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Cet article présente une méthode de protéomique 35-plex utilisant le mode haute résolution multi-passages de l'analyseur Astral pour permettre une quantification précise des ions rapporteurs TMT avec une profondeur d'analyse supérieure aux méthodes Orbitrap standard.
Cette étude fournit une preuve expérimentale directe que la robustesse mutatoire ne varie pas de manière significative lorsque le code génétique est modifié dans une plage de coûts de remplacement d'acides aminés couvrant jusqu'à 50 % des possibilités théoriques, suggérant ainsi que le code génétique standard n'est pas nécessairement optimal pour minimiser les effets des mutations dans cette gamme.
Les auteurs contredisent les conclusions de Kim et al. en démontrant, grâce à l'électrochimie sur film protéique, que les mutants A559W et A559W/V610H de la CO déshydrogénase ne présentent pas une résistance accrue à l'oxygène par rapport à la forme sauvage.
Cette étude révèle que la dimérisation de l'enzyme MilM est essentielle à son activité d'hydroxylase dépendante de la PLP, en permettant un mécanisme de « balancier » coordonné entre les deux protomères qui contrôle l'accès au site actif et stabilise le cofacteur pour catalyser l'hydroxylation de la L-arginine lors de la biosynthèse de la mildiomycine.
Cette étude révèle qu'une interface hydrophobe conservée, impliquant des résidus spécifiques des protéines G et des bêta-arrestines, médie la compétition directe pour l'accès au récepteur et constitue un mécanisme universel régulant la désensibilisation des GPCR.
Cette étude combine des expériences et une modélisation computationnelle pour élucider les mécanismes de régulation du transport des substrats, du cycle de Krebs et de la phosphorylation oxydative dans les mitochondries cardiaques, révélant notamment le rôle de la régulation de la pyruvate déshydrogénase et de l'accumulation d'oxaloacétate dans la dynamique énergétique mitochondriale.
Cette étude démontre que la maturation chimique irréversible des complexes calciprotéiques régule leur biodisponibilité en distinguant des monomères capables de minéraliser directement le collagène de particules plus grandes qui nécessitent un traitement lysosomal pour libérer les minéraux, établissant ainsi un nouveau mécanisme de contrôle entre le transport et la minéralisation physiologique.
Cette étude élucide la voie biosynthétique de l'homoharringtonine en identifiant sept intermédiaires et six enzymes clés produisant la céphalotaxinone dans les racines de *Cephalotaxus*, révélant ainsi un modèle de coordination métabolique à l'échelle de la plante entière pour la synthèse de ce médicament anticancéreux.
Cet article décrit la transition d'un laboratoire de la cristallographie aux rayons X vers la cryo-microscopie électronique pour étudier la protéine ATAD2B, en détaillant les défis techniques rencontrés et les stratégies adoptées pour surmonter les obstacles liés à la purification et au traitement des données afin d'offrir des conseils pratiques aux biologistes structuraux.
Cette étude théorique et biologique révèle que la combinaison antagoniste de deux boucles de rétroaction négative intégrales peut générer des modes de contrôle distincts (délégué, isolé ou métastable) et des comportements homéostatiques ou rhéostatiques, illustrés par la régulation du poids chez les hamsters de Sibérie et l'homéostasie de la glycémie.
Cette étude élucide le mécanisme moléculaire par lequel les peptides de pénétration cellulaire (CPP) facilitent l'entrée directe de protéines dans les cellules via la formation de pores d'eau transitoires induits par une hyperpolarisation membranaire locale, offrant ainsi une base pour optimiser les stratégies de délivrance thérapeutique.
Cette étude révèle que la protéine DPY-6, dotée d'un motif unique riche en cystéine facilitant sa dimérisation, agit comme une molécule d'échafaudage essentielle à l'assemblage de la matrice extracellulaire cuticulaire chez les nématodes.
Cette étude présente le développement d'un système électrochimique flexible et intégré aux textiles, composé d'un biocapteur de glucose et d'un potentiostat réalisés sur un circuit en fil de polyimide par écriture laser directe, démontrant des performances stables pour la surveillance continue du glucose dans la sueur artificielle.
Cette étude identifie FAF2 comme un activateur puissant du complexe p97-UFD1-NPL4, révèle son mécanisme d'action structural et propose une stratégie rationnelle pour concevoir de nouveaux activateurs de p97 capables de déplier des substrats ubiquitinylés complexes.
Cette étude révèle par des simulations de dynamique moléculaire que le RY785 inhibe les canaux Kv2 en stabilisant un état semi-ouvert de la porte cytoplasmique via des interactions hydrophobes, un mécanisme distinct de celui du tétraéthylammonium qui bloque le flux ionique en se liant à l'axe du pore.
Cette étude présente un test ELISA à haut débit démontrant que le lumacaftor inhibe sélectivement la fonction du facteur von Willebrand dans des conditions oxydatives inflammatoires, offrant ainsi une approche prometteuse pour développer des antithrombotiques qui ne augmentent pas le risque de saignement.
Cette étude présente la reconstruction et la résurrection expérimentale de rhodopsines ancestrales complètes (schizorhodopsines et héliorhodopsines) grâce à une méthode d'inférence de séquences ancestrales intégrant les insertions et délétions, permettant ainsi d'obtenir des protéines stables et fonctionnelles qui conservent leur architecture membranaire complète.
Cette étude démontre que la recombinaison Xer au site psi du plasmide pSC101 s'accompagne d'une augmentation précise du nombre d'enlacement de +4, convertissant quatre superenroulements négatifs en nœuds de caténation via un mécanisme antiparallèle impliquant une jonction de Holliday.
Cette étude démontre que l'incorporation génétique de tryptophanes azotés, des acides aminés non canoniques peu coûteux et isostères, permet de briser le compromis entre activité et stabilité thermique des enzymes PETases industrielles tout en offrant un nouveau rapporteur fluorescent pour l'analyse cinétique.
En surmontant la cytotoxicité des métalloprotéinases de venin de serpent (SVMP) grâce à l'expression de leurs zymogènes recombinants, cette étude a permis de révéler leurs mécanismes d'auto-activation et d'ouvrir la voie à de nouvelles applications biomédicales et thérapeutiques contre les morsures de serpent.