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La biophysique explore la vie à l'échelle moléculaire en appliquant les lois de la physique pour comprendre comment fonctionnent les cellules, les protéines et l'ADN. Ce domaine fascinant révèle les mécanismes secrets qui régissent nos organismes, du battement d'un cœur au fonctionnement de notre cerveau, en passant par la façon dont les médicaments interagissent avec nos cellules.
Sur Gist.Science, nous sélectionnons rigoureusement chaque nouvelle prépublication de bioRxiv dans cette catégorie pour vous offrir un accès immédiat aux découvertes de pointe. Notre équipe transforme ces travaux complexes en résumés clairs en langage courant, tout en conservant des analyses techniques détaillées pour les chercheurs.
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Cette étude présente une méthode d'imagerie super-résolution par DNA-PAINT permettant de cartographier quantitativement l'organisation nanoscopique des assemblages EGFR-Grb2 dans les cellules, révélant comment la stimulation par l'EGF modifie la densité membranaire d'EGFR et favorise l'accumulation de Grb2 ainsi que la formation d'oligomères EGFR.
Cette étude révèle que l'exon 35, issu de l'épissage alternatif, est un déterminant clé de la sensibilité à la tension membranaire du canal ionique Piezo2, conférant à ses différentes variants des plages dynamiques distinctes adaptées à leurs fonctions physiologiques spécifiques.
Cette étude présente une pipeline expérimentale automatisée et à haut débit qui combine la conception de protéines et la spectroscopie RMN pour caractériser la structure et la dynamique de centaines de protéines de novo, comblant ainsi le fossé entre la prédiction computationnelle et la compréhension expérimentale de la flexibilité conformationnelle.
En combinant la spectroscopie de force à molécule unique et des simulations de dynamique moléculaire, cette étude révèle que la protéine doublement nouée TrmD-Tm1570 nécessite une assistance de chaperon pour son repliement complet, contrairement à ses homologues à nœud simple qui peuvent s'auto-replier grâce à leurs contacts natifs.
En utilisant l'apprentissage automatique guidé par la physique, cette étude révèle que la mécanique non linéaire et viscoélastique du tofu, un solide hydraté minimal, est régie par une relation hautement non linéaire entre sa teneur en eau et ses mécanismes élastiques et inélastiques, offrant ainsi un nouveau modèle universel pour les solides poreux hydratés.
Cet article présente un modèle dynamique multistable couplant une variable endocrine lente et une variable affective rapide, qui démontre comment la perturbation du rythme circadien et les fluctuations stochastiques peuvent favoriser des transitions pathologiques vers des états de dépression ou de manie, offrant ainsi un cadre conceptuel pour comprendre la récurrence des épisodes dans les troubles de l'humeur.
Cette étude présente un protocole de reconstitution de GRASP65 et GRASP55 myristoylés dans des membranes modèles, révélant que ces protéines influencent la dynamique membranaire, potentiellement via leur domaine SPR désordonné.
La fonction des frontières de la chromatine n'est pas régie par la seule occupation de CTCF, mais par un ensemble dynamique de conformations d'ADN modulables qui contrôlent de manière probabiliste la capture de la cohésine.
Ce document présente les avancées méthodologiques de la ligne de lumière LiX au NSLS-II, qui permet désormais de réaliser des expériences de diffraction de haute performance sur des tissus musculaires pour accélérer la recherche sur les protéines sarcomériques et les myopathies.
DynMoCo est un nouveau cadre d'apprentissage profond qui analyse les simulations de dynamique moléculaire en utilisant la détection de communautés sur des graphes évolutifs pour identifier et suivre les sous-structures modulaires et fonctionnelles des protéines.