Environmental Lodderomyces parapsilosis from Brazil Belongs to a Global Clinical Lineage
对来自巴西废水的一种副念珠菌(*Lodderomyces parapsilosis*)分离株进行的系统发育基因组学分析表明,它属于一个与多个国家的临床分离株共享的全球分布谱系,这凸显了废水是具有临床相关性的菌株的储库,并强调了基因组监测的必要性。
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在我们周围的微观世界中,真菌无处不在。有些是无害的邻居,而另一些则可能导致人类严重的疾病,尤其是在医院中的人群。在这些真菌中,被称为副孢酿酒 yeasts(Lodderomyces parapsilosis)的一类酵母已成为医生们关注的重要问题。这些生物是导致血流感染的主要原因,并日益与医疗机构中的疫情爆发相关联。由于它们可能如此危险,卫生组织已将它们列入全球关注的优先名单。虽然我们知道这些真菌在医院中茁壮成长,但它们也生活在一个更广阔的世界中,存在于土壤、水、昆虫和动物中。这种广泛的存在表明了环境与人类健康之间存在着复杂的联系,即同一种类型的真菌可能会在自然界与人类之间移动。了解这些种群是如何连接的至关重要,尤其是因为废水就像一个“混合碗”,同时收集了来自人类、动物以及周围环境的微生物。
巴西的一个研究小组最近将注意力转向了这个“混合碗”。在里约热内卢的一次监测工作中,他们采集了一份废水样本并分离出了单个酵母细胞。乍一看,这个生物看起来像是一个被称为“耳念珠菌”(Candida auris)的潜在威胁,后者是一种引起全球警报的真菌。当在一种特殊的测试培养皿上生长时,该酵母呈现出浅蓝色,并带有蓝色的圆环,这种视觉特征通常预示着该危险物种的存在。由于在大型城市的废水中发现此类病原体将是一件严重的公共卫生事件,科学家们决定进行更深入的研究。他们没有仅仅依赖外观;相反,他们对该生物的整个遗传密码进行了测序,以准确识别它是什么以及它来自哪里。
基因分析显示,该生物并非耳念珠菌,而是副孢酿酒酵母(Lodderomyces parsalisensis)。更重要的是,遗传密码讲述了一个延伸至里约街道之外的故事。当研究人员将他们的废水样本与来自世界各地的庞大遗传数据库进行对比时,他们发现这一特定菌株属于一个已经在全球范围内建立起来的谱系。这一真菌群体包括了从美国、法国、德国和中国医院采集的样本,以及其他环境样本。这种联系极其紧密。在巴西污水中发现的这种酵母,与美国发现的一个环境样本仅有 27 个微小的遗传差异,与从一名患者身上采集的临床样本仅有 14 个差异。这些数字表明,同一家族的真菌正在跨越海洋,并在不同类型的环境(从一个国家的病床到另一个国家的污水管)之间循环流动。
研究还调查了这种真菌用于生存和致病的特定工具。研究人员检查了已知与药物抗性和粘附表面或形成被称为“生物膜”的保护层相关的基因。他们发现,无论是在医院还是在环境中,该全球谱系中的每个成员都携带完全相同的这些基因版本。这包括有助于真菌生存和粘附表面的蛋白质遗传指令中的特定变化。虽然这些变化的具体影响仍在研究中,但它们在每个样本中的存在表明,这些变化是该类群的一个稳定且具有定义性的特征。这种一致性意味着致病能力并非一种新的或偶然的特征,而是这一谱系在移动于不同地点和宿主时所持久保留的核心特征。
这些发现重塑了我们看待真菌感染传播的方式。数据表明,废水不仅仅是病菌流失的地方,也是具有临床重要性的谱系可以持续存在并旅行的储库。在巴西污水中发现的菌株在遗传上与全球医院中引发疾病的菌株几乎完全相同,这一事实支持了环境与人类医疗保健之间紧密相连的观点。这种联系强化了采取“全健康”(One Health)方法的需求,即将人类、动物和环境健康视为一个单一且相互关联的系统。通过监测废水,科学家们有可能在这些危险真菌引发疫情之前追踪它们的移动,通过观察流经我们城市的流水,为保护公共卫生提供一种新的方式。
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