🦠 Category

microbiology

566 Arbeiten

Die Mikrobiologie erforscht die unsichtbare Welt der Kleinstlebewesen, die unseren Planeten und unseren eigenen Körper prägen. Von den winzigen Bakterien in unserem Darm bis zu komplexen Viren, die globale Gesundheitssysteme herausfordern, beleuchtet dieses Fachgebiet die lebendigen Mechanismen, die oft übersehen werden, aber allesamt fundamental für das Leben sind.

Auf Gist.Science stellen wir sicher, dass die neuesten Erkenntnisse aus dem Preprint-Server bioRxiv für jeden zugänglich sind. Wir verarbeiten jeden neuen Eintrag in diesem Bereich automatisch, um sowohl verständliche Zusammenfassungen für ein breites Publikum als auch detaillierte technische Analysen für Experten bereitzustellen. So bleiben Sie immer auf dem aktuellen Stand der Forschung, ohne sich durch komplexe Fachsprache verlieren zu müssen.

Im Folgenden finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Mikrobiologie, die wir gerade von bioRxiv aufbereitet haben.

🦠 microbiology

A Field-Based Study of Phyllosphere Mycobiomes in Apple Orchards Under Varying Agricultural Management Strategies

Diese feldbasierte Studie zeigt, dass landwirtschaftliche Bewirtschaftungsstrategien (konventionell versus biologisch) die zeitlichen Dynamiken und die Zusammensetzung der Pilzgemeinschaften in der Phyllosphäre von Äpfeln maßgeblich prägen, wobei sie eindeutige Assoziationen mit Pathogenen und gegensätzliche Diversitätstrends aufdecken, die die ökologische Auswirkung der Obstanbauweise auf die Pflanzengesundheit unterstreichen.

Boutin, S., Rondeau-Leclaire, J., Roy, A., Laforest-Lapointe, I.2026-05-21
🦠 microbiology

CUPID-seq enables highly multiplexed amplicon sequencing via combinatorial in-line dual indexing

CUPID-seq ist eine hochmultiplexe Amplikon-Sequenzierungsstrategie, die kombinatorische, phasengleiche, inline-Dual-Indexierung über zwei PCR-Runden hinweg nutzt, um die Kosten auf Hochkapazitäts-Sequenzierplattformen erheblich zu senken und den Probendurchsatz zu steigern, während die eindeutige Probenidentifizierung erhalten bleibt.

Fu, B., Porter, R. L., Shi, H., Ea, A. C., Espeleta, A. M., Ambat, A., Relman, D. A., Huang, K. C., Xue, K. S.2026-05-21
🦠 microbiology

Rapid and Specific Identification of Emerging Trichophyton mentagrophytes Genotype VII Using an In-House Developed and Validated Real-Time PCR Assay

Diese Studie stellt einen schnellen, hochsensitiven und spezifischen hausinternen TaqMan-basierten Echtzeit-PCR-Assay vor, der erfolgreich den neu auftretenden, sexuell übertragbaren *Trichophyton mentagrophytes*-Genotyp VII von anderen verwandten Pilzpathogenen unterscheidet und eine deutlich schnellere Alternative zu herkömmlichen Sequenzierungsmethoden für eine verbesserte Patientenversorgung und Infektionskontrolle bietet.

Zhao, J., Todd, G., Zhu, Y. C., Chaturvedi, S.2026-05-21
🦠 microbiology

Widespread circulation of West Nile and Usutu viruses in sedentary and migratory avifauna: A Two-Year Study (2024-2025) of active surveillance in South of France

Diese zweijährige Studie (2024–2025) im Süden Frankreichs zeigt eine weit verbreitete Zirkulation von West-Nil- und Usutu-Viren bei über 2.500 standorttreuen und ziehenden Vögeln, wobei die Usutu-Prävalenz die West-Nil-Prävalenz übersteigt und die Gesamtinfektionsraten 2024 höher waren, was die entscheidende Rolle gemischter Avifauna bei der Aufrechterhaltung lokaler enzootischer Zyklen sowie die Notwendigkeit einer integrierten ganzjährigen Überwachung zur Minderung von Zoonoserisiken unterstreicht.

Beaubaton, R., Revel, J., Pigeyre, L., Lepeule, A., Joly, J., de Franceschi, C., Charmantier, A., Vollot, B., Simonin, Y (…)2026-05-21
🦠 microbiology

Prophage Abundance Differentiates Clinical and Environmental Isolates of Pseudomonas aeruginosa

Diese Studie zeigt, dass klinische Isolate von *Pseudomonas aeruginosa* im Vergleich zu Umweltisolaten durch kleinere Genome mit höherem GC-Gehalt und eine reduzierte Häufigkeit intakter Prophagen gekennzeichnet sind, was darauf hindeutet, dass diese genomischen Merkmale Kennzeichen einer Spezialisierung auf den menschlichen Wirt darstellen.

Targ, R. W., Blankenberg, P. M., Flamholz, Z., Pourtois, J. D., Burgener, E. B., Milla, C. E., Bollyky, P. L.2026-05-20
🦠 microbiology

Microbial Diversity and Function Linked to Carbon Cycling in Mangrove Sediments

Diese Studie zeigt, dass sich die mikrobielle taxonomische Zusammensetzung zwar über tropische Mangrovensedimente hinweg verändert, die funktionelle Diversität im Zusammenhang mit dem Kohlenstoffkreislauf jedoch konserviert bleibt, sich jedoch mit der Tiefe verschiebt, wobei Desulfobacterota und Chloroflexota als Schlüsseltaxa identifiziert wurden, die die Kohlenstofffixierung und den Kohlenstoffmetabolismus antreiben, um eine langfristige Kohlenstoffspeicherung zu gewährleisten.

Khairi, N., Md Zoqratt, M. Z. H., Hidayah, N., Abdella, B., Mohammad Nasir, M. A., Tan, G. Y. A., Lim, P. E., Amir, A. A (…)2026-05-20
🦠 microbiology

Multi-omics reveals mechanisms behind pathogen inhibition by a microalgal microbiome

Diese Studie wendet einen integrierten Multi-Omics-Ansatz an, um nachzuweisen, dass das Mikroalgen-Mikrobiom von *Isochrysis galbana* den Fischpathogen *Vibrio anguillarum* hauptsächlich durch konstitutive Eisensequestrierung via Siderophorproduktion unterdrückt und damit eine nachhaltige Alternative zu Antibiotika für das Krankheitsmanagement in der Aquakultur bietet.

Smahajcsik, D., Koetsier, R. A., Oluwabusola, E. T., Emidio Almeida, M., Roager, L., Jarmusch, S. A., Schostag, M. D., N (…)2026-05-20
🦠 microbiology

Direct Virus-Bacteria Binding Enhances Streptococcus equi subsp. zooepidemicus Colonisation and Bacterial-Driven Immune Activation During H3N8 Equine Influenza A Virus Co-Infection

Diese Studie zeigt, dass die direkte physikalische Bindung zwischen dem H3N8-Equine-Influenza-A-Virus und *Streptococcus equi* subsp. *zooepidemicus* eine zelltypspezifische bakterielle Besiedelung verstärkt und eine bakteriell vermittelte Immunaktivierung auslöst, die durch erhöhte proinflammatorische Zytokine, aber eine reduzierte Interferon-beta-Expression während einer Koinfektion gekennzeichnet ist.

Alshammari, A. K., Maina, M., Alsuwat, M. A., Blanchard, A. M., Daly, J. M., Dunham, S. P.2026-05-19
🦠 microbiology

Rate of osmotic pressure change in drying saliva microdroplets drives inactivation of surrogate respiratory bacteria

Diese Studie zeigt, dass die Rate der osmotischen Druckänderung während der Effloreszenz trocknender Speichel-Mikrotröpfchen als ein quantitativer, mediumunabhängiger Prädiktor für die bakterielle Inaktivierung dient, wobei schnellere Feuchtigkeitsabfälle zu schwerwiegenderen osmotischen Schocks und einem größeren Verlust der Lebensfähigkeit bei respiratorischen Pathogenen führen.

Medina, T., Luo, B., Peter, T., Wynn, H. K., Kohn, T.2026-05-19
🦠 microbiology

Evaluation of Oxford Nanopore Sequencing for Antimicrobial Resistance Surveillance in Salmonella: Comparison with Phenotypic Antimicrobial Susceptibility in a Large-Scale Study

Diese großangelegte Studie, die die Oxford-Nanopore-Sequenzierung an 1.490 *Salmonella*-Isolaten aus Taiwan bewertet, zeigt, dass zwar die genotypische Resistenz im Allgemeinen mit phänotypischen Ergebnissen korreliert, spezifische Diskrepanzen, die durch Grenzwertdefinitionen, Genexpression und unbekannte Determinanten bedingt sind, jedoch die Notwendigkeit einer sorgfältigen Interpretation unterstreichen, um die Whole-Genome-Sequenzierung als überlegene Alternative zur konventionellen antimikrobiellen Suszeptibilitätstestung für die Überwachung und Therapieanleitung zu nutzen.

Hong, Y.-P., Liao, Y.-S., Wan, Y.-W., Kuo, S.-C., Teng, R.-H., Liang, S.-Y., Chang, J.-H., Wei, H.-L., Chiou, C.-S.2026-05-19