🧬 biology
Muscle spatial lipidomics identifies early ALS-associated lipid remodeling in presymptomatic SOD1G93A mice
本研究利用空间脂质组学揭示了骨骼肌中纤维类型特异性且具有性别差异的脂质重塑是肌萎缩侧索硬化症（ALS）发病过程中一个早期的、症状前发生的事件，为早期诊断提供了具有前景的组织和血清生物标志物。
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q-bio
1504 篇论文
🧬 biology
Discovery of a Functional Sequon for Chondroitin Sulfate Glycosylation
本研究确定了一个被称为“CS-sequon”的特定氨基酸基序，将其视为软骨素硫酸盐糖基化的关键信号，并证明其插入可以赋予未修饰蛋白以 CS 修饰，并增强其在不同物种中的稳定性和活性。
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HiFi-ST: High-Fidelity Reconstruction of Continuous Spatial Transcriptomic Expression Fields via Conditional Neural Fields
HiFi-ST 引入了一种条件神经场框架，通过将位点（spots）建模为区域观测值并整合多尺度组织特征来重建连续的空间转录组表达场，从而在准确性上显著超越现有方法，并赋能如肿瘤微环境表征等高级下游分析。
🧬 biology
MaEIN2 links ethylene signaling to chlorogenic acid accumulation in mulberry leaves in response to silkworm-feeding
本研究表明，乙烯信号组分 MaEIN2 介导了桑叶中由食草作用诱导的氯原酸积累，从而将蚕的摄食信号与增强的植物防御联系起来，并可能支持蚕的发育。
🧬 biology
Optimized Gradient Boosting Decision Tree Ensembles for Honeybee Toxicity Prediction Using the ApisTox Dataset
本研究表明，通过引入领域特定元特征与分子表征，优化的梯度提升决策树集成模型在 ApisTox 数据集上的蜜蜂毒性预测准确度较现有基准显著提升。
🧬 biology
Global evolutionary pattern and distinct metabolic strategies of sulfur-cycling microorganisms across ecosystems
本研究引入了 DiSuCy，一个经过精心策划的硫代谢基因知识库，旨在揭示不同生态系统中硫循环微生物的进化动态和独特的代谢策略，包括在海洋和人类肠道中发现的新型分类单元和非典型途径。
🧬 biology
Seasonal Dynamics of Microbial Communities, Co-occurrence Networks, and Grazing-Mediated Carbon Flow Characteristics
这项研究揭示了定海湾季节性的环境波动驱动了微生物群落组成、组装过程及网络结构的平行演变，并同时改变了由浮游植物和细菌性浮游生物介导的摄食驱动碳流效率，其中浮游植物始终是主要的碳源。
🧬 biology
WATER: A Framework for Reconstructing Temporal Gene Expression Trajectories and Detecting Molecular Heterochrony Across Development and Disease
本文介绍了 WATER，这是一个通过重建独立的基因表达时间轨迹来检测发育与疾病背景下分子异时性（基因表达失时）的计算框架，揭示了传统阶段匹配比较所忽略的广泛转录重组。
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The organizing unit of GPCR activation-switch architecture: a phylogenetic-scale census
这项研究揭示了 GPCR 激活开关架构并非由配体身份组织，而是由一个涉及离子锁、Tyr5.58 和钠结合口袋残基的协同进化结构网络所组织，该网络利用多样且具有谱系特异性的机制来稳定保守的 DRY 精氨酸。
🧬 biology
Integrated carrying capacity: A holistic approach towards population target setting for conflict-prone threatened wildlife
本研究提出了一个结合生态、生物和社会维度的综合承载力框架，旨在为易发生冲突的受威胁物种建立基于证据且符合特定情境的种群目标，并以中国云南野生亚洲象为例，倡导优先考虑人类耐受度并将土地利用政策与保护目标相统一。