组分析鉴定出未折叠蛋白反应调节因子 HAC1 是白色念珠菌（Candida auris）的关键毒力基因，其通过非经典剪接机制响应内质网应激，对真菌的耐热性、宿主适应性及致病性至关重要。
Carbon and nitrogen availability affect biofilm growth and morphology of the extremotolerant fungus Knufia petricola
该研究表明，耐极端环境的真菌*Knufia petricola*在碳氮营养受限时会通过增加生物膜渗透性来转向探索性生长，且其生物量碳氮比具有可塑性，揭示了真菌资源获取的普遍模式。
Cost and benefits of gene amplification-mediated antibiotic resistance
该研究通过构建固定基因扩增拷贝数的临床肠杆菌菌株，揭示了基因扩增介导的抗生素耐药性具有高度情境依赖性，其耐药水平随拷贝数增加而提升，但伴随着无药环境下的生长代价以及在高浓度抗生素下易被快速杀灭的生存权衡。
Biodegradation of components from an oxidized polyethylene by a Rhodococcus strain isolated from the gut of Atlantic Salmon
本研究鉴定了从大西洋鲑鱼肠道中分离出的红球菌 ASF-10 菌株，证实该菌株能通过特定的酶系（如烷烃单加氧酶和 Baeyer-Villiger 单加氧酶）有效降解氧化聚乙烯产生的低分子量衍生物，为利用鱼类肠道微生物修复氧化微塑料污染提供了新的科学依据。
Efficient plasmid-based rescue of T7 RNA polymerase-driven calicivirus reverse genetics systems in mammalian cells using vaccinia virus RNA capping enzymes
本研究开发了一种新型质粒救援系统，通过共表达痘病毒加帽酶（D1R 和 D12L）及 T7 RNA 聚合酶，显著提高了哺乳动物细胞中鼠诺如病毒（MNV）的拯救效率及病毒滴度，为评估病毒突变体提供了一种稳健且高通量的方法。
High specificity meets genomic flexibility in the Siphamia-Photobacterium symbiosis
该研究通过长读长基因组测序和功能分析揭示，尽管温带和热带笛鲷（Siphamia）宿主均严格特异性地结合发光细菌 Photobacterium mandapamensis，但该共生菌在菌株水平上展现出显著的基因组可塑性（如移动遗传元件扩张和辅助基因差异）及表型灵活性（如发光强度变化），证明了宿主在维持严格共生特异性的同时，共生伙伴具备适应环境变化的基因组弹性。
MATRIX: Rapid Quantification of Total and Active Microbial Cells with Single Cell Phenotypes for Environmental Microbiomes
该研究提出了一种名为 MATRIX 的高效工作流程，通过整合样本提取、荧光染色、自动显微成像分析及贝叶斯统计推断，实现了对环境微生物群落中总细胞数、活性细胞及单细胞表型的快速、直接且可重复的定量分析，从而克服了传统间接方法的局限性并深化了对微生物生态响应的机制理解。