Ripples of Resistance: Unveiling Antimicrobial Resistance Dynamics Along Switzerland's Aare River
该研究通过高分辨率空间调查揭示，瑞士阿勒河下游抗生素抗性基因（ARGs）的丰度显著增加主要受污水处理厂排放驱动，而湖泊则具有明显的稀释净化作用，从而为大型河流系统的抗微生物耐药性动态提供了首个详细基线数据。
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microbiology
794 篇论文
Mutations and predicted glycosylation patterns in respiratory syncytial virus isolates correlate with disease severity.
该研究通过对 2022-2023 年冬季住院婴儿的呼吸道合胞病毒（RSV）分离株进行基因组和结构分析，发现特定氨基酸突变及 G 蛋白糖基化位点的增加与疾病严重程度及体外复制能力增强密切相关，揭示了病毒适应性突变在致病性中的作用。
Comparative genome analysis of Corynebacterium ulcerans Japanese isolates revealed domestically and globally diverse geographical distribution of the organism of different types.
该研究通过对日本分离的棒状杆菌进行全基因组比较分析，揭示了该菌种（包括C. ulcerans和C. ramonii）在日本及全球范围内具有独特的地理分布和谱系特征，其中日本分离株以罕见的ST337型为主，且序列型与携带白喉毒素基因的前噬菌体类型相关，部分病例提示存在动物向人类的传播。
Blockade of Tim-3 pathway in a mouse model of Toxoplasmosis: impact on brain leukocyte infiltration, parasite burden, and neuroinflammation
该研究证明，在慢性弓形虫感染的小鼠模型中，阻断 Tim-3 信号通路可增强免疫反应、促进脑内白细胞浸润并显著降低组织包囊负荷，从而为治疗脑部寄生虫感染提供了新的策略。
Secretome analysis of Bacillus toyonensis Bto_UNVM-42 reveals extracellular pesticidal protein homologs and enzymes consistent with its nematicidal activity.
该研究通过分泌组分析揭示了芽孢杆菌 Bto_UNVM-42 的细胞外液中存在杀虫蛋白同源物及多种降解酶，挑战了此类蛋白仅存在于胞内晶体中的传统观点，并阐明了其线虫致病性的分子基础。
Ecological Role of the Heterotrophic Protist Aurantiochytrium (Labyrinthulomycetes) as a Key Consumer of Viral-Induced Dissolved Organic Matter Following the Lysis of the Red Tide-forming Microalga Heterosigma akashiwo
该研究通过现场监测与实验证实，异养原生生物 Aurantiochytrium 能够利用赤潮藻 Heterosigma akashiwo 病毒裂解后释放的溶解性有机物进行生长，从而在有害藻华崩溃后的碳循环及微生物食物网能量传递中发挥关键作用。
Development and validation of two economical and flexible immunoassays for detecting antibodies against LCMV in mouse serum
本文开发并验证了两种经济、灵活且高通量的免疫测定法（细胞印迹免疫测定法和条带免疫印迹测定法），用于检测小鼠血清中的淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）抗体，从而为研究啮齿类动物宿主免疫反应、增强人畜共患病毒传播理解及提升疫情应对能力提供了可扩展的工具。
Engineered Lactate Catabolizing Probiotics Reveal Timescale Dependent Microbiome-Host Metabolic Coupling
该研究利用工程化乳酸氧化酶益生菌揭示了肠道乳酸代谢对宿主能量平衡的时程依赖性调节作用：急性干预通过重塑微生物组功能耦合提升了宿主能量消耗并改善脓毒症预后，而慢性干预虽能持续降低血乳酸却无法克服稳态机制以逆转肥胖进程。
Single-cell genomics reveals opportunistic Enterobacterales carrying putative cationic antimicrobial peptide resistance genes in red crown rot-affected soybean rhizoplanes
该研究通过结合单细胞基因组学等技术，揭示了大豆红根腐病导致根际细菌群落重组，并特异性富集了携带阳离子抗菌肽抗性基因（dlt 基因）的机会性肠杆菌目菌群。
Comparative analysis of flavivirus sfRNA dynamics and secondary structure
该研究利用数字微滴 PCR 和 SHAPE-MaP 技术比较了多种蚊媒黄病毒 sfRNA 的体内与体外二级结构，发现两者整体相似但存在局部差异，表明 sfRNA 在细胞内的相互作用较少、主要通过碱基配对发生或具有高度瞬时性。
Gel-forming fibres differentially modulate inulin fermentation: A comparison of psyllium and methylcellulose in in vitro colonic models
该研究通过体外结肠模型发现，与甲基纤维素相比，洋车前子形成的凝胶能增强微生物对菊粉的接触与发酵，从而促进代谢产物生成并刺激肠道激素分泌，揭示了其缓解肠易激综合征症状的潜在机制。
Butyrate synergizes with glucose to promote anaerobic growth of Staphylococcus aureus via anaplerotic metabolism and stress response pathways
该研究揭示了短链脂肪酸（如丁酸盐）对金黄色葡萄球菌的影响取决于营养环境：在葡萄糖等糖类充足时，丁酸盐通过激活回补代谢和应激反应途径与葡萄糖协同促进细菌厌氧生长及生物膜形成，而在缺乏糖类时则抑制其生长。
Epigenomics identifies three sources of DNA methylation in Streptococcus mutans UA159
该研究利用牛津纳米孔测序技术，在变形链球菌 UA159 中系统鉴定了由 DpnII 系统、I 型限制修饰系统以及新型孤儿甲基转移酶 DnmA 介导的三种 DNA 甲基化来源，并揭示了这些表观遗传修饰通过复杂的遗传互作网络调控生物膜形成及种间竞争等生理功能。
Dynamic winter microbial communities shape nitrogen cycling potential in Arctic tundra soils
该研究揭示北极冻原土壤微生物群落并非在冬季停滞，而是经历显著的重构与动态变化，进而驱动了季节性有机质分解与无机氮循环功能的差异，且积雪 regime 的差异进一步调节了这些过程的时间与强度。
Myrmecocystus honeypot ants have species specific resident gut microbiome
该研究通过 16S rRNA 基因测序发现，蜜蚁（Myrmecocystus）属不同物种拥有独特的肠道微生物组，其储蜜工蚁（repletes）的作物中富含乳酸菌、醋酸菌和嗜盐菌，暗示这些微生物可能在防止高糖液体腐败方面发挥关键作用。
Extracellular membrane vesicles - previously unrecognized components of Staphylococcus aureus biofilms
该研究利用滴流生物膜系统证实，金黄色葡萄球菌生物膜中产生的细胞外膜囊泡（MVs）富含 DNA 及多种蛋白，不仅能抵抗酶解，还能在 DNase 或蛋白酶 K 处理后恢复生物膜的形成与完整性，表明其是生物膜基质的重要来源并促进生物膜构建。
A joint Bayesian framework for modeling Plasmodium vivax transmission
该研究利用联合贝叶斯潜在变量模型，整合了埃塞俄比亚三项研究的个体数据，在考虑测量误差的同时揭示了间日疟原虫密度、配子体密度与蚊子感染风险之间的复杂关联，表明配子体密度是驱动传播的关键因素，而无性期原虫密度也提供了额外的预测信息。
Quorum sensing and capsule expression enable subpopulation evasion of phage killing in Escherichia coli ST131: Implications for targeted therapy
该研究揭示了大肠杆菌 ST131 通过群体感应和荚膜表达在尿液环境中逃避噬菌体杀死的机制，并据此开发了一种结合降解多糖的噬菌体鸡尾酒、多受体靶向及特定碳源添加的理性治疗策略，成功实现了对尿液环境中该耐药菌株的有效清除。
Proviral dynamics and HIV-1C viral diversity in the context of HIV-TB co-infection
该研究指出，尽管结核分枝杆菌共感染未显著改变 HIV 前病毒载量，但通过驱动免疫激活和病毒多样性增加，显著影响了 HIV-1C 亚型潜伏库动态及耐药突变的出现，强调了在结核病流行区进行基线耐药筛查和多区室监测的重要性。
A MinD-like ATPase couples flagellation and cell division in spirochetes
该研究以莱姆病螺旋体伯氏疏螺旋体为模型，发现一种类 MinD 的 ATP 酶 FlhG 通过动态定位调控 FlhF 和 FliF 的空间分布，从而将细胞分裂与鞭毛组装及运动能力精确偶联。