Characterization of the alfalfa pollen virome
本研究利用高通量测序技术，对美国普罗斯尔 USDA-ARS 育种项目中选育的抗真菌苜蓿基因型的花粉进行了病毒筛查，旨在阐明苜蓿花粉介导的病毒垂直传播及其在作物流行病学中的潜在作用。
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microbiology
499 篇论文
微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
Gist.Science 实时追踪并处理来自 bioRxiv 的每一个最新预印本，确保您不会错过任何前沿突破。我们不仅提供详尽的技术解读，更将晦涩的专业术语转化为通俗易懂的中文摘要，帮助不同背景的读者轻松理解研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文精选，带您即刻开启微观世界的探索之旅。
Taxonomy-agnostic hyperspectral-morphological phenotyping of fungal pathogen chemical-stress responses using machine learning
该研究提出了一种结合高光谱成像、形态学特征与机器学习的分类无关工作流，通过标准化化学胁迫成功以 86.7% 的准确率区分了不同作物来源的*Colletotrichum*真菌菌株，为无需 DNA 测序的快速抗真菌筛选提供了新范式。
Diversity and stability of the gut microbiome of naked mole-rat (Heterocephalus glaber), the longest-lived rodent
该研究通过 16S rRNA 和宏基因组测序分析发现，裸鼹鼠的肠道微生物群落具有独特的多样性与跨年龄稳定性，富含产甲烷古菌及类似反刍动物的植物细胞壁降解酶，这些特征可能与其低代谢率和超长寿命密切相关。
A Python module for programmatic access to TrypTag genome-wide subcellular protein localisation data in Trypanosoma brucei
本文介绍了一个用于程序化访问锥虫（Trypanosoma brucei）全基因组亚细胞定位数据 TrypTag 的 Python 模块，该工具支持按基因 ID 和标签末端检索图像及细胞掩膜、按定位搜索数据库，并辅助细胞周期与形态分析，同时通过揭示鞭毛与细胞核在分裂过程中的不对称性差异验证了其有效性。
Characterisation of naturally occurring MERS-CoV Spike mutations and their impact on entry and neutralisation.
本研究通过构建假病毒系统，鉴定并表征了 MERS 冠状病毒刺突蛋白中 15 种天然存在的单核苷酸多态性，发现其中部分突变（如 I529T、E536K 和 L745F）增强了病毒进入能力，而另一些突变（如 L411F、T424I 等）则提高了对血清中和的抗性，从而为评估该病毒持续进化的公共卫生风险及开发医疗对策提供了关键依据。
Aurora vent field is a hotspot for microbial hydrogen oxidation in the Arctic Ocean
该研究首次通过宏基因组学揭示了北极 Aurora 热液喷口场中微生物利用丰富氢气进行能量代谢的广泛潜力，发现包括 Zetaproteobacteria 和 Aquificota 在内的多种类群均具备氧化氢的能力，且这种能力在兼性自养和异养微生物中普遍存在，从而重塑了对富氢深海热液系统微生物群落结构与碳循环的理解。
A protocol for chemical competence in phytopathogenic Ralstonia
本文介绍了一种通过氯化钙诱导化学感受态来转化青枯菌（Ralstonia solanacearum）物种复合体菌株的完整方案，包括详细的操作步骤、试剂配方、针对四种菌株的转化效率定量数据以及方案开发的逻辑依据。
In vitro exposure to non-antipseudomonal antibiotics (NAPA) induces Pseudomonas aeruginosa resistance to antipseudomonal antibiotics (APA)
该研究表明，亚抑制浓度的非抗假单胞菌抗生素（NAPA）暴露可通过调控基因（如外排泵和β-内酰胺酶相关基因）的趋同进化，在铜绿假单胞菌中可重复地诱导并维持针对抗假单胞菌抗生素的遗传性耐药性，从而挑战了此类药物对铜绿假单胞菌耐药性无影响的临床假设。
Phenotypic diversity of yeasts curated in the 5th edition of The Yeasts: A data-driven visualization approach
该研究基于《酵母菌》（第 5 版）中约 1300 种酵母的表型数据，通过数据驱动可视化揭示了酵母代谢多样性的显著系统发育结构，指出子囊菌（如模式生物）多表现为糖利用特化型，而担子菌则呈现更广泛的碳源利用能力，从而将酵母重新定义为具有丰富生态适应性的代谢多样性真菌群体。
Environmental filtering drives cryptic diversity and shifting interaction networks across lake, ephemeral pond, and desiccated microbial mat communities in the Untersee Oasis, East Antarctica
该研究揭示了南极 Untersee 绿洲中细菌与真核微生物在环境过滤、扩散限制及种间互作网络（从水体的互利转向干旱下的竞争）上存在显著的分异策略，阐明了极端环境下微生物群落组装与生态系统连通性的关键机制。