A joint Bayesian framework for modeling Plasmodium vivax transmission
该研究利用联合贝叶斯潜在变量模型，整合了埃塞俄比亚三项研究的个体数据，在考虑测量误差的同时揭示了间日疟原虫密度、配子体密度与蚊子感染风险之间的复杂关联，表明配子体密度是驱动传播的关键因素，而无性期原虫密度也提供了额外的预测信息。
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microbiology
797 篇论文
Quorum sensing and capsule expression enable subpopulation evasion of phage killing in Escherichia coli ST131: Implications for targeted therapy
该研究揭示了大肠杆菌 ST131 通过群体感应和荚膜表达在尿液环境中逃避噬菌体杀死的机制，并据此开发了一种结合降解多糖的噬菌体鸡尾酒、多受体靶向及特定碳源添加的理性治疗策略，成功实现了对尿液环境中该耐药菌株的有效清除。
Proviral dynamics and HIV-1C viral diversity in the context of HIV-TB co-infection
该研究指出，尽管结核分枝杆菌共感染未显著改变 HIV 前病毒载量，但通过驱动免疫激活和病毒多样性增加，显著影响了 HIV-1C 亚型潜伏库动态及耐药突变的出现，强调了在结核病流行区进行基线耐药筛查和多区室监测的重要性。
A MinD-like ATPase couples flagellation and cell division in spirochetes
该研究以莱姆病螺旋体伯氏疏螺旋体为模型，发现一种类 MinD 的 ATP 酶 FlhG 通过动态定位调控 FlhF 和 FliF 的空间分布，从而将细胞分裂与鞭毛组装及运动能力精确偶联。
Enteropathogenic E. coli-mediated Fast and Coordinated Calcium responses regulate NF-kappaB activation
该研究发现，肠致病性大肠杆菌（EPEC）通过 III 型分泌系统释放胞外 ATP，诱导上皮细胞产生由低水平 IP3 介导的、全细胞范围协调且快速的钙离子响应，这种独特的钙信号模式通过抑制 O-GlcNAc 修饰从而下调了 NF-κB 的激活。
Metal-independent effects of calprotectin on cocultures of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus involve alkylquinolone production
这项研究表明，钙卫蛋白（calprotectin）不仅通过金属螯合作用发挥免疫防御功能，其蛋白骨架还能以不依赖金属的方式通过调控烷基喹诺酮（AQ）的产生，进而改变铜绿假单胞菌与金黄色葡萄球菌共培养时的细胞膜重塑及种间相互作用。
Easy-to-use whole-genome sequencing workflows and standardized practices to uncover hidden genetic variation in Synechocystis PCC 6803 wild-type and knock-out strains
该研究通过开发并验证适用于短读长、长读长及混合数据的标准化全基因组测序工作流程，揭示了聚球藻 PCC 6803 野生型菌株间的遗传异质性及敲除突变体中的隐藏变异，并据此提出了一套结合基因组验证与互补实验的标准化表型分析指南，以提升该模式生物遗传研究的可靠性与可重复性。
Mitochondrion-IMC contact sites are critical for cofactor biosynthesis and egress signaling in Toxoplasma gondii
该研究揭示了弓形虫中线粒体与内膜复合物（IMC）通过 LMF1 和 IMC10 蛋白形成的接触位点对叶酸与辅酶 A 等辅因子生物合成及钙离子介导的逸出信号调控至关重要。
Comparative analysis of varicella-zoster virus and herpes simplex virus 1 interaction with epidermal terminal differentiation in primary human keratinocytes models of differentiation
该研究利用人原代角质形成细胞分化模型发现，水痘 - 带状疱疹病毒（VZV）和单纯疱疹病毒 1 型（HSV-1）在分化细胞中的复制均受限制，且两者均能下调分化蛋白 K10 的表达，但 VZV 在复制前即下调 K10，而 HSV-1 的 K10 下调则依赖于病毒完成复制。
Long-read sequencing of Mycobacterial tuberculosis is comparable to short-read sequencing for antimicrobial resistance prediction and epidemiological studies.
这项研究通过对比 508 份结核分枝杆菌样本，证实了基于 R10.4 流动槽和深度学习变异检测的牛津纳米孔（ONT）长读长测序技术在菌株分型、药物敏感性预测及流行病学聚类分析方面，其准确性与作为金标准的 Illumina 短读长测序技术高度一致，达到了监管机构设定的误差阈值，从而使得两种平台的数据可以安全整合用于大规模公共卫生分析。
A cysteine-rich domain of the Cryptococcus neoformans Cuf1 transcription factor is required for high copper stress sensing and fungal virulence
该研究发现，隐球菌转录因子 Cuf1 的 N 端第一个富含半胱氨酸的结构域对其感知高铜胁迫至关重要，且该功能对于限制真菌在感染初期的肺部定植及维持其毒力具有关键作用。
Unveiling a missing component of the atypical type IV secretion system required for natural transformation of Helicobacter pylori
本研究鉴定了幽门螺杆菌中一个此前未知的必需基因 hp1421（编码 VirB11 家族六聚体 ATP 酶，命名为 ComB11），它作为 ComB 型 IV 分泌系统内膜亚复合物的关键组分，对介导该菌摄取外源 DNA 的自然转化过程至关重要。
EBV Triggers a Distinct Antiviral Response in HMC3 Cells
该研究揭示 EBV 病毒颗粒通过抑制人小胶质细胞（HMC3）的干扰素产生并上调促癌基因表达，从而削弱中枢神经系统抗肿瘤免疫反应，这为 EBV 相关中枢神经系统恶性肿瘤的发生机制提供了新的见解。
Actinomarina, resolved
本研究利用牛津纳米孔技术从旧金山湾河口组装了 84 个 Actinomarina 属的完整基因组，首次为该目提供了完整的基因组资源，揭示了其物种多样性、独特的硒蛋白合成机制、广泛的营养缺陷以及基因排列的高度重排特征，并纠正了 NCBI 数据库中大量该属基因组的分类错误。
Pelagibacter, resolved
本研究通过组装 135 个完整的 Pelagibacter 基因组（其中 85% 为新物种），揭示了该海洋最丰富细菌属的完整系统发育框架，阐明了其由通用高变区（HVR）和散在基因岛驱动的开放泛基因组机制，并发现其营养缺陷型具有谱系特异性且标准测序深度会严重低估其多样性。
Complex microbial consortia improve yield and physiological performance of leafy greens under deficit irrigation
该研究表明，由五种功能多样微生物组成的复合菌剂通过改善根系发育、降低萎蔫率及缓解水分胁迫，显著提升了生菜和菠菜在亏缺灌溉条件下的产量与生理表现，为应对水资源短缺提供了有效的生物调控策略。
The anaerobic fungus Caecomyces churrovis produces H2 via a non-bifurcating NADH-dependent enzyme complex
该研究通过基因组、蛋白质组及酶学分析，揭示了厌氧真菌*Caecomyces churrovis*利用由氢化酶与NuoEF亚基组成的非歧化NADH依赖性酶复合物直接产生氢气的新机制，并证实该途径广泛存在于多种厌氧真菌中。
Molecular Identification and Characterization of mobatvirus (Hantaviridae) in Lao PDR
该研究通过在老挝（2023 年 5 月至 2025 年 10 月）对蝙蝠及野生动物市场样本进行分子监测，鉴定并表征了多种新发现的 mobatvirus 变体，揭示了其遗传多样性及潜在的跨物种溢出风险，强调了针对高危人群开展血清学监测的紧迫性。
The fatty acid synthesis pathway is a checkpoint for lipoteichoic acid synthesis in Staphylococcus aureus
该研究揭示了金黄色葡萄球菌中脂肪酸合成途径（FASII）通过调控细胞内甘油磷酸（GroP）的可用性，作为脂磷壁酸（LTA）合成的关键检查点，从而决定磷脂流向是优先合成富含 GroP 的 LTA 还是不含 GroP 的心磷脂。
cDNA-guided functional selection uncovers selective defense systems against RNA phages
该研究利用 cDNA 功能筛选策略在铜绿假单胞菌中系统鉴定出多种针对 RNA 噬菌体的新型防御系统，并发现其中最普遍的 Zws 系统通过其 RNA 内切酶亚基 ZwsA 特异性切割噬菌体基因组，从而揭示了细菌抗病毒免疫的新机制。