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genomics

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La genómica es el estudio de cómo funcionan y se organizan los genes, revelando los secretos que definen la vida y nuestra salud. En esta categoría, exploramos investigaciones que van desde la estructura del ADN hasta cómo las variaciones genéticas influyen en enfermedades y rasgos, todo explicado para que cualquier persona pueda entenderlo sin necesidad de un doctorado en biología.

En Gist.Science, nos dedicamos a procesar cada nuevo preimpreso publicado en bioRxiv dentro de este campo. Nuestro equipo transforma estos documentos académicos complejos en resúmenes técnicos detallados y explicaciones sencillas en lenguaje cotidiano, garantizando que la ciencia más reciente sea accesible para todos.

A continuación, encontrará los últimos estudios en genómica recién llegados desde bioRxiv, listos para ser descubiertos y comprendidos.

🧬 genómica

Allele-specific chromatin modifications of HPV-associated extrachromosomal DNAs in cervical cancer

Este estudio revela que los ADN extracromosómicos híbridos entre VPH y humano en el cáncer cervical exhiben paisajes epigenéticos distintos y de alelo-específicos con densidades más altas de elementos reguladores activos en comparación con los ecDNAs puramente humanos, destacando cómo la integración del VPH moldea la arquitectura regulatoria de estas estructuras circulares que impulsan el cáncer.

MacLennan, S., Ng, M., Porter, V. L., Corbett, R. D., Pandoh, P., Trinh-Hamilton, D., Coope, R., Zhao, Y., Marra, M. A.2026-07-20
🧬 genómica

Lifestyles of Gypsy-family transposons shape their regulatory mechanisms

Al analizar secuencias de retrotransposones LTR a través de 249 genomas de drosófilos, este estudio revela complejos patrones evolutivos entre especies de elementos de la familia Gypsy, destacando cómo la pérdida o inactivación de la proteína Envelope y la estabilidad de sORF2 impulsan cambios en la expresión específica de tejidos y la coevolución con los mecanismos de control transcripcional del huésped.

Papameletiou, A.-M., Czech Nicholson, B., Bornelöv, S., Hannon, G. J.2026-07-18
🧬 genómica

The genetic architecture of human programmed stop codon readthrough

Este estudio utiliza el escaneo de mutaciones profundas para mapear exhaustivamente los determinantes de secuencia del error de lectura de codones de parada programados en humanos, revelando que, si bien un motivo central CUAG y los nucleótidos flanqueantes inmediatos están conservados, la eficiencia de la lectura errónea está gobernada por arquitecturas dependientes del contexto y específicas de cada gen que involucran extensas interacciones aguas arriba y aguas abajo que definen picos de aptitud locales distintos para cada gen objetivo.

Toledano, I., Supek, F., Lehner, B.2026-07-16
🧬 genómica

Gene model for the ortholog of DENR in Drosophila grimshawi

Este artículo presenta el modelo génico para el ortólogo de la proteína reguladora de la densidad (DENR) en *Drosophila grimshawi*, el cual fue anotado utilizando el protocolo de la Genomics Education Partnership para apoyar estudios evolutivos de la vía de señalización de la insulina/factor de crecimiento similar a la insulina a través del género *Drosophila*.

Lawson, M. E., Sanow, K. A., Fratian, M., Matura, M., Burton, I., Rele, C. P., Thompson, J. S., Tin Chi Chak, S., O'Rour (…)2026-07-16
🧬 genómica

Taxonomic Resolution of 16S rRNA, FastANI, Mash, and FastAAI across 30,495 Prokaryotic Type-Strain Genomes

Este estudio evalúa comparativamente 16S rRNA, FastANI, Mash y FastAAI a través de 30,495 genomas de cepas tipo procariotas para demostrar que, si bien cada método posee fortalezas y limitaciones distintivas en los distintos rangos taxonómicos, funcionan mejor como herramientas complementarias dentro de un marco consciente del rango en lugar de como soluciones independientes.

Ussery, D., Bukharid, M. Z., Majumder, R., Borin, V. A., Alisoltani, A.2026-07-16
🧬 genómica

Large-scale automated detection reveals pervasive sex imbalance in biomedical research

Este estudio introduce un marco computacional multimodal que analiza cientos de miles de muestras de transcriptoma para revelar un sesgo masculino generalizado y biológicamente injustificado en numerosas áreas de enfermedades, resaltando brechas críticas en la investigación biomédica específica para mujeres.

Valtadoros, L. E., Hicks, P., Yuan, H., Ahmadian, M., Johnson, K. A., Krishnan, A.2026-07-14
🧬 genómica

Compartment-dependent selection regimes maintain the G-quadruplex paradox across the eukaryotic kingdoms

Al analizar 198 genomas eucariotas, este estudio revela que la "paradoja de los G4" se mantiene a través de regímenes de selección dependientes de compartimentos donde la adaptación de codones suprime los G-cuádruplex en las secuencias codificantes, mientras que la selección estructural directa los preserva en regiones reguladoras como intrones y promotores.

Tanigawa, M., Iwaki, T.2026-07-13
🧬 genómica

A near-complete genome assembly of the Fusarium oxysporum keratitis isolate MRL8996

Este estudio presenta un ensamblaje genómico de alta calidad y casi completo del aislado de *Fusarium oxysporum* MRL8996, asociado a la queratitis por lentes de contacto, resuelto en 16 cromosomas mediante un enfoque híbrido de Nanopore y Hi-C, proporcionando un recurso crítico para investigar las variaciones estructurales y los mecanismos evolutivos que subyacen a su patogenicidad.

Doddi, A., Puebla-Planas, G., Lopez-Berges, M. S., Di Pietro, A.2026-07-11
🧬 genómica

First-Trimester Non-Invasive Prediction of Preterm Birth Using Cell-Free DNA Fragmentomics

Este estudio demuestra que un clasificador de aprendizaje automático que analiza los perfiles de motivos de extremos de 4-meros del ADN libre de células de muestras rutinarias de NIPT del primer trimestre puede predecir con precisión el parto prematuro espontáneo con alta sensibilidad y especificidad, ofreciendo un método no invasivo para identificar embarazos en riesgo sin pruebas adicionales.

Pham, M.-D. N., Phan, M.-T. T., Tran, N.-T., Vo, T.-S., Le, H.-T., Nguyen, T.-H. T., Nguyen, Q.-H. V., Ha, M.-T. T., Le (…)2026-07-11