An energy-based model empowers ultra-large virtual screening against 100-billion-scale chemical libraries
该论文介绍了 DrugJEPA,这是一种基于能量的模型,它能够以最先进的准确度对千亿级规模的化学库进行超快速且具有成本效益的虚拟筛选,并在湿实验验证中成功识别出跨多种蛋白质靶点的强效纳摩尔级命中化合物。
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该论文介绍了 DrugJEPA,这是一种基于能量的模型,它能够以最先进的准确度对千亿级规模的化学库进行超快速且具有成本效益的虚拟筛选,并在湿实验验证中成功识别出跨多种蛋白质靶点的强效纳摩尔级命中化合物。
本研究提出了一种数据驱动的系统生物学框架,该框架整合了转录组分析、机器学习和博弈论建模,用以预测胶质母细胞瘤类器官对辐照的进化响应,揭示了缺氧是短期耐药性的关键驱动因素,并展示了此类方法如何优化个性化癌症治疗。
本研究利用一种基于深度学习的声学定位模型,证明了西南印度洋的海底地震事件会导致须鲸觅食半径出现显著且瞬时的收缩,从而揭示了一种直接的地质构造—生物学联系,即声学干扰迫使空间限制,这可能导致局部性的猎物消耗。
这项探索性研究表明,与疾病对照组相比,脓性及病毒性脑膜炎患儿脑脊液中的细胞外囊泡表现出独特的 N-糖基化重塑模式,其特征在于唾液酸化、半乳糖基化和核心岩藻糖基化的特定改变,且这些改变与炎症标志物相关。
本研究表明,CCDC180 是一个在进化上保守的支架蛋白,对于纤毛中央装置中 C1 投影的组装至关重要,因为其在小鼠体内的缺失会破坏纤毛运动和精子发育,从而导致出生后脑积水及完全性男性不育。
这项研究揭示了 M1 型巨噬细胞通过隧道纳米管将线粒体转移至子宫肌层肌细胞,从而通过上调 20α-HSD 来促进 ATP 产生并触发孕酮撤退,进而启动分娩。
本研究表明,尽管胶质淋巴清除主要由内足间隙驱动,但血管周围 AQP4 通过动态水力耦合调节压力-容积平衡及驱动力,在关键程度上调控这一过程,且其功能障碍会显著损害示踪剂的净转运。
本研究表明,通过将多黏菌素 B 九肽 (PMBN) 与克洛桑特尔 (closantel) 相结合,可以藉由使外膜通透化以驱动药物在细胞内的积累,进而导致 ATP 耗竭、代谢崩溃及有效的体内治疗结果,从而恢复对携带 mcr-1 基因的多重耐药性大肠杆菌和沙门氏菌的强效杀菌活性。
本研究首次对血矛线虫(*Haemonchus contortus*)中的短链脱氢酶/还原酶(SDRs)进行了靶向蛋白质组学表征,揭示了性别依赖性的表达模式,并鉴定出特定的 SDR 同工酶在苯并咪唑类抗性菌株中呈组成型过表达,且能被氟苯达唑诱导,这表明它们在抗蠕虫药物适应中可能发挥潜在作用。
本研究表明,全球 302 个植物群落的群落水平细根性状表现出与根系经济空间一致的多维协同作用,其中协作轴主要由土壤肥力驱动,而快–慢轴则由降水和温度等气候因素驱动。