Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions
本文介绍了相互作用-标记结构对齐(Interaction-Token Structural Alignment, ITSA),这是一个可解释的框架,它将蛋白质结构转换为残基层面的生化相互作用标记以进行局部对齐,证明了其在捕捉家族级相似性以及在传统基于几何的方法失效之处保留机制上下文方面的有效性。