PASD1 genetic variation is associated with COVID-19 clinical severity in an admixed Brazilian population: an exploratory genome-wide association study
Diese explorative genomweite Assoziationsstudie in einer admixierten brasilianischen Kohorte identifiziert eine signifikante genetische Variante am PASD1-Locus (rs56035326), die mit einer reduzierten COVID-19-Schwere assoziiert ist, was die erste Evidenz darstellt, die dieses Gen mit Krankheitsverläufen in solchen Populationen verknüpft.
Originalarbeit lizenziert unter CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Dies ist eine KI-generierte Erklärung eines Preprints, das nicht peer-reviewed wurde. Dies ist kein medizinischer Rat. Treffen Sie keine Gesundheitsentscheidungen auf Grundlage dieses Inhalts. Vollständigen Haftungsausschluss lesen
Stellen Sie sich vor, Ihr Körper ist eine riesige, geschäftige Stadt, die unter Belagerung durch einen hinterlistigen Eindringling steht. Manchmal sind die Verteidigungsanlagen der Stadt so stark, dass der Eindringling rausgeworfen wird, noch bevor überhaupt jemand ein Problem bemerkt. Ein anderes Mal geraten die Verteidigungsmaßnahmen in den Übersturm und verursachen Chaos und Schäden, die die ganze Stadt bedrohen. Wissenschaftler nennen diesen Unterschied im Ergebnis „Krankheitsintensität“. Lange Zeit dachten wir, die Hauptgründe dafür, warum manche Menschen sehr krank wurden, während andere nur leichte Verläufe hatten, lägen in Dingen wie dem Alter oder anderen gesundheitlichen Problemen. Aber Forscher haben erkannt, dass unsere internen „Baupläne“ – unsere DNA – ebenfalls eine riesige Rolle spielen. Betrachten Sie die DNA als das Handbuch mit Anweisungen für den Bau der Verteidigungssysteme Ihrer Stadt. Wenn es einen Tippfehler im Handbuch gibt, könnten die Verteidigungen entweder zu schwach oder zu aggressiv sein. Durch das Lesen dieser Baupläne hoffen Wissenschaftler herauszufinden, welche Tippfehler genau den Unterschied zwischen einem milden Fall und einem schweren Verlauf ausmachen, insbesondere in Bevölkerungsgruppen, die bisher kaum untersucht wurden.
Dieses Papier ist wie eine Detektivgeschichte, in der Wissenschaftler eine massive Schnitzeljagd durch die DNA von 73 Menschen in Brasilien durchgeführt haben, um einen spezifischen Hinweis darauf zu finden, warum manche Menschen sehr schwer an COVID-19 erkrankten, während andere es leicht hatten. Die Forscher konzentrierten sich auf eine Gruppe von Menschen mit gemischter Abstammung (einer Mischung aus europäischer, afrikanischer und indigener amerikanischer Herkunft), da die meisten bisherigen DNA-Detektivarbeiten nur Menschen mit überwiegend europäischem Hintergrund untersucht hatten. Sie verwendeten einen Hightech-Scanner, um Millionen winziger Buchstaben (genannt SNPs) in der DNA dieser Patienten zu lesen. Sie verglichen die DNA derjenigen mit milden Symptomen mit der derjenigen mit schweren Symptomen und suchten nach jedem Buchstaben, der in einer Gruppe viel häufiger vorkam als in der anderen.
Die Jagd zahlte sich mit einer großen Entdeckung aus. Die Wissenschaftler fanden einen spezifischen „Tippfehler“ in einem Gen namens PASD1. Stellen Sie sich dieses Gen wie eine Ampelsteuerung für die Immunreaktion des Körpers vor. Die Forscher fanden heraus, dass Menschen mit einer bestimmten Version dieser Ampel (dem „T“-Allel) viel weniger wahrscheinlich schwer erkrankten. Tatsächlich wurde diese Version bei etwa 54 % der Menschen mit milden Fällen gefunden, während sie bei denjenigen, die sehr schwer erkrankten, fast völlig fehlte (nur 5 %). Dies war keine bloße Vermutung; die Mathematik zeigte, dass dieser Zusammenhang extrem stark war, mit einer Wahrscheinlichkeit, dass dies durch Zufall geschah, von weniger als 1 zu 10 Millionen. Dies ist das erste Mal, dass jemand auf das PASD1-Gen als einen entscheidenden Akteur zeigt, wie schwer der Verlauf von COVID-19 wird.
Das Team fand auch einige andere Verdächtige, die vielversprechend aussahnen, wie die Gene DNAH9, ADRA1A und C1ORF132. Diese Gene sind wie andere Teile des Verteidigungssystems der Stadt – eines hilft, die Atemwege zu reinigen, ein anderes kontrolliert den Blutfluss und ein weiteres hilft Zellen, miteinander zu kommunizieren. Als die Wissenschaftler jedoch die Zahlen erneut prüften, um sicherzustellen, dass sie nicht Dinge sahen, die gar nicht da waren, hielten diese anderen Hinweise jedoch nicht so stark stand wie der von PASD1. Sie sind immer noch interessante Hinweise, aber sie müssen weiter untersucht werden, um zu beweisen, dass sie echt sind.
Es ist wichtig zu bedenken, dass diese Studie eine „explorative“ Studie ist, was bedeutet, dass es so ist, als würde man einen neuen Pfad in einem Wald finden und sagen: „Hey, dieser Pfad sieht interessant aus!“ anstatt zu sagen: „Wir haben den gesamten Wald kartiert.“ Die Gruppe von Menschen, die sie untersuchten, war relativ klein, nachdem sie Familienmitglieder entfernt hatten, um die Daten sauber zu halten, sodass, obwohl der Befund zu PASD1 sehr stark ist, die Wissenschaftler vorsichtig darauf hinweisen, dass andere Forscher dies in größeren Gruppen überprüfen müssen, um absolut sicher zu sein. Sie wissen auch noch nicht genau, wie dieses Gen arbeitet; sie wissen nur, dass das Besitzen dieser spezifischen Version des Gens wie ein Schutzschild gegen die schlimmsten Teile der Krankheit wirkt. Diese Studie ist ein entscheidender erster Schritt, der uns zeigt, dass die Betrachtung diverser Populationen neue Geheimnisse über unsere Biologie offenbaren kann, die wir vielleicht übersehen hätten, wenn wir nur eine Art von Gruppe betrachtet hätten.
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