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Epigenetic Age Estimates in Blood Shift by Decades with Cell Population: A Within-Donor Variance Partition Across Two Platforms and Two Study Designs

本研究表明,血液中的表观遗传年龄估计值因所检测的具体细胞群体不同而存在数十年的差异,这种差异大到足以主导生物学信号并干扰跨研究比较,从而确立了细胞组成是一个需要标准化报告的关键方法学变量。

原作者: Frederic Scheer

发布于 2026-07-29
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原作者: Frederic Scheer

原始论文采用 CC BY 4.0 许可(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。 ⚕️ 这是一篇未经同行评审的预印本的AI生成解释。这不是医疗建议。请勿根据此内容做出健康决定。 阅读完整免责声明

生物计时器的巨大混乱

想象一下,你的身体是一座繁忙的城市,在每一个社区(你的组织)里,都有被称为“细胞”的小型工人。多年来,科学家们一直试图构建一个“生物钟”,来告诉我们这座城市老化的速度。他们通过观察一种叫做 DNA 甲基化的化学标签来进行,这就像是在我们的遗传指令上贴上了“便利贴”。随着年龄增长,这些便利贴会以可预测的方式发生变化。通过计算这些标签的数量,研究人员可以估算出你的“表观遗传年龄”——这个数字通常比你的实际出生日期更能预测你的寿命。这已成为研究从心脏病到污染如何影响人类等各种课题的超级热门工具。

但问题在于:几乎所有的这类研究都是使用血液样本进行的,因为血液很容易获取。问题是,“血液”并不只是一种东西。它是一锅由不同细胞类型组成的混乱“汤”——有些是免疫系统的士兵(如 T 细胞),有些是清理小组(如单核细胞),还有些是重型战士(如粒细胞)。科学家们一直把一碗混合的水果沙拉当作一个单一的苹果来对待。他们将使用全血的研究与仅使用特定分离细胞的研究进行比较,并假设结果会是一样的。这篇论文提出了一个简单但令人恐惧的问题:测量你的年龄时,从这锅血液汤中挑选出哪些特定的细胞,真的重要吗?

伟大的细胞大调换

这项由 Frederic Scheer 领导的研究决定用一个聪明的实验来测试这个想法。这就像是一个针对衰老的“盲测”,只不过科学家品尝的不是冰淇淋口味,而是来自同一群人的不同类型的血液细胞。

他们从六名健康的志愿者开始。对于每一个人,他们不仅采集了一份血液样本,还采集了十个不同的版本。他们提取了全血,然后小心地分离出纯 T 细胞、纯 B 细胞、纯单核细胞等等。这就像是将一个人切分成十个不同的“纯细胞”版本,然后询问生物钟:“这个人现在有多大了?”

结果令人震惊。当他们更换细胞类型时,同一个人的估算年龄发生了剧烈的波动。

  • 使用 Horvath 时钟(一种流行的通用型时钟)时,仅仅通过改变细胞,估算的年龄就偏移了中位数 15.6 年
  • 使用 HannumPhenoAge 时钟时,这种偏移更加疯狂:中位数达到了 36.7 年
  • 在 Pheno-Age 时钟的一个极端案例中,仅仅取决于测试哪种细胞,同一个人的估算年龄竟然在 54.0 年 的范围内大幅摆动。

为了让你有个直观的概念:两个陌生人之间的年龄差异通常在 36 岁左右。而这项研究发现,仅仅通过改变你测试的“血液细胞类型”,你就能制造出足以媲美两个不同个体之间差异的“虚假年龄差”。

“年轻”与“年老”的细胞

研究还发现,不同的时钟对“老”或“年轻”细胞的看法各异,且并不总是一致。

  • CD8+ T 细胞(一种免疫细胞)是混乱的主要来源。Hannum 和 PhenoAge 时钟认为这些细胞极其年轻——有时估算的年龄甚至比该人的实际年龄还要年轻 30.9 年!事实上,对于某些人来说,PhenoAge 时钟给出了负数(例如 -3.8 岁),这在生物学上是不可能的,表明时钟完全被数据搞糊涂了。
  • 另一方面,单核细胞(另一种免疫细胞)则始终被读作比该人的实际年龄更“老”。

研究人员还观察了在现实世界中,当科学家交换一种血液样本为另一种时会发生什么。在许多研究中,研究人员可能会在一种组别中使用“全血”(整个汤),而在另一组中使用“PBMC”(仅白细胞)。研究发现,进行这种切换会将 Hannum 时钟的估算值移动中位数 5.6 年,并将 PhenoAge 时钟移动 4.5 年。如果你用全血来对比一组使用分离细胞的患者,你可能会认为这些患者相差近十岁的年龄,而实际上他们可能完全一样。

“多组织”英雄与“仅限血液”失败者

你可能会想:“也许专门针对血液训练的时钟会更擅长处理血液细胞的混合问题。”研究测试了这一想法,并发现这是错误的。

  • 仅在全血上训练的时钟(Hannum 和 PhenoAge)对细胞混合最为敏感,波动剧烈。
  • 在多种不同组织(皮肤、血液、口腔等)上训练的时钟,即 Horvath 多组织时钟,表现得最为稳定。它的偏移量为 15.6 年,但这比 36 年以上的摆动要好得多。
  • 有趣的是,一种在皮肤和血液上共同训练的新型时钟也相当稳定,这表明在多种组织上训练时钟可以使之更耐受细胞混合带来的干扰,尽管它仍然并不完美。

结论

论文得出结论:血液中的表观遗传年龄不仅仅是关于“你”的一个数字,它还是关于“你加上你恰好测试到的特定细胞”的一个数字。细胞类型的影响如此巨大,以至于它可以完全淹没科学家试图寻找的真实的生物学差异。

作者认为,我们不能再忽视血液样本是如何制备的。如果一项研究使用全血,而另一项研究使用分离细胞,那么比较它们就像是在比较苹果和橘子——或者在这种情况下,仅仅因为实验室技术的原因,就把一个 20 岁的人和一个 50 岁的人进行比较。这项研究并不是说这些时钟没用,而是要求科学家必须准确报告他们使用了哪些细胞,因为如果没有这些信息,年龄估算就只是一个猜测。正如论文所言,血液制备应该被视为一个“主要方法学变量”,这意味着它与实验本身同样重要。

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