302 artículos
La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.
En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.
Este artículo presenta edENM, un modelo de red elástica refinado mediante dinámica esencial y parametrizado a partir de simulaciones de dinámica molecular, que permite estudiar con precisión la flexibilidad y las transiciones conformacionales funcionales del ADN, ARN y sus complejos con proteínas.
El artículo presenta SAP (Segment Any Plant), un marco de aprendizaje profundo basado en el modelo SAM2 que permite la segmentación precisa y sin entrenamiento específico de imágenes de series temporales de plantas, facilitando así el análisis cuantitativo del crecimiento y la morfología vegetal en diversos contextos experimentales.
Mediante la combinación de imágenes en vivo y modelado computacional en embriones de *Drosophila*, el estudio demuestra que la formación de los "hubs" de factores de transcripción es una propiedad emergente de la cinética de unión al ADN dictada por la secuencia del potenciador, en lugar de ser un mecanismo que aumente directamente la ocupación de los objetivos o el comportamiento de los brotes transcripcionales.
Este artículo presenta una escalera de proteínas modular diseñada para estandarizar y armonizar las mediciones de FRET en diversas plataformas y sistemas de expresión, permitiendo la traducción precisa de distancias moleculares entre entornos in vitro e intracelulares.
Este estudio presenta un modelo matemático discreto y su límite continuo para simular el crecimiento de tejidos biológicos controlado por la curvatura, donde las interacciones mecánicas celulares generan un comportamiento de difusión-reacción que reproduce experimentalmente el alisamiento de la interfaz del tejido.
Este estudio demuestra que la introducción de una prolina en el sitio 2 del enlace M2-M3 de la subunidad α1 de los receptores GABAA α1β2γ2 actúa como un freno molecular que, al liberarse, sesga el canal hacia un estado activado, aumentando su sensibilidad al GABA y su actividad espontánea.
Este estudio presenta a "Chlamylipo", un micro-nadador biohíbrido que encapsula a la alga *Chlamydomonas reinhardtii* dentro de un liposoma gigante, demostrando que la deformación periódica de la membrana lipídica permite transmitir la fuerza de propulsión flagelar al fluido externo, logrando así un movimiento autoimpulsado y controlado fototácticamente.
Mediante simulaciones de dinámica molecular, este estudio revela que los condensados transcripcionales formados por Nanog, Oct4 y Sox2 exhiben propiedades emergentes no aditivas donde, en presencia de ADN, se establece un mecanismo sinérgico de "entregador-receptor" que organiza espacialmente a las proteínas y aumenta la concentración de ADN en los condensados que contienen a Oct4, constituyendo así una capa adicional de regulación génica.
Este estudio demuestra que la constricción del túnel de salida ribosómico no es una estructura estática, sino una puerta flexible que se adapta dinámicamente a la presencia y composición del péptido naciente, lo que tiene implicaciones para la translocación de proteínas, la acción de antibióticos y la rampa de traducción.
Este estudio determina la estructura de cryo-EM de la transceptor CbrA de *Pseudomonas*, revelando cómo se une la histidina y cómo el péptido CbrX forma un complejo estable con el dominio transportador, lo que esclarece los mecanismos moleculares que acoplan el transporte de nutrientes con la señalización celular.