Disentangling Production and Persistence of Extracellular Virions in Grassland Soils with SIP-Viromics
通过将基因组解析的稳定同位素标记病毒组学方法应用于复湿草地土壤，本研究揭示：尽管第一周内仅有少量胞外病毒颗粒被主动产生，但大多数病毒以稳定的“病毒种子库”形式持续存在，靶向快速复苏的细菌宿主，从而在环境扰动后作为微生物周转和生物地球化学循环的关键遗传库发挥作用。
🦠 Category
microbiology
491 篇论文
微生物学探索着肉眼看不见的生命世界，从维持人体健康的肠道菌群到影响全球气候的海洋细菌，这些微小生命体塑造着地球运转的基石。在这里，我们聚焦于这一充满活力的领域，致力于揭示微观生命如何驱动宏观变化，让复杂的科学发现变得触手可及。
Gist.Science 实时追踪并处理来自 bioRxiv 的每一个最新预印本，确保您不会错过任何前沿突破。我们不仅提供详尽的技术解读，更将晦涩的专业术语转化为通俗易懂的中文摘要，帮助不同背景的读者轻松理解研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文精选，带您即刻开启微观世界的探索之旅。
A Bioinformatic Pipeline for Consensus Taxonomic Classification of Long-Read Amplicons
本文介绍了扩增子共识分类学（ACT）流程及其配套的 ACT-DB 参考数据库，这是一个稳健的工作流程，通过整合多种分类工具，在有效识别新物种和低丰度类群的同时最大限度地减少过度分类，从而为牛津纳米孔长读长扩增子实现更优越的分类学分辨率。
Ticks and tickborne diseases in the upper Midwestern United States: role for citizen science in assessing exposure risk
本研究利用美国中西部上部的公民科学项目绘制蜱虫分布范围，发现尽管美洲钝眼蜱尚未在该地区定殖，但肩突硬蜱成虫却表现出对包括伯氏疏螺旋体在内的多种病原体的高感染率，从而为评估当地蜱传疾病风险提供了关键数据。
A protease-sensing circuit links neutrophil inflammation to virulence regulation in Streptococcus pyogenes
本研究揭示，*Streptococcus pyogenes* 通过 NETosis 过程中释放的蛋白酶感知中性粒细胞炎症，这些蛋白酶降解细菌阻遏蛋白 Vfr 从而诱导毒力因子 SpeB，进而形成一个加剧疾病病理的反馈回路。
A host ATPase essential for rhinovirus replication is an antiviral target with a high barrier to resistance
本研究鉴定出宿主AAA+ ATP酶RUVBL1/2是鼻病毒复制的关键且特异性因子，并证明对其实施药理学抑制可在人类鼻上皮模型中有效阻断该病毒且不诱导耐药性，从而凸显其作为有前景的抗病毒靶点的潜力。
Massilia varians P2-4, A Potential Biocontrol Agent against Pathogenic Pseudomonas aeruginosa in Eriocheir sinensis
本研究将具有广谱溶菌活性的安全有效兼性捕食者*Massilia varians*分离株 P2-4 表征为一种针对中华绒螯蟹（*Eriocheir sinensis*）养殖中致病性铜绿假单胞菌的新型生物防治剂。
Live imaging reveals polarized calcium transients during plant pathogen development and host colonization
本研究利用 MatryoshCaMP8s 生物传感器在卵菌病原体*Phytophthora palmivora*中建立了活体比率型钙成像技术，揭示极化 Ca2+ 瞬变是发育转变和早期宿主定植的重复性特征。
Smartphone-Coupled Phase Contrast Microscopy Combined with Deep Transfer Learning for Candida Species Identification: A Proof-of-Concept Study
这项概念验证研究证明，将智能手机耦合的相位衬度显微镜与深度迁移学习相结合，能够以低成本初步区分念珠菌属物种，利用小型临床分离株组以高召回率正确识别了四种被测试物种中的三种。
A compact Druantia defense clears phage infections via single-stranded DNA recognition and directional duplex unwinding
细菌中的紧凑型 III-A 型 Druantia 防御系统通过利用 DruE 解旋酶识别暴露的单链 DNA 并以 3'至 5'方向将其解旋来清除噬菌体感染，该过程受感染时 DruH 蛋白解离的调控。
A CandiChrome toolkit for multicolor labeling of Candida cells
作者开发了 CandiChrome，这是一种多功能的七荧光素工具包，能够在体外和体内小鼠感染模型中同时追踪多达 21 种不同的白色念珠菌种群，从而弥补了针对该致病真菌的多色成像工具方面的关键空白。