🧬 biology

A Collaborative Framework for Coordinated Analysis Developed by the Genetics of DNA Methylation Consortium

El Consorcio de la Genética de la Metilación del ADN (GoDMC) ha desarrollado un marco de software ampliado y de base comunitaria que estandariza el procesamiento a nivel de cohorte y permite análisis reproducibles basados en estadísticas de resumen que integran la metilación del ADN y la variación genética.

Josine Min, Carlos Ruiz-Arenas, Olalekan Monsir Awoniran, Olivia Castellini-Pérez, Thomas Hendrik Jonkman, Natalia Llong (…)2026-07-09
🧬 biology

A Hybrid Machine Learning Approach Integrating Gradient Boosting and Attention Mechanisms to Predict VBNC Bacterial Resuscitation

Este estudio presenta un novedoso marco de aprendizaje automático híbrido que combina LightGBM y mecanismos de atención basados en PyTorch para predecir con precisión la resucitación bacteriana de estado VBNC, logrando un rendimiento superior sobre los métodos tradicionales e identificando la concentración de nutrientes y la señalización de cAMP como determinantes clave para la recuperación.

Zulman Arif2026-07-09
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Predictive single cell foundation model for gene regulation and aging with privacy-preserving tabular learning

El artículo presenta Tabula, un modelo fundacional de célula única que preserva la privacidad y aprovecha el aprendizaje federado para capturar explícitamente la estructura tabular de los datos genómicos, permitiendo el descubrimiento de la lógica regulatoria y la identificación de factores de rejuvenecimiento sin compartir datos brutos entre instituciones.

Xiaojie Qiu, Jiayuan Ding, Jianhui Lin, Ziyang Miao, Nils Mechtel, Shiyu Jiang, Yixin Wang, Zhaoyu Fang, Jorge Martin-Ru (…)2026-07-09
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A cross-national network for environmental DNA monitoring of nearshore fish biodiversity across the Northeast Pacific

Este artículo presenta el Observatorio Costero de eDNA del Pacífico, una red transnacional que abarca 16 nodos desde San Diego hasta Juneau que utilizó 1.041 muestras de agua de mar durante cuatro años para generar un conjunto de datos exhaustivo y validado de la biodiversidad de peces costeros en todo el Pacífico Noreste, demostrando la efectividad del monitoreo coordinado de eDNA para la inferencia comparativa a gran escala.

Jennifer M. Sunday, Kate Sheridan, Margot Hessing-Lewis, Rute B. G. Clemente-Carvalho, Salvador Babinet, Jennifer L. Rue (…)2026-07-09
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Large-Scale Reproduction of Alzheimer Research on aCommon Dataset Reveals an Information Ceiling on theField’s Evidence

Al aplicar un novedoso marco mediado por IA (AHA) para reproducir y auditar miles de estudios sobre la enfermedad de Alzheimer en un conjunto de datos común, los autores demuestran que, si bien el rendimiento predictivo reportado por el campo puede replicarse a escala, los datos disponibles son fundamentalmente insuficientes en información para distinguir entre hipótesis competidoras, revelando un techo en la evidencia que explica las trayectorias de investigación divergentes del campo.

M. Antony Ewing2026-07-09
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Behavioral, neurobiological, and physiological effects of music exposure in murine models: A systematic review

Esta revisión sistemática de 65 estudios murinos concluye que la exposición a la música mejora significativamente los resultados conductuales, neurobiológicos y fisiológicos en ratas, aunque la heterogeneidad metodológica requiere de una investigación estandarizada adicional para esclarecer los mecanismos y confirmar el potencial traslacional para los humanos.

Nour El Zahraa Mallah, Laura Navarro, Tomás Sobrino, Alberto Ouro, Federico Martinón-Torres, Alberto Gómez-Carballa, Ant (…)2026-07-09
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Structural Insights into Specific Recognition of mononucleosome by the catalytic domain of Human KMT5A

Este estudio presenta tres estructuras de criomicroscopía electrónica (cryo-EM) de alta resolución del dominio catalítico de SET8 humano unido a nucleosomas, revelando cómo el anclaje específico mediado por arginina al parche ácido y las transiciones conformacionales dinámicas facilitan el reconocimiento y la monometilación de la lisina 20 de la histona H4.

Jingjun Hong2026-07-09✓ Author reviewed
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The PRIDE Affinity-Proteomics Archive (PRIDE-AP): Making Affinity Proteomics Data FAIR

El artículo presenta PRIDE-AP, un nuevo repositorio de datos abiertos, conforme a los principios FAIR, dentro de la infraestructura PRIDE que aborda la falta de un archivo dedicado para la proteómica de afinidad de alto rendimiento al permitir la presentación estandarizada, la validación y la integración de conjuntos de datos entre diversas tecnologías para acelerar el descubrimiento de biomarcadores.

Deepti J. Kundu, Asier Larrea-Sebal, Selvakumar Kamatchinathan, Chakradhar Bandla, Nithu Sara John, Nandana Madhusoodana (…)2026-07-09
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Learning epidemics: a compartmental and network approach to how artificial intelligence literacy spreads inside organizations

Este artículo replantea la propagación de la alfabetización en inteligencia artificial dentro de las organizaciones como un proceso de contagio, demostrando mediante la epidemiología de redes y el aprendizaje automático que la retención del aprendizaje es impulsada primordialmente por las propiedades de la red de comunicación estructural y la posición de un individuo dentro de ellas, más que solo por atributos personales.

Onicio Batista Leal Neto, Julia Nicolau, Alexandre Santilli2026-07-09