A Microbial Pathway for Methanesulfonic Acid Biosynthesis from DMSP Expands the Marine Sulfur Cycle
本研究鉴定并表征了一种新型微生物途径,即海洋浮游生物通过氧化二甲基巯基丙酸盐(DMSP)来产生甲磺酸(MSA),从而确立了该化合物此前未知的生物来源,并扩展了我们对海洋硫循环及其在气候调节中作用的理解。
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海洋是驱动地球气候的广阔而沉默的引擎。在这些海水中漂浮的微观生命中,隐藏着一个复杂的硫循环,硫是一种对生命至关重要的元素,也是地球调节自身温度的关键参与者。几十年来,科学家们已经了解了这种硫转化的主要路径之一:微小的海洋植物会产生一种特定的化合物来保护自身,当细菌分解这种化合物时,会释放出一种升入大气的气体。一旦进入大气层,阳光和化学反应会将这种气体转化为一种酸,这种酸有助于形成云,进而将阳光反射回太空。长期以来,人们一直认为这是这种被称为甲磺酸(methanesulfonic acid)的特定酸进入海洋环境的唯一途径,它只能在经过天空的长途跋涉后抵达。
来自耶拿弗里德里希·席勒大学(Friedrich Schiller University Jena)的一个研究小组现在发现了这种酸的第二条完全不同的路径,这一过程完全发生在水下,且不需要大气参与。通过在实验室和野外研究海洋细菌,他们发现这些微生物可以直接在自己的细胞内将一种常见的硫化合物转化为甲磺酸。这一发现重写了海洋硫循环的图谱,表明海洋可以独立于上方的空气,自主产生这种与气候相关的酸。
故事始于一种名为二甲基硫丙酸酯(dimethylsulfoniopropionate,简称 DMSP)的分子。这种物质由浮游植物(构成海洋食物网基础的微型植物)大量产生。它充当了这些植物的一种内部盾牌,保护它们免受盐胁迫和氧化作用的影响。当这些植物死亡或被捕食时,细菌会分解 DMSP。直到目前为止,科学家们认为这种分解有三种方式:细菌可以分裂该分子以释放气体,剥离一个甲基以创造另一种硫化合物,或者将其氧化成一种称为二甲基硫氧丙酸酯(dimethylsulfoxonium propionate,简称 DMSOP)的物质。后者(DMSOP)被已知是一种稳定的中间体,可以被进一步分解成其他化合物,但此前并不认为它会直接导致甲磺酸的生成。
研究人员怀疑这个故事并不完整。他们首先筛选了十六种不同的海洋细菌菌株,以观察哪些能够将 DMSP 转化为 DMSOP。他们发现,包括一种名为 Celeribacter baekdonensis 的细菌在内的几种物种,在完成这第一步时效率极高。为了测试接下来的变化,他们给这些细菌喂食了带有重碳同位素标记的 DMSOP 版本,从而能够极其精确地追踪该分子的去向。当他们在孵育后分析细菌时,发现了一个令人意外的结果:细菌已将标记过的 DMSOP 转化成了一种新的、带有标记的化合物。
利用高分辨率质谱技术(一种通过精确质量识别分子的技术),团队确定这种新化合物就是甲磺酸。这一发现意义重大,因为在此项研究之前,甲磺酸被认为是排他性的大气化学产物,是由二甲基硫(dimethylsulfide)在大气中经阳光氧化而形成的。研究人员证实,细菌不仅仅是在吸收环境中的酸,而是在主动制造它。他们观察到这种酸在细菌细胞内积累,并被释放到周围的水中。
为了理解这种转化是如何发生的,团队分离出了负责该过程的特定酶。他们鉴定了三种被称为 DmdA、DmdC 和 DmdD 的蛋白质,这些蛋白质是细菌分解硫化合物的标准工具箱的一部分。在一系列实验中,他们展示了这些酶如何协同工作,从 DMSOP 中剥离一个甲基并重新排列剩余的部分。这个过程会产生一种高度不稳定的中间体,它会迅速与氧气反应生成甲磺酸。团队通过将纯化的酶与必要的化学辅助因子混合并在试管中观察酸的形成,证明了仅靠生物机械装置就足以驱动该反应。
这一发现的意义远超实验室范围。为了观察这一过程是否发生在真实的海洋中,研究人员分析了取自南极威德尔海(Weddell Sea)的水样,该区域以高生物生产力著称。他们将水分为两个部分:自由漂浮的溶解化学物质和微小生物本身的成分。在这两个部分中,他们都发现了大量的甲磺酸。在某些位置,细胞内的这种酸浓度甚至高于原始 DMSP 的浓度,这表明这种转化过程既快速又高效。溶解水中的酸的存在进一步表明,细菌正在将其释放到环境中,为海洋的化学库存增加了直接的生物来源。
这一发现挑战了长期以来的观点,即海洋中所有的甲磺酸都来自天空。虽然大气沉降仍发挥着作用,但研究表明,海洋细菌是一个主要的、独立的来源。这意味着硫循环比此前认为的更加紧密相连,在微生物代谢与海水化学组成之间存在着直接的联系。这些细菌产生的酸可以被其他微生物用作碳源和能量来源,从而在食物网中创造了一个新的循环。
其对气候科学的影响是深远的。甲磺酸是云凝结核(形成云滴的微小颗粒)形成过程中的关键成分。云层能反射阳光,从而冷却地球。如果该酸的大部分是直接在海洋中生成的,而非来自大气,那么这将改变科学家计算海空之间硫平衡的方式。这表明,海洋自身的生物活动是云层形成和气候调节中比现有模型所预测的更为活跃的驱动力。
通过追踪单个分子从浮游植物细胞中的保护性盾牌到影响气候的酸的路径,这项研究将微观世界的细菌酶与全球尺度的气候动态联系在了一起。它揭示了海洋不仅是大气化学物质的被动接收者,更是这些物质的主动生成者,而这一过程是由其隐形居民的代谢过程所驱动的。这项工作为人类描绘了海洋生命如何塑造地球化学的清晰图景,提醒我们即使是最微小的生物,在地球系统中也扮演着至关重要的角色。
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