🧬 Category

q-bio

1825 Arbeiten

🧬 biology

Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer

Das Paper stellt CHERISH vor, ein hierarchisch überwachtes Framework für die computergestützte Pathologie, das routinemäßige H&E-Schnitte nutzt, um durch die Einbettung klinischer Testlogik in seine Architektur HER2-Kategorien präzise zu stratifizieren und das Risiko einer ERBB2-Amplifikation vorherzusagen, wodurch die Einschränkungen konventioneller Modelle überwunden und die Notwendigkeit ressourcenintensiver Bestätigungstests reduziert werden.

Xiaohua Zeng, Yansong Ba, Long Wang, Xiaomin Xiong, Xin Zhou, Qingming Jiang, Sihao Liu, Shanqi Li, Zhigang Pei, Tao Zha (…)2026-06-29
🧬 biology

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

Dieses Paper stellt Spec-ReX vor, eine auf kausaler Verantwortlichkeit basierende Methode der erklärbaren KI für die Vibrationsspektroskopie in der Krebsdiagnostik, und validiert deren Leistungsfähigkeit rigoros gegenüber anderen XAI-Techniken über In-silico-, In-vitro- und Ex-vivo-Datensätze hinweg, um den kritischen Bedarf an transparenter klinischer Entscheidungsfindung zu adressieren.

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biology

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

Diese Studie zeigt auf, dass durch Cohesin vermittelte Loop-Extrusion benachbarte Replikationsgabeln koppelt, um deren Verlangsamung und Reversion während des Replikationsstresses zu fördern, indem PRIMPOL gehemmt wird, wodurch die Genomorganisation mit der DNA-Schadenstoleranz integriert wird, um die genomische Stabilität zu schützen.

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
🧬 biology

The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

Die Artemis-I-Mission induzierte genotypabhängige Veränderungen in den Aminosäureprofilen der Samen sowie im Post-Flight-Wachstum von *Arabidopsis thaliana*, was offenbarte, dass der Stoffwechsel verzweigtkettiger Aminosäuren ein kritischer Faktor für die Reaktion von Pflanzen auf die Exposition im tiefen Weltraum ist.

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biology

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

Diese Studie etabliert ein robustes Framework, das UAV-basiertes multispektrales Phänotypisieren und Zeitreihen-Genom-Assoziationsstudien integriert, um dynamische genetische Loci sowie das Kandidatengen *Zm00001d048615* zu identifizieren, welche den Blattflächenindex von Mais regulieren, und bietet damit wertvolle Zielstrukturen für die Verbesserung der Bestandsarchitektur und des Ertrags.

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
🧬 biology

Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

Diese Studie stellt die lang gehegte Ansicht in Frage, dass die Spermiogenese eine globale transkriptionelle Stilllegung beinhaltet, indem sie zeigt, dass das haploide Genom während dieser Phase transkriptionell aktiv und dynamisch organisiert bleibt, was eine Neudefinition der späten Spermatiden-Differenzierung als eine Periode der transkriptionellen Spezialisierung anstatt eines Abschaltens erforderlich macht.

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29
🧬 biology

Daily symptom reports enable four-phase menstrual cycle tracking without wearables: Implications for equitable digital health

Diese Studie zeigt, dass ein hybrides Modell des maschinellen Lernens, das die tägliche selbstberichtete Symptomvariabilität nutzt, vier Menstruationszyklusphasen ohne tragbare Sensoren genau klassifizieren kann und somit eine skalierbare und gerechte Lösung für die globale Überwachung der reproduktiven Gesundheit bietet.

Bernhard Specht, Mohammad EL-Khozondar, Samaher Garbaya, Reinhard Schneider, Djamel Khadraoui, Zied Tayeb2026-06-29
🧬 biology

Efficient exploration of conformational ensembles via protein interaction-informed deep learning

Dieses Paper stellt DynoM vor, ein generatives Deep-Learning-Framework, das auf Protein-Komplex-Interaktionen trainiert wurde und bestehende Monomer-Modelle bei der Vorhersage präziser Konformationsensembles sowie der Unterdrückung struktureller Halluzinationen signifikant übertrifft, indem es die in Komplexdaten inhärenten weitreichenden physikalischen Beschränkungen nutzt.

Zilin Ren, Duo Liu, Qianyi Jia, Qiantong Jin, Yubin Liu, Chan Liu, Zhixiang Sui, Luyao Han, Yixiang Zhang, Xin Yang, Pin (…)2026-06-29
🧬 biology

Delayed downstream detection and persistence of fish eDNA in a low-flow stream: a field observation

Diese Studie liefert Feldbeweise dafür, dass in langsam fließenden Gewässern eDNA-Signale von Fischen eine verzögerte stromabwärts gerichtete Erscheinung aufweisen und für einen gewissen Zeitraum bestehen bleiben, nachdem der Quellorganismus entfernt wurde, was die Notwendigkeit unterstreicht, Transportdynamiken und zeitliche Persistenz bei der Interpretation von eDNA-Daten in Fließgewässern zu berücksichtigen.

KeonHee Kim, KyuJin Kim, JongWook Kim, JaeGoo Kim, Ji-Woong Choi, Min-Ho Jang2026-06-29