🧬 biology
Influence of Inorganic Particle Incorporation on Biofilm Mechanical Stability
本研究表明，将无机颗粒引入生物膜中，通过颗粒与胞外聚合物（EPS）之间的相互作用，显著增强了其机械强度和粘弹性稳定性，从而揭示了传统的无颗粒生物膜模型系统性地低估了现实世界中污垢层的机械韧性。
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q-bio
4086 篇论文
🧬 biology
Beavers on the selection-drift seesaw: imprints of the past and present-day processes on the MHC genes variability in the Eurasian beaver
这项研究表明，欧亚河狸的 MHC 基因多样性受历史上的正向选择和平衡选择的影响，在 20 世纪的人口瓶颈效应下严重减少，并且仅通过近期的种群扩张得到了部分恢复，且未发现当前存在选择作用的证据。
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Long-Term Seagrass Decline and Spatial Reorganization of Blue Crabs in the Indian River Lagoon
由营养富集和气候事件驱动的印第安河泻湖海草长期流失，已导致蓝蟹丰度和体型的显著下降，并引发了种群向泻湖南部空间的重新分布，凸显了蓝蟹对连续植被育幼栖息地的关键依赖。
🧬 biology
Evaluating Computational Tools for CRISPR-Cas9 Design: A Case Study on the TP53 Gene
本研究评估了针对 TP53 基因的三种常用 CRISPR-Cas9 gRNA 设计工具（CHOPCHOP、Benchling 和 IDT），揭示了由于不同的评分算法导致其排名最高的候选序列存在显著差异，并强调了进行多平台交叉验证对于有效基因敲除设计的必要性。
🧬 biology
Proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens reveals candidate intraoperative diagnostic biomarkers for Hirschsprung disease
本研究利用福尔马林固定石蜡包埋组织的蛋白质组学谱分析，鉴定了四个在神经节区域特异性表达的新型候选生物标志物（CTNNA2、EPDR1、NACAD 和 NCAM2），为巨结肠症的术中诊断提供了具有前景的工具。
🧬 biology
Somatic PIK3CA Mutation Status and Gene Expression in Cervical Cancer: A TCGA-CESC Reanalysis
这项针对 TCGA-CESC 的重新分析表明，宫颈癌中的 PIK3CA 体细胞突变与一种广泛的转录特征相关，该特征富集于细胞外基质和局灶粘附通路，而非经典的 PI3K-AKT 信号通路，同时也强调了在纤毛和鞭毛过程方面存在尚未解决的富集现象。
🧬 biology
Context-aware LLM extraction and controlled-vocabulary normalization of GEO transcriptomic sample metadata
本文提出了一种可本地部署的大型语言模型流水线，该流水线能够将非结构化的 GEO 转录组学元数据提取并归一化为组织、疾病状态和处理方法的结构化受控词表标签，实现了高准确度，并显著优于确定性匹配方法。
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Associations between bacteriome and chemical pollutants in indoor dust from Czech households
本研究通过分析来自88个捷克家庭的室内灰尘，揭示了特定细菌属（如*Methylobacterium-Methylorubrum*和*Sphingomonas*）与多种化学污染物（如PAHs和PBDEs）之间的显著关联，表明生物与化学污染物之间的相互作用可能会改变室内健康风险，尽管仍需进一步的机制研究来建立因果关系。
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Comprehensive Comparative Evaluation and Consensus Strategy for CRISPR/Cas9 gRNA Design Targeting the TaDREB1 Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum)
本研究通过对比针对 TaDREB1 基因的五种预测工具，旨在确定一种高度可靠的引导序列并揭示当前算法输出中的关键局限性，从而建立了一套适用于普通小麦中 CRISPR/Cas9 gRNA 设计的稳健共识策略。
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A Computationally De-Risked CD47 Inhibitor for Glioblastoma
本研究展示了一个由计算驱动的药物发现流程，该流程鉴定并工程化了一种新型的、非 Fc 分泌的头足类蛋白质 AOA_UR2_F7P_M16C，其作为一种强效且去免疫原性的 CD47 抑制剂，在治疗胶质母细胞瘤方面具有巨大潜力，同时避免了以往抗体疗法的血液毒性和免疫原性。