q-bio 篇论文 | Gist.Science

本文介绍了近端氨基酸集（Proximal Amino Acid Sets, PAAS），这是一个无监督框架，它将来自蛋白质组规模 AlphaFold 模型的 3D 残基邻域转换为离散且可解释的结构注释词汇表，从而实现有效的蛋白质比较、残基优先级排序以及下游机器学习应用。

本研究确定了从寄生菟丝子属（*Orobanche*）植物中分离出的内生真菌是抗癌酶 L-天冬酰胺酶的有前景的来源，其中长孢交链孢菌（*Alternaria longipes*）SH 25 在 pH 5.0 和 1.5% L-天冬酰胺浓度的特定条件下表现出最佳产量（5.95 U/mL）。

本研究利用全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据，证实了受威胁的温带珊瑚 *Acropora pruinosa* 与其近缘种 *A. aff. divaricata* 之间的遗传差异性，并揭示了其在香港和日本的边缘种群之间存在显著的分化，强调了为这些独特谱系制定单独保护策略的必要性。

本研究表明，整合配对的血浆细胞游离RNA与粪便宏基因组学揭示了精神分裂症中一种独特的、与症状相关的双组分细菌图谱，提供了一种能显著提高疾病分类能力的非冗余微生物特征。

这项研究表明，在尼日利亚阿利莫绍销售的草药制品是多重耐药细菌和可转移耐药基因的重要储库，凸显了加强监管控制和监测以减轻公共卫生风险的紧迫性。

本研究首次利用二代测序技术对砂拉越巴当莱亚河（Batang Layar）的微生物组进行了表征，结果表明，由温度和生化需氧量驱动的季节性变化，比土地利用差异对细菌群落结构及粪便相关属的影响更为显著。

这项研究表明，不同鳞翅目谱系中雌性化 piRNA 位点的反复演化，是由 W 染色体上广泛且独立的 *Masculinizer* 或 *znf-2* 基因同源基因的积累所支撑的，这些基因作为序列层面的预置条件，促成了基于小 RNA 的性别决定系统的出现。

这项研究揭示了黄素单加氧酶（FMOs）并非通过直接代谢毒素，而是通过作为代谢信号枢纽来激活色氨酸-犬尿氨酸通路，从而触发由芳香烃受体（AhR）介导的细胞色素P450（CYP）解毒基因的转录重编程，进而驱动杀虫剂抗性。

本研究利用整合的多组学方法揭示，胶质母细胞瘤细胞对 DNA 损伤反应抑制表现出截然不同的、依赖于辐射质量的系统级适应，其中 X 射线辐照主要抑制中心代谢，而碳离子辐射则通过差异化的激酶信号网络驱动独特的氧化还原和脂质重塑。

本研究提出并验证了一种基于静息态脑电图（EEG）的可重复信息论几何框架（HCFIM），该框架能有效表征并区分阿尔茨海默病、额颞叶痴呆与健康对照组，展示了其作为传统频谱特征的解释性补充，在数据受限的神经退行性疾病筛查中的价值。