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La biophysique explore la vie à l'échelle moléculaire en appliquant les lois de la physique pour comprendre comment fonctionnent les cellules, les protéines et l'ADN. Ce domaine fascinant révèle les mécanismes secrets qui régissent nos organismes, du battement d'un cœur au fonctionnement de notre cerveau, en passant par la façon dont les médicaments interagissent avec nos cellules.
Sur Gist.Science, nous sélectionnons rigoureusement chaque nouvelle prépublication de bioRxiv dans cette catégorie pour vous offrir un accès immédiat aux découvertes de pointe. Notre équipe transforme ces travaux complexes en résumés clairs en langage courant, tout en conservant des analyses techniques détaillées pour les chercheurs.
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Les auteurs introduisent la « light Martini water », un modèle d'eau à faible viscosité avec une masse de bille réduite qui accélère considérablement les taux d'échantillonnage dans les simulations de dynamique moléculaire à gros grains de protéines intrinsèquement désordonnées et de bicouches lipidiques tout en préservant les propriétés d'équilibre et l'exactitude des simulations.
Cet article introduit un cadre auto-supervisé qui projette des séquences d'images bruitées dans un vocabulaire discret d'états locaux récurrents et de leurs relations spatio-temporelles sans nécessiter de modèles prédéfinis ou de cibles propres, réussissant ainsi à récupérer des structures interprétables dans des données synthétiques, de référence et biologiques.
Cet article présente une méthodologie synergique qui combine des données de bibliothèques d'ADN codées (DEL) validées expérimentalement avec l'IA générative et des catalogues de composés ultra-larges afin d'étendre rapidement les hits initiaux vers des composés diversifiés, de type médicament et disponibles commercialement, identifiant avec succès de nouveaux inhibiteurs de 53BP1 présentant des propriétés améliorées par rapport à la sélection DEL originale.
Cette étude emploie la modélisation intégrative guidée par la smFRET pour démontrer que la formation, dépendante du Mg2+, d'un contact tertiaire entre une boucle GAAA et un récepteur ARN implique un équilibre hétérogène de sous-populations liées et non liées aux concentrations salines physiologiques, révélant des ensembles conformationnels dynamiques que les structures statiques à haute résolution ne peuvent capturer.
Cet article présente un cadre méthodologique ascendant utilisant la microscopie SlimVar à haute vitesse et des sondes à points quantiques pour mesurer quantitativement le transport moléculaire au sein de modèles minimaux de biofilm définis, établissant un flux de travail modulaire qui surmonte les défis optiques et analytiques du suivi des particules dans les environnements complexes des biofilms natifs.
Cette étude révèle que le domaine intracellulaire de PCDH15 CD2, essentiel à l'audition, est un polyampholyte acide étendu et intrinsèquement désordonné, dont les propriétés biophysiques suggèrent qu'il fonctionne comme un élément structurel sensible à la mécanique qui pourrait contribuer à la transmission et à l'adaptation des forces dans la mécanotransduction auditive.
Cette étude de spectroscopie de force à molécule unique révèle que la protéine au repliement Rossmann2x2 (Ross) atteint sa structure native via une voie stricte et réversible où des unités de repliement coopératives discrètes (foldons) s'assemblent séquentiellement, en commençant par une unité primaire se repliant de manière autonome qui guide l'organisation subséquente d'unités secondaires dépendantes.
Cet article présente la microscopie 2P-RESOLFT, une technique utilisant l'excitation pilotée par deux photons et le commutage photochimique réversible pour obtenir une imagerie de super-résolution de 205 nm en profondeur dans les tissus, révélant avec succès des protrusions membranaires auparavant non observées dans les pseudo-îlots pancréatiques.
Cet article présente l'édition 2026 du Community-Wide Assessment of Heterogeneous Reconstruction Algorithms (CAHRA), un défi conçu pour évaluer les méthodes d'analyse de l'hétérogénéité en cryo-EM à l'aide de trois nouveaux ensembles de données de référence traitant de l'hétérogénéité compositionnelle, de la variabilité conformationnelle continue et de l'enchevêtrement pose-conformation.
Cette étude révèle que la chimie des chaînes acyles (longueur et saturation) dans les membranes lipidiques régule les propriétés biophysiques telles que l'empilement, la fluidité et la charge de surface, gouvernant ainsi les interactions sélectives avec les nanoprobes d'ADN et les coacervats afin de fournir un cadre mécaniste pour l'ingénierie des interfaces membrane-biomolécule.