biochemistry articles | Gist.Science

FLEX: A heparin-binding fusion partner engineered from fibroblast growth factor 1 to enhance protein expression, solubility and purity

Cet article présente FLEX, un nouveau partenaire de fusion compact et stable dérivé du facteur de croissance fibroblastique 1 (FGF1) qui améliore l'expression, la solubilité et la pureté des protéines recombinantes difficiles à produire, tant chez *E. coli* que dans les systèmes d'expression de mammifères, grâce à ses propriétés de stabilisation intrinsèque et à sa forte affinité pour l'héparine.

Mistry, R., Harris, J. A., Byrne, D. P. + 6 more2026-03-18⚗️ biochemistry

Quantification of Phytohormones in Plants - Optimized Extraction, Separation and Detection

Cette étude présente une méthode optimisée pour l'extraction, la séparation par HPLC et la détection par spectrométrie de masse (MRM et HRMS) de 50 phytohormones, afin de surmonter les défis liés à la diversité chimique et aux faibles concentrations de ces composés dans divers tissus végétaux.

Wewer, V., Dyballa-Rukes, N., Metzger, S.2026-03-18⚗️ biochemistry

Mapping Glycan Binding Profiles of the Gut Bacteria using Liquid Glycan Array (LiGA)

Cette étude utilise la technique LiGA pour cartographier les profils de liaison des glycans chez diverses bactéries intestinales, révélant notamment une reconnaissance chiro-sélective croisée qui suggère que les bactéries peuvent adhérer à des glycans miroirs, offrant ainsi de nouvelles perspectives sur l'écologie microbienne intestinale et les interactions avec des micro-organismes miroirs.

Yadav, P., Peng, C., Sojitra, M. + 3 more2026-03-18⚗️ biochemistry

HERCULES: an integrative deep-learning framework for predicting RNA-binding propensity and mutation effects at single-residue resolution

Le cadre d'apprentissage profond HERCULES intègre un modèle de langage protéique et des descripteurs physicochimiques pour prédire simultanément la localisation des domaines de liaison à l'ARN et évaluer l'impact des mutations au niveau d'un seul résidu avec une précision supérieure aux méthodes existantes.

Fiorentino, J., Monti, M., Armaos, A. + 3 more2026-03-18⚗️ biochemistry

An epigenetic bifunctional that toggles between transactivation and repression

Cette étude présente un bifonctionnel épigénétique capable de basculer entre l'activation et la répression transcriptionnelles selon le contexte cellulaire, en induisant à la fois une transactivation ultra-puissante et la dégradation de protéines de fusion oncogéniques via des mécanismes multiples.

Sadagopan, A., Carson, M., Zamurs, E. J. + 11 more2026-03-18⚗️ biochemistry

UFMylation of Pyruvate Dehydrogenase Regulates Mitochondrial Metabolism

Cette étude révèle que l'UFMylation de la sous-unité DLAT du complexe pyruvate déshydrogénase, régulée par la dé-UFMylase UFSP2, active l'oxydation du pyruvate et stimule le métabolisme mitochondrial.

Nguyen, P. T., Wu, Z., Kim, D. + 16 more2026-03-18⚗️ biochemistry

Potential of Korean Forest Tree Seed Extracts as Multifunctional Bioresources: Evaluation of Antioxidant, Anti-inflammatory, Whitening, and Anticancer Activities

Cette étude démontre le potentiel multifonctionnel des extraits de graines de sept essences forestières coréennes comme bioressources durables, en révélant des profils d'activité antioxydante, anti-inflammatoire, antitumorale et inhibitrice de la tyrosinase spécifiques à chaque espèce.

Lee, H., Park, K., Jang, B.-K. + 2 more2026-03-17⚗️ biochemistry

Functional impact of PCSK9 variants on LDL uptake in a knockout hepatic model

En utilisant un modèle de cellules hépatiques HepG2 invalidées pour PCSK9, cette étude établit un cadre rigoureux pour classer fonctionnellement diverses variants de PCSK9, révélant une hétérogénéité marquée allant de la perte à la gain de fonction et offrant ainsi des perspectives pour des stratégies de réduction du cholestérol LDL plus précises.

Li, H., Liu, H., Xu, W. + 7 more2026-03-17⚗️ biochemistry

Modulating radical propagation in proteins by proton-coupled electron transfer and hydrogen bonding

Cette étude démontre que la modulation des liaisons hydrogène et du transfert couplé d'électrons et de protons permet de réguler la propagation des radicaux et les potentiels d'oxydation dans les protéines, offrant ainsi des stratégies pour la gestion de la charge dans les systèmes biologiques et moléculaires.

Zawistowski, R. K., Chauvire, T., Manna, S. + 2 more2026-03-17⚗️ biochemistry

Characterization of human Metaxin proteins reveals functional diversification of SAM37 homologs MTX1 and MTX3

Cette étude démontre que les protéines humaines MTX1 et MTX3, bien que homologues, possèdent des fonctions distinctes et non redondantes dans la biogenèse des protéines mitochondriales, avec des phénotypes spécifiques liés à leur perte respective et une stabilité dépendante de MTX2.

Morf, S. E. J., Challis, M. P., Uthishtran, S. + 7 more2026-03-17⚗️ biochemistry

Indazolone-Based Molecular Glue Degraders as a Tunable Platform for Reprogramming Cereblon Substrate Specificity

Cette étude présente une nouvelle plateforme de dégradateurs moléculaires à base d'indazolone qui, en surpassant les scaffolds canoniques, permet un contrôle précis de la spécificité des substrats du cereblon pour cibler des protéines auparavant indruggables dans le traitement des cancers hématologiques et solides.

Nie, H.-J., Wang, J., Xu, H. + 10 more2026-03-17⚗️ biochemistry

Effects of Gallic Acid on Antioxidant Defense System and Nrf2 Signaling in Mice with Benzene-Induced Toxicity: In Vivo, In Vitro, and Computational Study

Cette étude démontre que l'acide gallique protège les souris contre la toxicité induite par le benzène en restaurant les défenses antioxydantes et l'hématopoïèse, et en activant potentiellement la voie de signalisation Nrf2 via une interaction directe avec la protéine Keap1.

Olatoye, T. I., Afolabi, B. A., Ogundipe, M. O.2026-03-16⚗️ biochemistry

Age-based approach to characterize the dynamics of cellular processes

Cet article présente un cadre analytique rigoureux et un logiciel open-source basés sur la notion d'« âge métabolique » pour interpréter les expériences de marquage dynamique et quantifier avec précision les paramètres de renouvellement des molécules cellulaires, comme démontré par l'étude de la stabilité des protéines chez la levure.

Noor, E., Jefimov, K., Bifulco, E. + 1 more2026-03-16⚗️ biochemistry

Selective suppression and biasing of chemokine receptors CCR9 and ACKR4 through targeting CCL25 with de novo miniproteins

Cette étude démontre que la conception de miniprotéines *de novo* ciblant la chimiokine CCL25 permet de moduler sélectivement les récepteurs CCR9 et ACKR4, en inhibant la migration cellulaire ou en induisant un biais de signalisation vers les protéines G, offrant ainsi de nouvelles stratégies thérapeutiques pour les maladies inflammatoires.

de Boer, B., Lamme, T. D., Verdwaald, K. + 6 more2026-03-16⚗️ biochemistry

Development of difluoro-Kdn mechanism-based probes to label and visualize Kdnases in Aspergillus fumigatus

Cette étude présente le développement de sondes mécanistiques difluorées-Kdn fonctionnalisées pour le marquage sélectif et la visualisation des Kdnases actives chez le pathogène fongique Aspergillus fumigatus, offrant ainsi de nouveaux outils pour élucider leur rôle dans l'intégrité de la paroi cellulaire et la virulence.

Alvarado Melendez, E., van Neer, J., de Cock, H. + 1 more2026-03-16⚗️ biochemistry

FLASH Radiotherapy is faster than a heartbeat: A compartmental model to illustrate the interplay between tissue oxygen perfusion and ultra-high dose rate effects.

Cette étude propose un modèle compartimental reliant la dynamique de l'oxygène à l'effet FLASH, démontrant que les variations temporelles de la perfusion et de la tension en oxygène influencent la peroxydation lipidique et pourraient expliquer la variabilité de l'effet FLASH selon les tissus.

Ballesteros-Zebadua, P., Jansen, J., Grilij, V. + 3 more2026-03-16⚗️ biochemistry

Towards a comprehensive chemical and genetic tool library for rhamnogalacturonan-II oligosaccharides and exploitation

Cette étude développe une bibliothèque complète d'outils génétiques et chimiques pour produire des oligosaccharides dérivés du rhamnogalacturonane-II (RG-II), permettant de surmonter les défis liés à sa complexité structurelle et d'élucider son métabolisme chez les microbes du microbiote humain et végétal.

Ndeh, D., Nepogodiev, S., Marcias-Garbett, R. + 13 more2026-03-16⚗️ biochemistry

Structural Basis of Membrane Potential Coupled Vectorial CO2 Hydration by the DAB2 Complex in Chemolithoautotrophs

Cette étude révèle la première structure cryo-EM du complexe DAB2 chez *Halothiobacillus neapolitanus*, démontrant qu'il s'agit d'une nouvelle famille d'anhydrases carboniques vectorielles couplées au gradient de protons qui assurent une hydratation directionnelle du CO₂, un mécanisme essentiel pour la concentration du carbone chez les chimiolithotrophes.

Lo, Y. K., Seletskiy, M., Bohn, s. + 4 more2026-03-16⚗️ biochemistry

UFD1 Recognition of Initiator and Proximal Ubiquitin Drives p97-Mediated Substrate Unfolding enhanced by FAF1, FAF2, and UBXD7

Cette étude révèle, grâce à une structure cristallographique à haute résolution et à des analyses guidées par AlphaFold3, comment UFD1 reconnaît spécifiquement les ubiquitines initiatrice et proximale pour initier le dépliement des substrats par p97, un processus renforcé par des adaptateurs accessoires tels que FAF1, FAF2 et UBXD7 via des mécanismes distincts.

Sato, Y., Miyauchi, S., Hirano, A. + 9 more2026-03-16⚗️ biochemistry

Perturbations in fumarate levels in Plasmodium berghei leads to cysteine succination and impairs ookinete formation

L'accumulation de fumarate chez *Plasmodium berghei*, résultant de la perturbation de son métabolisme, entraîne la succination de la cystéine et un stress oxydatif qui bloquent spécifiquement la formation des ookinètes, révélant ainsi une cible potentielle pour des agents bloquant la transmission du parasite.

Chandrashekarmath, A., Suryavanshi, A., Roy, C. S. + 1 more2026-03-16⚗️ biochemistry

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